Амінокислоти: відмінності між версіями

[перевірена версія][неперевірена версія]
Вилучено вміст Додано вміст
Скасування редагування № 18875652 користувача 46.211.2.81 (обговорення)
Рядок 5:
 
== Номенклатура==
Кожна із двадцяти стандартних, і багато нестандартних, амінокислот мають тривіальні назви. Частина цих назв пов'язана із джерелами, з яких вперше було виділено сполуку: наприклад, [[аспарагін]] виділений зі спаржі ({{lang-la|Asparagus}}), [[глутамін]] — з [[глютен]]у пшениці, [[тирозин]] — із сиру (сир грецькою ''tyros''). Для скороченого запису протеїногенні амінокислоти позначають трибуквенним кодом, використовуючи перші три літери тривіальної назви (за винятком аспарагіну (Асн), [[глутамін]]у (Глн), [[ізолейцин]]у (Іле) і [[триптофан]]у (ТрпТруп), для останнього використовують також скорочення Три). Інколи також використовують позначення Asx і Glx, що означають «аспрарагінова кислота або аспарагін» і «глутамінова кислота або глутамін». Існування таких позначень пояснюється тим, що під час [[гідроліз]]у пептидів у лужних або кислих середовищах аспарагін і глутамін дуже легко перетворюються у відповідні кислоти, через що часто неможливо точно визначити, яка саме амінокислота була у складі пептиду без застосування особливих підходів.
 
У час появи [[біоінформатика|біоінформатики]] [[ЕОМ]] використовували [[перфокарта|перфокарти]], через що з'явилась потреба записувати амінокислотні послідовності більш компактно. Для цього [[Маргарет Оуклі Дейгофф]] розробила однобуквенну номенклатуру. Для позначення шести амінокислот використані їх початкові літери (в англійській мові), оскільки вони є унікальними (CHIMSV). Ще у п'яти (AGLPT) перші букви не унікальними, але позначають більш розповсюджені амінокислоти (наприклад, літера L позначає [[лейцин]], оскільки він зустрічається частіше ніж [[лізин]]). Ще для чотирьох використані фонетично навідні літери (RFYW: R — aRginine, F — Fenilalanine, Y — tYrosine, W — tWiptophan), для чотирьох — букви, які є в складі їх назв, або можна там почути (DNEQ: D — asparDic acid, N — asparagiNe, E — glutamEke acid, Q — Q-tamin). Лізин позначають літерою K, оскільки в алфавіті вона найближча до L.