SOHLH1

SOHLH1 (англ. Spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 328 амінокислот, а молекулярна маса — 34 526.

SOHLH1
Ідентифікатори
Символи	SOHLH1, C9orf157, NOHLH, SPATA27, TEB2, bA100C15.3, bHLHe80, spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1, ODG5, SPGF32
Зовнішні ІД	OMIM: 610224 MGI: 2684956 HomoloGene: 45955 GeneCards: SOHLH1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • core promoter sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • protein homodimerization activity • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • Оогенез • transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • Сперматогенез • oocyte differentiation • диференціація клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	402381	227631
Ensembl	ENSG00000165643	ENSMUSG00000059625
UniProt	Q5JUK2	Q6IUP1
RefSeq (мРНК)	NM_001012415 NM_001101677	NM_001001714
RefSeq (білок)	NP_001012415 NP_001095147	NP_001001714
Локус (UCSC)	Хр. 9: 135.69 – 135.7 Mb	Хр. 2: 25.73 – 25.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASRCSEPYP		EVSRIPTVRG		CNGSLSGALS		CCEDSARGSG		PPKAPTVAEG
PSSCLRRNVI		SERERRKRMS		LSCERLRALL		PQFDGRREDM		ASVLEMSVQF
LRLASALGPS		QEQHAILASS		KEMWHSLQED		VLQLTLSSQI		QAGVPDPGTG
ASSGTRTPDV		KAFLESPWSL		DPASASPEPV		PHILASSRQW		DPASCTSLGT
DKCEALLGLC		QVRGGLPPFS		EPSSLVPWPP		GRSLPKAVRP		PLSWPPFSQQ
QTLPVMSGEA		LGWLGQAGPL		AMGAAPLGEP		AKEDPMLAQE		AGSALGSDVD
DGTSFLLTAG		PSSWPGEWGP		GFRAGPPA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Ballow D., Meistrich M.L., Matzuk M., Rajkovic A. (2006). Sohlh1 is essential for spermatogonial differentiation. Dev. Biol. 294: 161—167. PMID 16564520 DOI:10.1016/j.ydbio.2006.02.027
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9