RASEF

RASEF
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2P5S, 2PMY
Ідентифікатори
Символи	RASEF, RAB45, RAS and EF-hand domain containing, TSG
Зовнішні ІД	OMIM: 611344 MGI: 2448565 HomoloGene: 28424 GeneCards: RASEF
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • calcium ion binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0006184 GTPase activity; • GTP binding; • GDP binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • perinuclear region of cytoplasm;
Біологічний процес	• protein homooligomerization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	158158
	242505
	ENSG00000165105
	ENSMUSG00000043003
	Q8IZ41
	Q5RI75
	NM_152573
	NM_001017427
	NP_689786
	NP_001017427; NP_001391890; NP_001391891; NP_001391892
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RASEF (англ. RAS and EF-hand domain containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 740 амінокислот, а молекулярна маса — 82 879^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEADGDGEEL	ARLRSVFAAC	DANRSGRLER	EEFRALCTEL	RVRPADAEAV
FQRLDADRDG	AITFQEFARG	FLGSLRGGRR	RDWGPLDPAP	AVSEAGPETH
DSEEDEGDED	AAAALATSCG	PASPGRAWQD	FQARLGDEAK	FIPREEQVST
LYQNINLVEP	RLIQPYEHVI	KNFIREIRLQ	STEMENLAIA	VKRAQDKAAM
QLSELEEEMD	QRIQAAEHKT	RKDEKRKAEE	ALSDLRRQYE	TEVGDLQVTI
KKLRKLEEQS	KRVSQKEDVA	ALKKQIYDLS	MENQKVKKDL	LEAQTNIAFL
QSELDALKSD	YADQSLNTER	DLEIIRAYTE	DRNSLERQIE	ILQTANRKLH
DSNDGLRSAL	ENSYSKFNRS	LHINNISPGN	TISRSSPKFI	GHSPQPLGYD
RSSRSSYVDE	DCDSLALCDP	LQRTNCEVDS	LPESCFDSGL	STLRDPNEYD
SEVEYKHQRG	FQRSHGVQES	FGGDASDTDV	PDIRDEETFG	LEDVASVLDW
KPQGSVSEGS	IVSSSRKPIS	ALSPQTDLVD	DNAKSFSSQK	AYKIVLAGDA
AVGKSSFLMR	LCKNEFRENI	SATLGVDFQM	KTLIVDGERT	VLQLWDTAGQ
ERFRSIAKSY	FRKADGVLLL	YDVTCEKSFL	NIREWVDMIE	DAAHETVPIM
LVGNKADIRD	TAATEGQKCV	PGHFGEKLAM	TYGALFCETS	AKDGSNIVEA
VLHLAREVKK	RTDKDDSRSI	TNLTGTNSKK	SPQMKNCCNG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном кальцію, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504