RALGPS1

RALGPS1 (англ. Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 557 амінокислот, а молекулярна маса — 62 133.

RALGPS1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3QXL
Ідентифікатори
Символи	RALGPS1, RALGEF2, RALGPS1A, Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1
Зовнішні ІД	OMIM: 614444 MGI: 1922008 HomoloGene: 65163 GeneCards: RALGPS1
Онтологія гена Молекулярна функція • guanyl-nucleotide exchange factor activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинна мембрана • мембрана • компонент клітини Біологічний процес • small GTPase mediated signal transduction • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of Ral protein signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9649	241308
Ensembl	ENSG00000136828	ENSMUSG00000038831
UniProt	Q5JS13	A2AR50
RefSeq (мРНК)	NM_001190728 NM_001190729 NM_001190730 NM_014636 NM_001322320 NM_001322321 NM_001322322 NM_001322323 NM_001322324 NM_001322325 NM_001366399 NM_001366400 NM_001366401	NM_001290570 NM_001290572 NM_175211
RefSeq (білок)	NP_001177657 NP_001177658 NP_001177659 NP_001309249 NP_001309250 NP_001309251 NP_001309252 NP_001309253 NP_001309254 NP_055451 NP_001353328 NP_001353329 NP_001353330	NP_001277499 NP_001277501 NP_780420
Локус (UCSC)	Хр. 9: 126.91 – 127.22 Mb	Хр. 2: 33.13 – 33.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYKRNGLMAS		VLVTSATPQG		SSSSDSLEGQ		SCDYASKSYD		AVVFDVLKVT
PEEFASQITL		MDIPVFKAIQ		PEELASCGWS		KKEKHSLAPN		VVAFTRRFNQ
VSFWVVREIL		TAQTLKIRAE		ILSHFVKIAK		KLLELNNLHS		LMSVVSALQS
APIFRLTKTW		ALLNRKDKTT		FEKLDYLMSK		EDNYKRTREY		IRSLKMVPSI
PYLGIYLLDL		IYIDSAYPAS		GSIMENEQRS		NQMNNILRII		ADLQVSCSYD
HLTTLPHVQK		YLKSVRYIEE		LQKFVEDDNY		KLSLRIEPGS		SSPRLVSSKE
DLAGPSAGSG		SARFSRRPTC		PDTSVAGSLP		TPPVPRHRKS		HSLGNNMMCQ
LSVVESKSAT		FPSEKARHLL		DDSVLESRSP		RRGLALTSSS		AVTNGLSLGS
SESSEFSEEM		SSGLESPTGP		CICSLGNSAA		VPTMEGPLRR		KTLLKEGRKP
ALSSWTRYWV		ILSGSTLLYY		GAKSLRGTDR		KHYKSTPGKK		VSIVGWMVQL
PDDPEHPDIF		QLNNPDKGNV		YKFQTGSRFH		AILWHKHLDD		ACKSNRPQVP
ANLMSFE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

• Rebhun J.F., Chen H., Quilliam L.A. (2000). Identification and characterization of a new family of guanine nucleotide exchange factors for the ras-related GTPase Ral. J. Biol. Chem. 275: 13406—13410. PMID 10747847 DOI:10.1074/jbc.C000085200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9