CACNA1B

CACNA1B (англ. Calcium voltage-gated channel subunit alpha1 B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 339 амінокислот, а молекулярна маса — 262 496.

CACNA1B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LCM
Ідентифікатори
Символи	CACNA1B, BIII, CACNL1A5, CACNN, Cav2.2, DYT23, calcium voltage-gated channel subunit alpha1 B, NEDNEH
Зовнішні ІД	OMIM: 601012 MGI: 88296 HomoloGene: 20184 GeneCards: CACNA1B
Пов'язані генетичні захворювання
dystonia 23
Реагує на сполуку
ziconotide, priralfinamide, Z-160, bepridil hydrochloride monohydrate
Онтологія гена Молекулярна функція • protein C-terminus binding • зв'язування з іоном металу • nucleotide binding • calcium ion binding • voltage-gated calcium channel activity • high voltage-gated calcium channel activity • ion channel activity • ATP binding • voltage-gated ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium channel activity • amyloid-beta binding Клітинна компонента • integral component of membrane • presynapse • мембрана • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • voltage-gated calcium channel complex • клітинна мембрана Біологічний процес • calcium ion transport • chemical synaptic transmission • трансмембранний транспорт • membrane depolarization during action potential • locomotory behavior • regulation of ion transmembrane transport • regulation of blood pressure • regulation of calcium ion transport • ion transport • regulation of heart contraction • calcium ion transmembrane transport • response to pain • membrane depolarization • GO:0010554 neurotransmitter secretion • calcium ion import • modulation of chemical synaptic transmission • response to amyloid-beta Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	774	12287
Ensembl	ENSG00000148408	ENSMUSG00000004113
UniProt	Q00975	O55017
RefSeq (мРНК)	NM_000718 NM_001243812	NM_001042528 NM_007579
RefSeq (білок)	NP_000709 NP_001230741	NP_001035993 NP_031605
Локус (UCSC)	Хр. 9: 137.88 – 138.12 Mb	Хр. 2: 24.49 – 24.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVRFGDELGG		RYGGPGGGER		ARGGGAGGAG		GPGPGGLQPG		QRVLYKQSIA
QRARTMALYN		PIPVKQNCFT		VNRSLFVFSE		DNVVRKYAKR		ITEWPPFEYM
ILATIIANCI		VLALEQHLPD		GDKTPMSERL		DDTEPYFIGI		FCFEAGIKII
ALGFVFHKGS		YLRNGWNVMD		FVVVLTGILA		TAGTDFDLRT		LRAVRVLRPL
KLVSGIPSLQ		VVLKSIMKAM		VPLLQIGLLL		FFAILMFAII		GLEFYMGKFH
KACFPNSTDA		EPVGDFPCGK		EAPARLCEGD		TECREYWPGP		NFGITNFDNI
LFAILTVFQC		ITMEGWTDIL		YNTNDAAGNT		WNWLYFIPLI		IIGSFFMLNL
VLGVLSGEFA		KERERVENRR		AFLKLRRQQQ		IERELNGYLE		WIFKAEEVML
AEEDRNAEEK		SPLDVLKRAA		TKKSRNDLIH		AEEGEDRFAD		LCAVGSPFAR
ASLKSGKTES		SSYFRRKEKM		FRFFIRRMVK		AQSFYWVVLC		VVALNTLCVA
MVHYNQPRRL		TTTLYFAEFV		FLGLFLTEMS		LKMYGLGPRS		YFRSSFNCFD
FGVIVGSVFE		VVWAAIKPGS		SFGISVLRAL		RLLRIFKVTK		YWSSLRNLVV
SLLNSMKSII		SLLFLLFLFI		VVFALLGMQL		FGGQFNFQDE		TPTTNFDTFP
AAILTVFQIL		TGEDWNAVMY		HGIESQGGVS		KGMFSSFYFI		VLTLFGNYTL
LNVFLAIAVD		NLANAQELTK		DEEEMEEAAN		QKLALQKAKE		VAEVSPMSAA
NISIAARQQN		SAKARSVWEQ		RASQLRLQNL		RASCEALYSE		MDPEERLRFA
TTRHLRPDMK		THLDRPLVVE		LGRDGARGPV		GGKARPEAAE		APEGVDPPRR
HHRHRDKDKT		PAAGDQDRAE		APKAESGEPG		AREERPRPHR		SHSKEAAGPP
EARSERGRGP		GPEGGRRHHR		RGSPEEAAER		EPRRHRAHRH		QDPSKECAGA
KGERRARHRG		GPRAGPREAE		SGEEPARRHR		ARHKAQPAHE		AVEKETTEKE
ATEKEAEIVE		ADKEKELRNH		QPREPHCDLE		TSGTVTVGPM		HTLPSTCLQK
VEEQPEDADN		QRNVTRMGSQ		PPDPNTIVHI		PVMLTGPLGE		ATVVPSGNVD
LESQAEGKKE		VEADDVMRSG		PRPIVPYSSM		FCLSPTNLLR		RFCHYIVTMR
YFEVVILVVI		ALSSIALAAE		DPVRTDSPRN		NALKYLDYIF		TGVFTFEMVI
KMIDLGLLLH		PGAYFRDLWN		ILDFIVVSGA		LVAFAFSGSK		GKDINTIKSL
RVLRVLRPLK		TIKRLPKLKA		VFDCVVNSLK		NVLNILIVYM		LFMFIFAVIA
VQLFKGKFFY		CTDESKELER		DCRGQYLDYE		KEEVEAQPRQ		WKKYDFHYDN
VLWALLTLFT		VSTGEGWPMV		LKHSVDATYE		EQGPSPGYRM		ELSIFYVVYF
VVFPFFFVNI		FVALIIITFQ		EQGDKVMSEC		SLEKNERACI		DFAISAKPLT
RYMPQNRQSF		QYKTWTFVVS		PPFEYFIMAM		IALNTVVLMM		KFYDAPYEYE
LMLKCLNIVF		TSMFSMECVL		KIIAFGVLNY		FRDAWNVFDF		VTVLGSITDI
LVTEIAETNN		FINLSFLRLF		RAARLIKLLR		QGYTIRILLW		TFVQSFKALP
YVCLLIAMLF		FIYAIIGMQV		FGNIALDDDT		SINRHNNFRT		FLQALMLLFR
SATGEAWHEI		MLSCLSNQAC		DEQANATECG		SDFAYFYFVS		FIFLCSFLML
NLFVAVIMDN		FEYLTRDSSI		LGPHHLDEFI		RVWAEYDPAA		CGRISYNDMF
EMLKHMSPPL		GLGKKCPARV		AYKRLVRMNM		PISNEDMTVH		FTSTLMALIR
TALEIKLAPA		GTKQHQCDAE		LRKEISVVWA		NLPQKTLDLL		VPPHKPDEMT
VGKVYAALMI		FDFYKQNKTT		RDQMQQAPGG		LSQMGPVSLF		HPLKATLEQT
QPAVLRGARV		FLRQKSSTSL		SNGGAIQNQE		SGIKESVSWG		TQRTQDAPHE
ARPPLERGHS		TEIPVGRSGA		LAVDVQMQSI		TRRGPDGEPQ		PGLESQGRAA
SMPRLAAETQ		PVTDASPMKR		SISTLAQRPR		GTHLCSTTPD		RPPPSQASSH
HHHHRCHRRR		DRKQRSLEKG		PSLSADMDGA		PSSAVGPGLP		PGEGPTGCRR
ERERRQERGR		SQERRQPSSS		SSEKQRFYSC		DRFGGREPPK		PKPSLSSHPT
SPTAGQEPGP		HPQGSGSVNG		SPLLSTSGAS		TPGRGGRRQL		PQTPLTPRPS
ITYKTANSSP		IHFAGAQTSL		PAFSPGRLSR		GLSEHNALLQ		RDPLSQPLAP
GSRIGSDPYL		GQRLDSEASV		HALPEDTLTF		EEAVATNSGR		SSRTSYVSSL
TSQSHPLRRV		PNGYHCTLGL		SSGGRARHSY		HHPDQDHWC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

• Kim D.S., Jung H.-H., Park S.-H., Chin H. (1997). Isolation and characterization of the 5'-upstream region of the human N-type calcium channel alpha1B subunit gene. Chromosomal localization and promoter analysis. J. Biol. Chem. 272: 5098—5104. PMID 9030575 DOI:10.1074/jbc.272.8.5098

Див. також

• Хромосома 9