ZNF638

ZNF638 (англ. Zinc finger protein 638) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 978 амінокислот, а молекулярна маса — 220 625.

ZNF638
Ідентифікатори
Символи	ZNF638, NP220, ZFML, Zfp638, zinc finger protein 638
Зовнішні ІД	OMIM: 614349 MGI: 1203484 HomoloGene: 7447 GeneCards: ZNF638
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • DNA binding • zinc ion binding • double-stranded DNA binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear speck • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • Нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27332	18139
Ensembl	ENSG00000075292	ENSMUSG00000030016
UniProt	Q14966	Q61464
RefSeq (мРНК)	NM_001014972 NM_001252612 NM_001252613 NM_014497	NM_001166371 NM_008717 NM_001355284 NM_001355285 NM_001355286
RefSeq (білок)	NP_001014972 NP_001239541 NP_001239542 NP_055312	NP_001159843 NP_032743 NP_001342213 NP_001342214 NP_001342215 NP_001393000 NP_001393001 NP_001393002 NP_001393003 NP_001393004 NP_001393005 NP_001393006 NP_001393007 NP_001393008 NP_001393009 NP_001393010 NP_001393011 NP_001393012 NP_001393013
Локус (UCSC)	Хр. 2: 71.28 – 71.44 Mb	Хр. 6: 83.84 – 83.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRPRFNPRG		DFPLQRPRAP		NPSGMRPPGP		FMRPGSMGLP		RFYPAGRARG
IPHRFAGHES		YQNMGPQRMN		VQVTQHRTDP		RLTKEKLDFH		EAQQKKGKPH
GSRWDDEPHI		SASVAVKQSS		VTQVTEQSPK		VQSRYTKESA		SSILASFGLS
NEDLEELSRY		PDEQLTPENM		PLILRDIRMR		KMGRRLPNLP		SQSRNKETLG
SEAVSSNVID		YGHASKYGYT		EDPLEVRIYD		PEIPTDEVEN		EFQSQQNISA
SVPNPNVICN		SMFPVEDVFR		QMDFPGESSN		NRSFFSVESG		TKMSGLHISG
GQSVLEPIKS		VNQSINQTVS		QTMSQSLIPP		SMNQQPFSSE		LISSVSQQER
IPHEPVINSS		NVHVGSRGSK		KNYQSQADIP		IRSPFGIVKA		SWLPKFSHAD
AQKMKRLPTP		SMMNDYYAAS		PRIFPHLCSL		CNVECSHLKD		WIQHQNTSTH
IESCRQLRQQ		YPDWNPEILP		SRRNEGNRKE		NETPRRRSHS		PSPRRSRRSS
SSHRFRRSRS		PMHYMYRPRS		RSPRICHRFI		SRYRSRSRSR		SPYRIRNPFR
GSPKCFRSVS		PERMSRRSVR		SSDRKKALED		VVQRSGHGTE		FNKQKHLEAA
DKGHSPAQKP		KTSSGTKPSV		KPTSATKSDS		NLGGHSIRCK		SKNLEDDTLS
ECKQVSDKAV		SLQRKLRKEQ		SLHYGSVLLI		TELPEDGCTE		EDVRKLFQPF
GKVNDVLIVP		YRKEAYLEME		FKEAITAIMK		YIETTPLTIK		GKSVKICVPG
KKKAQNKEVK		KKTLESKKVS		ASTLKRDADA		SKAVEIVTST		SAAKTGQAKA
SVAKVNKSTG		KSASSVKSVV		TVAVKGNKAS		IKTAKSGGKK		SLEAKKTGNV
KNKDSNKPVT		IPENSEIKTS		IEVKATENCA		KEAISDAALE		ATENEPLNKE
TEEMCVMLVS		NLPNKGYSVE		EVYDLAKPFG		GLKDILILSS		HKKAYIEINR
KAAESMVKFY		TCFPVLMDGN		QLSISMAPEN		MNIKDEEAIF		ITLVKENDPE
ANIDTIYDRF		VHLDNLPEDG		LQCVLCVGLQ		FGKVDHHVFI		SNRNKAILQL
DSPESAQSMY		SFLKQNPQNI		GDHMLTCSLS		PKIDLPEVQI		EHDPELEKES
PGLKNSPIDE		SEVQTATDSP		SVKPNELEEE		STPSIQTETL		VQQEEPCEEE
AEKATCDSDF		AVETLELETQ		GEEVKEEIPL		VASASVSIEQ		FTENAEECAL
NQQMFNSDLE		KKGAEIINPK		TALLPSDSVF		AEERNLKGIL		EESPSEAEDF
ISGITQTMVE		AVAEVEKNET		VSEILPSTCI		VTLVPGIPTG		DEKTVDKKNI
SEKKGNMDEK		EEKEFNTKET		RMDLQIGTEK		AEKNEGRMDA		EKVEKMAAMK
EKPAENTLFK		AYPNKGVGQA		NKPDETSKTS		ILAVSDVSSS		KPSIKAVIVS
SPKAKATVSK		TENQKSFPKS		VPRDQINAEK		KLSAKEFGLL		KPTSARSGLA
ESSSKFKPTQ		SSLTRGGSGR		ISALQGKLSK		LDYRDITKQS		QETEARPSIM
KRDDSNNKTL		AEQNTKNPKS		TTGRSSKSKE		EPLFPFNLDE		FVTVDEVIEE
VNPSQAKQNP		LKGKRKETLK		NVPFSELNLK		KKKGKTSTPR		GVEGELSFVT
LDEIGEEEDA		AAHLAQALVT		VDEVIDEEEL		NMEEMVKNSN		SLFTLDELID
QDDCISHSEP		KDVTVLSVAE		EQDLLKQERL		VTVDEIGEVE		ELPLNESADI
TFATLNTKGN		EGDTVRDSIG		FISSQVPEDP		STLVTVDEIQ		DDSSDLHLVT
LDEVTEEDED		SLADFNNLKE		ELNFVTVDEV		GEEEDGDNDL		KVELAQSKND
HPTDKKGNRK		KRAVDTKKTK		LESLSQVGPV		NENVMEEDLK		TMIERHLTAK
TPTKRVRIGK		TLPSEKAVVT		EPAKGEEAFQ		MSEVDEESGL		KDSEPERKRK
KTEDSSSGKS		VASDVPEELD		FLVPKAGFFC		PICSLFYSGE		KAMTNHCKST
RHKQNTEKFM		AKQRKEKEQN		EAEERSSR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 2