ZFYVE1

ZFYVE1 (англ. Zinc finger FYVE-type containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 777 амінокислот, а молекулярна маса — 87 176.

ZFYVE1
Ідентифікатори
Символи	ZFYVE1, DFCP1, PPP1R172, SR3, TAFF1, ZNFN2A1, zinc finger FYVE-type containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605471 MGI: 3026685 HomoloGene: 10945 GeneCards: ZFYVE1
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • 1-phosphatidylinositol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding • зв'язування з іоном металу • phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding Клітинна компонента • perinuclear region of cytoplasm • autophagosome • mitochondria-associated endoplasmic reticulum membrane • Golgi stack • комплекс Ґольджі • extrinsic component of omegasome membrane • ендоплазматичний ретикулум • мембрана • phagophore assembly site • omegasome Біологічний процес • negative regulation of phosphatase activity • cellular response to starvation • macroautophagy Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	53349	217695
Ensembl	ENSG00000165861	ENSMUSG00000042628
UniProt	Q9HBF4	Q810J8
RefSeq (мРНК)	NM_001281734 NM_001281735 NM_021260 NM_178441	NM_183154 NM_001359166 NM_001359167 NM_001359168
RefSeq (білок)	NP_001268663 NP_001268664 NP_067083 NP_848535	NP_898977 NP_001346095 NP_001346096 NP_001346097
Локус (UCSC)	Хр. 14: 72.97 – 73.03 Mb	Хр. 12: 83.59 – 83.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAQTSPAEK		GLNPGLMCQE		SYACSGTDEA		IFECDECCSL		QCLRCEEELH
RQERLRNHER		IRLKPGHVPY		CDLCKGLSGH		LPGVRQRAIV		RCQTCKINLC
LECQKRTHSG		GNKRRHPVTV		YNVSNLQESL		EAEEMDEETK		RKKMTEKVVS
FLLVDENEEI		QVTNEEDFIR		KLDCKPDQHL		KVVSIFGNTG		DGKSHTLNHT
FFYGREVFKT		SPTQESCTVG		VWAAYDPVHK		VAVIDTEGLL		GATVNLSQRT
RLLLKVLAIS		DLVIYRTHAD		RLHNDLFKFL		GDASEAYLKH		FTKELKATTA
RCGLDVPLST		LGPAVIIFHE		TVHTQLLGSD		HPSEVPEKLI		QDRFRKLGRF
PEAFSSIHYK		GTRTYNPPTD		FSGLRRALEQ		LLENNTTRSP		RHPGVIFKAL
KALSDRFSGE		IPDDQMAHSS		FFPDEYFTCS		SLCLSCGVGC		KKSMNHGKEG
VPHEAKSRCR		YSHQYDNRVY		TCKACYERGE		EVSVVPKTSA		STDSPWMGLA
KYAWSGYVIE		CPNCGVVYRS		RQYWFGNQDP		VDTVVRTEIV		HVWPGTDGFL
KDNNNAAQRL		LDGMNFMAQS		VSELSLGPTK		AVTSWLTDQI		APAYWRPNSQ
ILSCNKCATS		FKDNDTKHHC		RACGEGFCDS		CSSKTRPVPE		RGWGPAPVRV
CDNCYEARNV		QLAVTEAQVD		DEGGTLIARK		VGEAVQNTLG		AVVTAIDIPL
GLVKDAARPA		YWVPDHEILH		CHNCRKEFSI		KLSKHHCRAC		GQGFCDECSH
DRRAVPSRGW		DHPVRVCFNC		NKKPGDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

• Derubeis A.R., Young M.F., Jia L., Robey P.G., Fisher L.W. (2000). Double FYVE-containing protein 1 (DFCP1): isolation, cloning and characterization of a novel FYVE finger protein from a human bone marrow cDNA library. Gene. 255: 195—203. PMID 11024279 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00303-6
• Cheung P.C.F., Trinkle-Mulcahy L., Cohen P., Lucocq J.M. (2001). Characterization of a novel phosphatidylinositol 3-phosphate-binding protein containing two FYVE fingers in tandem that is targeted to the Golgi. Biochem. J. 355: 113—121. PMID 11256955 DOI:10.1042/0264-6021:3550113
• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tomar D., Singh R., Singh A.K., Pandya C.D., Singh R. (2012). TRIM13 regulates ER stress induced autophagy and clonogenic ability of the cells. Biochim. Biophys. Acta. 1823: 316—326. PMID 22178386 DOI:10.1016/j.bbamcr.2011.11.015

Див. також

• Хромосома 14