ZFAT

ZFAT
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2ELM, 2ELN, 2ELO, 2ELP, 2ELQ, 2ELR, 2ELS, 2ELT, 2ELU, 2ELV, 2RSH, 2RSI, 2RSJ, 2RUT, 2RUU, 2RUV, 2RUW, 2RUX, 2RUY, 2RUZ, 2RV0, 2RV1, 2RV2, 2RV3, 2RV6, 2RV7
Ідентифікатори
Символи	ZFAT, AITD3, ZFAT1, ZNF406, zinc finger and AT-hook domain containing
Зовнішні ІД	OMIM: 610931 MGI: 2681865 HomoloGene: 16829 GeneCards: ZFAT
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • зв'язування з іоном металу; • nucleic acid binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• spongiotrophoblast layer development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • hematopoietic progenitor cell differentiation; • transcription, DNA-templated; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • кровотворення;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	57623
	380993
	ENSG00000066827
	ENSMUSG00000022335
	Q9P243; Q6PJQ2
	Q7TS63
NM_001029939; NM_001167583; NM_001174157; NM_001174158; NM_001289394;
	NM_020863
	NM_001145888; NM_198644
NP_001025110; NP_001161055; NP_001167628; NP_001167629; NP_001276323;
	NP_065914; NP_001167629.1
	NP_001139360; NP_941046; NP_001389968
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ZFAT (англ. Zinc finger and AT-hook domain containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 243 амінокислот, а молекулярна маса — 139 034^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
METRAAENTA	IFMCKCCNLF	SPNQSELLSH	VSEKHMEEGV	NVDEIIIPLR
PLSTPEPPNS	SKTGDEFLVM	KRKRGRPKGS	TKKSSTEEEL	AENIVSPTED
SPLAPEEGNS	LPPSSLECSK	CCRKFSNTRQ	LRKHICIIVL	NLGEEEGEAG
NESDLELEKK	CKEDDREKAS	KRPRSQKTEK	VQKISGKEAR	QLSGAKKPII
SVVLTAHEAI	PGATKIVPVE	AGPPETGATN	SETTSADLVP	RRGYQEYAIQ
QTPYEQPMKS	SRLGPTQLKI	FTCEYCNKVF	KFKHSLQAHL	RIHTNEKPYK
CPQCSYASAI	KANLNVHLRK	HTGEKFACDY	CSFTCLSKGH	LKVHIERVHK
KIKQHCRFCK	KKYSDVKNLI	KHIRDAHDPQ	DKKVKEALDE	LCLMTREGKR
QLLYDCHICE	RKFKNELDRD	RHMLVHGDKW	PFACELCGHG	ATKYQALELH
VRKHPFVYVC	AVCRKKFVSS	IRLRTHIKEV	HGAAQEALVF	TSSINQSFCL
LEPGGDIQQE	ALGDQLQLVE	EEFALQGVNA	LKEEACPGDT	QLEEGRKEPE
APGEMPAPAV	HLASPQAEST	ALPPCELETT	VVSSSDLHSQ	EVVSDDFLLK
NDTSSAEAHA	APEKPPDMQH	RSSVQTQGEV	ITLLLSKAQS	AGSDQESHGA
QSPLGEGQNM	AVLSAGDPDP	SRCLRSNPAE	ASDLLPPVAG	GGDTITHQPD
SCKAAPEHRS	GITAFMKVLN	SLQKKQMNTS	LCERIRKVYG	DLECEYCGKL
FWYQVHFDMH	VRTHTREHLY	YCSQCHYSSI	TKNCLKRHVI	QKHSNILLKC
PTDGCDYSTP	DKYKLQAHLK	VHTALDKRSY	SCPVCEKSFS	EDRLIKSHIK
TNHPEVSMST	ISEVLGRRVQ	LKGLIGKRAM	KCPYCDFYFM	KNGSDLQRHI
WAHEGVKPFK	CSLCEYATRS	KSNLKAHMNR	HSTEKTHLCD	MCGKKFKSKG
TLKSHKLLHT	ADGKQFKCTV	CDYTAAQKPQ	LLRHMEQHVS	FKPFRCAHCH
YSCNISGSLK	RHYNRKHPNE	EYANVGTGEL	AAEVLIQQGG	LKCPVCSFVY
GTKWEFNRHL	KNKHGLKVVE	IDGDPKWETA	TEAPEEPSTQ	YLHITEAEED
VQGTQAAVAA	LQDLRYTSES	GDRLDPTAVN	ILQQIIELGA	ETHDATALAS
VVAMAPGTVT	VVKQVTEEEP	SSNHTVMIQE	TVQQASVELA	EQHHLVVSSD
DVEGIETVTV	YTQGGEASEF	IVYVQEAMQP	VEEQAVEQPA	QEL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143

Примітки ред.

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19899 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9P243 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також ред.

Хромосома 8

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19899 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9P243 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]