TPR

TPR (англ. Translocated promoter region, nuclear basket protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 363 амінокислот, а молекулярна маса — 267 293.

TPR
Ідентифікатори
Символи	TPR, translocated promoter region, nuclear basket protein
Зовнішні ІД	OMIM: 189940 MGI: 1922066 HomoloGene: 37753 GeneCards: TPR
Онтологія гена Молекулярна функція • transporter activity • tubulin binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • heat shock protein binding • mRNA binding • protein homodimerization activity • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • dynein complex binding • protein-membrane adaptor activity • mitogen-activated protein kinase binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • Ядерна мембрана • nuclear envelope • nuclear periphery • мембрана • Цитоскелет • клітинне ядро • кінетохор • nuclear inclusion body • центромера • Веретено поділу • Нуклеоплазма • хромосома • mitotic spindle • extrinsic component of membrane • Ядерна пора • cytoplasmic dynein complex • nuclear pore nuclear basket • host cell Біологічний процес • positive regulation of mitotic cell cycle spindle assembly checkpoint • nuclear pore complex assembly • protein import into nucleus • RNA export from nucleus • клітинний цикл • mRNA transport • regulation of protein stability • regulation of protein export from nucleus • viral transcription • RNA import into nucleus • protein sumoylation • positive regulation of protein export from nucleus • mitotic nuclear membrane disassembly • protein export from nucleus • regulation of protein import into nucleus • protein transport • positive regulation of protein import into nucleus • GO:0022415 viral process • negative regulation of RNA export from nucleus • nuclear pore organization • mRNA export from nucleus in response to heat stress • positive regulation of intracellular protein transport • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of mitotic sister chromatid separation • mitotic spindle assembly checkpoint signaling • response to epidermal growth factor • cellular response to interferon-alpha • negative regulation of translational initiation • regulation of mRNA export from nucleus • positive regulation of heterochromatin assembly • regulation of mitotic spindle assembly • поділ клітини • regulation of cellular response to heat • nuclear matrix organization • GO:0046795 intracellular transport of virus • mRNA export from nucleus • tRNA export from nucleus • cellular response to heat • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт • regulation of protein localization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7175	108989
Ensembl	ENSG00000047410	ENSMUSG00000006005
UniProt	P12270 Q5SWX9	F6ZDS4
RefSeq (мРНК)	NM_003292	NM_133780
RefSeq (білок)	NP_003283	NP_598541
Локус (UCSC)	Хр. 1: 186.31 – 186.38 Mb	Хр. 1: 150.27 – 150.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAVLQQVLE		RTELNKLPKS		VQNKLEKFLA		DQQSEIDGLK		GRHEKFKVES
EQQYFEIEKR		LSHSQERLVN		ETRECQSLRL		ELEKLNNQLK		ALTEKNKELE
IAQDRNIAIQ		SQFTRTKEEL		EAEKRDLIRT		NERLSQELEY		LTEDVKRLNE
KLKESNTTKG		ELQLKLDELQ		ASDVSVKYRE		KRLEQEKELL		HSQNTWLNTE
LKTKTDELLA		LGREKGNEIL		ELKCNLENKK		EEVSRLEEQM		NGLKTSNEHL
QKHVEDLLTK		LKEAKEQQAS		MEEKFHNELN		AHIKLSNLYK		SAADDSEAKS
NELTRAVEEL		HKLLKEAGEA		NKAIQDHLLE		VEQSKDQMEK		EMLEKIGRLE
KELENANDLL		SATKRKGAIL		SEEELAAMSP		TAAAVAKIVK		PGMKLTELYN
AYVETQDQLL		LEKLENKRIN		KYLDEIVKEV		EAKAPILKRQ		REEYERAQKA
VASLSVKLEQ		AMKEIQRLQE		DTDKANKQSS		VLERDNRRME		IQVKDLSQQI
RVLLMELEEA		RGNHVIRDEE		VSSADISSSS		EVISQHLVSY		RNIEELQQQN
QRLLVALREL		GETREREEQE		TTSSKITELQ		LKLESALTEL		EQLRKSRQHQ
MQLVDSIVRQ		RDMYRILLSQ		TTGVAIPLHA		SSLDDVSLAS		TPKRPSTSQT
VSTPAPVPVI		ESTEAIEAKA		ALKQLQEIFE		NYKKEKAENE		KIQNEQLEKL
QEQVTDLRSQ		NTKISTQLDF		ASKRYEMLQD		NVEGYRREIT		SLHERNQKLT
ATTQKQEQII		NTMTQDLRGA		NEKLAVAEVR		AENLKKEKEM		LKLSEVRLSQ
QRESLLAEQR		GQNLLLTNLQ		TIQGILERSE		TETKQRLSSQ		IEKLEHEISH
LKKKLENEVE		QRHTLTRNLD		VQLLDTKRQL		DTETNLHLNT		KELLKNAQKE
IATLKQHLSN		MEVQVASQSS		QRTGKGQPSN		KEDVDDLVSQ		LRQTEEQVND
LKERLKTSTS		NVEQYQAMVT		SLEESLNKEK		QVTEEVRKNI		EVRLKESAEF
QTQLEKKLME		VEKEKQELQD		DKRRAIESME		QQLSELKKTL		SSVQNEVQEA
LQRASTALSN		EQQARRDCQE		QAKIAVEAQN		KYERELMLHA		ADVEALQAAK
EQVSKMASVR		QHLEETTQKA		ESQLLECKAS		WEERERMLKD		EVSKCVCRCE
DLEKQNRLLH		DQIEKLSDKV		VASVKEGVQG		PLNVSLSEEG		KSQEQILEIL
RFIRREKEIA		ETRFEVAQVE		SLRYRQRVEL		LERELQELQD		SLNAEREKVQ
VTAKTMAQHE		ELMKKTETMN		VVMETNKMLR		EEKERLEQDL		QQMQAKVRKL
ELDILPLQEA		NAELSEKSGM		LQAEKKLLEE		DVKRWKARNQ		HLVSQQKDPD
TEEYRKLLSE		KEVHTKRIQQ		LTEEIGRLKA		EIARSNASLT		NNQNLIQSLK
EDLNKVRTEK		ETIQKDLDAK		IIDIQEKVKT		ITQVKKIGRR		YKTQYEELKA
QQDKVMETSA		QSSGDHQEQH		VSVQEMQELK		ETLNQAETKS		KSLESQVENL
QKTLSEKETE		ARNLQEQTVQ		LQSELSRLRQ		DLQDRTTQEE		QLRQQITEKE
EKTRKAIVAA		KSKIAHLAGV		KDQLTKENEE		LKQRNGALDQ		QKDELDVRIT
ALKSQYEGRI		SRLERELREH		QERHLEQRDE		PQEPSNKVPE		QQRQITLKTT
PASGERGIAS		TSDPPTANIK		PTPVVSTPSK		VTAAAMAGNK		STPRASIRPM
VTPATVTNPT		TTPTATVMPT		TQVESQEAMQ		SEGPVEHVPV		FGSTSGSVRS
TSPNVQPSIS		QPILTVQQQT		QATAFVQPTQ		QSHPQIEPAN		QELSSNIVEV
VQSSPVERPS		TSTAVFGTVS		ATPSSSLPKR		TREEEEDSTI		EASDQVSDDT
VEMPLPKKLK		SVTPVGTEEE		VMAEESTDGE		VETQVYNQDS		QDSIGEGVTQ
GDYTPMEDSE		ETSQSLQIDL		GPLQSDQQTT		TSSQDGQGKG		DDVIVIDSDD
EEEDDDENDG		EHEDYEEDEE		DDDDDEDDTG		MGDEGEDSNE		GTGSADGNDG
YEADDAEGGD		GTDPGTETEE		SMGGGEGNHR		AADSQNSGEG		NTGAAESSFS
QEVSREQQPS		SASERQAPRA		PQSPRRPPHP		LPPRLTIHAP		PQELGPPVQR
IQMTRRQSVG		RGLQLTPGIG		GMQQHFFDDE		DRTVPSTPTL		VVPHRTDGFA
EAIHSPQVAG		VPRFRFGPPE		DMPQTSSSHS		DLGQLASQGG		LGMYETPLFL
AHEEESGGRS		VPTTPLQVAA		PVTVFTESTT		SDASEHASQS		VPMVTTSTGT
LSTTNETATG		DDGDEVFVEA		ESEGISSEAG		LEIDSQQEEE		PVQASDESDL
PSTSQDPPSS		SSVDTSSSQP		KPFRRVRLQT		TLRQGVRGRQ		FNRQRGVSHA
MGGRGGINRG		NIN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, транспорт мРНК, транслокація. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, хромосомах, комплексі ядерної пори, центромерах, кінетохорі.

Література

• Cordes V.C., Reidenbach S., Rackwitz H.R., Franke W.W. (1997). Identification of protein p270/Tpr as a constitutive component of the nuclear pore complex-attached intranuclear filaments. J. Cell Biol. 136: 515—529. PMID 9024684 DOI:10.1083/jcb.136.3.515
• Soman N.R., Wogan G.N., Rhim J.S. (1990). TPR-MET oncogenic rearrangement: detection by polymerase chain reaction amplification of the transcript and expression in human tumor cell lines. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 738—742. PMID 2300559 DOI:10.1073/pnas.87.2.738
• Cordes V.C., Hase M.E., Muller L. (1998). Molecular segments of protein Tpr that confer nuclear targeting and association with the nuclear pore complex. Exp. Cell Res. 245: 43—56. PMID 9828100 DOI:10.1006/excr.1998.4246
• Hase M.E., Kuznetsov N.V., Cordes V.C. (2001). Amino acid substitutions of coiled-coil protein Tpr abrogate anchorage to the nuclear pore complex but not parallel, in-register homodimerization. Mol. Biol. Cell. 12: 2433—2452. PMID 11514627 DOI:10.1091/mbc.12.8.2433
• Shibata S., Matsuoka Y., Yoneda Y. (2002). Nucleocytoplasmic transport of proteins and poly(A)+ RNA in reconstituted Tpr-less nuclei in living mammalian cells. Genes Cells. 7: 421—434. PMID 11952838 DOI:10.1046/j.1365-2443.2002.00525.x
• Frosst P., Guan T., Subauste C., Hahn K., Gerace L. (2002). Tpr is localized within the nuclear basket of the pore complex and has a role in nuclear protein export. J. Cell Biol. 156: 617—630. PMID 11839768 DOI:10.1083/jcb.200106046

Див. також

• Хромосома 1