SMAD1

SMAD1 (англ. SMAD family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 52 260.

SMAD1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1KHU, 2LAW, 2LAX, 2LAY, 2LAZ, 2LB0, 2LB1, 3Q47, 3Q4A
Ідентифікатори
Символи	SMAD1, BSP-1, BSP1, JV4-1, JV41, MADH1, MADR1, SMAD family member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601595 MGI: 109452 HomoloGene: 21196 GeneCards: SMAD1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • co-SMAD binding • protein homodimerization activity • I-SMAD binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • protein heterodimerization activity • protein kinase binding • sequence-specific DNA binding • DEAD/H-box RNA helicase binding • primary miRNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • SMAD protein complex • гіалоплазма • transcription regulator complex • внутрішньоклітинний • Нуклеоплазма • nuclear inner membrane • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • GO:0007329 positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in cellular response to chemical stimulus • SMAD protein complex assembly • ureteric bud development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • SMAD protein signal transduction • embryonic pattern specification • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • hindbrain development • cellular response to BMP stimulus • cardiac muscle cell proliferation • BMP signaling pathway • transcription, DNA-templated • MAPK cascade • protein phosphorylation • gamete generation • cartilage development • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of osteoblast differentiation • positive regulation of cartilage development • GO:1990744, GO:1990729 primary miRNA processing • mesodermal cell fate commitment • inflammatory response • bone development • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • midbrain development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cell population proliferation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • osteoblast fate commitment • homeostatic process • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • protein deubiquitination • positive regulation of sprouting angiogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4086	17125
Ensembl	ENSG00000170365	ENSMUSG00000031681
UniProt	Q15797	P70340
RefSeq (мРНК)	NM_001003688 NM_005900	NM_008539
RefSeq (білок)	NP_001003688 NP_005891 NP_001341740 NP_001341741 NP_001341742 NP_001341743 NP_001341745 NP_001341746	NP_032565
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 8: 80.07 – 80.13 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNVTSLFSFT		SPAVKRLLGW		KQGDEEEKWA		EKAVDALVKK		LKKKKGAMEE
LEKALSCPGQ		PSNCVTIPRS		LDGRLQVSHR		KGLPHVIYCR		VWRWPDLQSH
HELKPLECCE		FPFGSKQKEV		CINPYHYKRV		ESPVLPPVLV		PRHSEYNPQH
SLLAQFRNLG		QNEPHMPLNA		TFPDSFQQPN		SHPFPHSPNS		SYPNSPGSSS
STYPHSPTSS		DPGSPFQMPA		DTPPPAYLPP		EDPMTQDGSQ		PMDTNMMAPP
LPSEINRGDV		QAVAYEEPKH		WCSIVYYELN		NRVGEAFHAS		STSVLVDGFT
DPSNNKNRFC		LGLLSNVNRN		STIENTRRHI		GKGVHLYYVG		GEVYAECLSD
SSIFVQSRNC		NYHHGFHPTT		VCKIPSGCSL		KIFNNQEFAQ		LLAQSVNHGF
ETVYELTKMC		TIRMSFVKGW		GAEYHRQDVT		STPCWIEIHL		HGPLQWLDKV
LTQMGSPHNP		ISSVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Lechleider R.J., de Caestecker M.P., Dehejia A., Polymeropoulos M.H., Roberts A.B. (1996). Serine phosphorylation, chromosomal localization, and transforming growth factor-beta signal transduction by human bsp-1. J. Biol. Chem. 271: 17617—17620. PMID 8663601 DOI:10.1074/jbc.271.30.17617
• Zhang Y., Feng X.-H., Wu R.-Y., Derynck R. (1996). Receptor-associated Mad homologues synergize as effectors of the TGF-beta response. Nature. 383: 168—172. PMID 8774881 DOI:10.1038/383168a0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kretzschmar M., Liu F., Hata A., Doody J., Massague J. (1997). The TGF-beta family mediator Smad1 is phosphorylated directly and activated functionally by the BMP receptor kinase. Genes Dev. 11: 984—995. PMID 9136927 DOI:10.1101/gad.11.8.984
• Massague J. (1998). TGF-beta signal transduction. Annu. Rev. Biochem. 67: 753—791. PMID 9759503 DOI:10.1146/annurev.biochem.67.1.753
• Verschueren K., Huylebroeck D. (1999). Remarkable versatility of Smad proteins in the nucleus of transforming growth factor-beta activated cells. Cytokine Growth Factor Rev. 10: 187—199. PMID 10647776 DOI:10.1016/S1359-6101(99)00012-X

Див. також

• Хромосома 4