SIM1

SIM1 (англ. Single-minded family bHLH transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 766 амінокислот, а молекулярна маса — 85 515.

SIM1
Ідентифікатори
Символи	SIM1, bHLHe14, single-minded family bHLH transcription factor 1, SIM bHLH transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603128 MGI: 98306 HomoloGene: 3715 GeneCards: SIM1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • protein dimerization activity • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • multicellular organism development • диференціація клітин • ureteric bud development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6492	20464
Ensembl	ENSG00000112246	ENSMUSG00000019913
UniProt	P81133	Q61045
RefSeq (мРНК)	NM_005068 NM_001374769	NM_011376
RefSeq (білок)	NP_005059 NP_001361698	NP_035506
Локус (UCSC)	Хр. 6: 100.39 – 100.46 Mb	Хр. 10: 50.77 – 50.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKEKSKNAAR		TRREKENSEF		YELAKLLPLP		SAITSQLDKA		SIIRLTTSYL
KMRVVFPEGL		GEAWGHSSRT		SPLDNVGREL		GSHLLQTLDG		FIFVVAPDGK
IMYISETASV		HLGLSQVELT		GNSIYEYIHP		ADHDEMTAVL		TAHQPYHSHF
VQEYEIERSF		FLRMKCVLAK		RNAGLTCGGY		KVIHCSGYLK		IRQYSLDMSP
FDGCYQNVGL		VAVGHSLPPS		AVTEIKLHSN		MFMFRASLDM		KLIFLDSRVA
ELTGYEPQDL		IEKTLYHHVH		GCDTFHLRCA		HHLLLVKGQV		TTKYYRFLAK
HGGWVWVQSY		ATIVHNSRSS		RPHCIVSVNY		VLTDTEYKGL		QLSLDQISAS
KPAFSYTSSS		TPTMTDNRKG		AKSRLSSSKS		KSRTSPYPQY		SGFHTERSES
DHDSQWGGSP		LTDTASPQLL		DPADRPGSQH		DASCAYRQFS		DRSSLCYGFA
LDHSRLVEER		HFHTQACEGG		RCEAGRYFLG		TPQAGREPWW		GSRAALPLTK
ASPESREAYE		NSMPHIASVH		RIHGRGHWDE		DSVVSSPDPG		SASESGDRYR
TEQYQSSPHE		PSKIETLIRA		TQQMIKEEEN		RLQLRKAPSD		QLASINGAGK
KHSLCFANYQ		QPPPTGEVCH		GSALANTSPC		DHIQQREGKM		LSPHENDYDN
SPTALSRISS		PNSDRISKSS		LILAKDYLHS		DISPHQTAGD		HPTVSPNCFG
SHRQYFDKHA		YTLTGYALEH		LYDSETIRNY		SLGCNGSHFD		VTSHLRMQPD
PAQGHKGTSV		IITNGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Yamaki A., Kudoh J., Shimizu N., Shimizu Y. (2004). A novel nuclear localization signal in the human single-minded proteins SIM1 and SIM2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 313: 482—488. PMID 14697214 DOI:10.1016/j.bbrc.2003.11.168

Див. також

• Хромосома 6