SERINC3

SERINC3 (англ. Serine incorporator 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 473 амінокислот, а молекулярна маса — 52 580.

SERINC3
Ідентифікатори
Символи	SERINC3, AIGP1, DIFF33, SBBI99, TDE, TDE1, TMS-1, serine incorporator 3
Зовнішні ІД	OMIM: 607165 MGI: 1349457 HomoloGene: 38230 GeneCards: SERINC3
Онтологія гена Молекулярна функція • L-serine transmembrane transporter activity Клітинна компонента • integral component of membrane • Golgi membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • клітинна мембрана Біологічний процес • phosphatidylserine metabolic process • detection of virus • вроджений імунітет • defense response to virus • positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • sphingolipid metabolic process • L-serine transport • процес імунної системи • L-serine biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10955	26943
Ensembl	ENSG00000132824	ENSMUSG00000017707
UniProt	Q13530	Q9QZI9
RefSeq (мРНК)	NM_198941 NM_006811	NM_012032
RefSeq (білок)	NP_006802 NP_945179	NP_036162
Локус (UCSC)	Хр. 20: 44.5 – 44.52 Mb	Хр. 2: 163.47 – 163.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGAVLGVFSL		ASWVPCLCSG		ASCLLCSCCP		NSKNSTVTRL		IYAFILLLST
VVSYIMQRKE		METYLKKIPG		FCEGGFKIHE		ADINADKDCD		VLVGYKAVYR
ISFAMAIFFF		VFSLLMFKVK		TSKDLRAAVH		NGFWFFKIAA		LIGIMVGSFY
IPGGYFSSVW		FVVGMIGAAL		FILIQLVLLV		DFAHSWNESW		VNRMEEGNPR
LWYAALLSFT		SAFYILSIIC		VGLLYTYYTK		PDGCTENKFF		ISINLILCVV
ASIISIHPKI		QEHQPRSGLL		QSSLITLYTM		YLTWSAMSNE		PDRSCNPNLM
SFITRITAPT		LAPGNSTAVV		PTPTPPSKSG		SLLDSDNFIG		LFVFVLCLLY
SSIRTSTNSQ		VDKLTLSGSD		SVILGDTTTS		GASDEEDGQP		RRAVDNEKEG
VQYSYSLFHL		MLCLASLYIM		MTLTSWYSPD		AKFQSMTSKW		PAVWVKISSS
WVCLLLYVWT		LVAPLVLTSR		DFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.

Література

• Bossolasco M., Lebel M., Lemieux N., Mes-Masson A.-M. (1999). The human TDE gene homologue: localization to 20q13.1-13.3 and variable expression in human tumor cell lines and tissue. Mol. Carcinog. 26: 189—200. PMID 10559794 DOI:10.1002/(SICI)1098-2744(199911)26:3<189::AID-MC8>3.0.CO;2-T
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Usami Y., Wu Y., Goettlinger H.G. (2015). SERINC3 and SERINC5 restrict HIV-1 infectivity and are counteracted by Nef. Nature. 526: 218—223. PMID 26416733 DOI:10.1038/nature15400

Див. також

• Хромосома 20