SCD

SCD
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4ZYO
Ідентифікатори
Символи	SCD, FADS5, MSTP008, SCD1, SCDOS, hSCD1, stearoyl-CoA desaturase (delta-9-desaturase), stearoyl-CoA desaturase
Зовнішні ІД	OMIM: 604031 MGI: 98239 HomoloGene: 74538 GeneCards: SCD
Реагує на сполуку
	CD33
Онтологія гена
Молекулярна функція	• iron ion binding; • stearoyl-CoA 9-desaturase activity; • oxidoreductase activity; • oxidoreductase activity, acting on paired donors, with oxidation of a pair of donors resulting in the reduction of molecular oxygen to two molecules of water; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • palmitoyl-CoA 9-desaturase activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • мембрана; • ядерце; • integral component of endoplasmic reticulum membrane;
Біологічний процес	• unsaturated fatty acid biosynthetic process; • fatty acid biosynthetic process; • fatty acid metabolic process; • lipid metabolism; • regulation of cholesterol biosynthetic process; • fatty-acyl-CoA biosynthetic process; • monounsaturated fatty acid biosynthetic process; • response to fatty acid; • positive regulation of cold-induced thermogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6319
	20249
	ENSG00000099194
	ENSMUSG00000037071
	O00767
	P13516
	NM_005063
	NM_009127
	NP_005054
	NP_033153
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SCD (англ. Stearoyl-CoA desaturase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 41 523^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPAHLLQDDI	SSSYTTTTTI	TAPPSRVLQN	GGDKLETMPL	YLEDDIRPDI
KDDIYDPTYK	DKEGPSPKVE	YVWRNIILMS	LLHLGALYGI	TLIPTCKFYT
WLWGVFYYFV	SALGITAGAH	RLWSHRSYKA	RLPLRLFLII	ANTMAFQNDV
YEWARDHRAH	HKFSETHADP	HNSRRGFFFS	HVGWLLVRKH	PAVKEKGSTL
DLSDLEAEKL	VMFQRRYYKP	GLLMMCFILP	TLVPWYFWGE	TFQNSVFVAT
FLRYAVVLNA	TWLVNSAAHL	FGYRPYDKNI	SPRENILVSL	GAVGEGFHNY
HHSFPYDYSA	SEYRWHINFT	TFFIDCMAAL	GLAYDRKKVS	KAAILARIKR
TGDGNYKSG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, біосинтез жирних кислот, біосинтез ліпідів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література ред.

Zhang L., Ge L., Parimoo S., Stenn K., Prouty S.M. (1999). Human stearoyl-CoA desaturase: alternative transcripts generated from a single gene by usage of tandem polyadenylation sites. Biochem. J. 340: 255—264. PMID 10229681 DOI:10.1042/bj3400255
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang L., Ge L., Tran T., Stenn K., Prouty S.M. (2001). Isolation and characterization of the human stearoyl-CoA desaturase gene promoter: requirement of a conserved CCAAT cis-element. Biochem. J. 357: 183—193. PMID 11415448 DOI:10.1042/0264-6021:3570183
Xu G., Shin S.B., Jaffrey S.R. (2009). Global profiling of protease cleavage sites by chemoselective labeling of protein N-termini. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106: 19310—19315. PMID 19892738 DOI:10.1073/pnas.0908958106
Zhang S., Yang Y., Shi Y. (2005). Characterization of human SCD2, an oligomeric desaturase with improved stability and enzyme activity by cross-linking in intact cells. Biochem. J. 388: 135—142. PMID 15610069 DOI:10.1042/BJ20041554
Goren M.A., Fox B.G. (2008). Wheat germ cell-free translation, purification, and assembly of a functional human stearoyl-CoA desaturase complex. Protein Expr. Purif. 62: 171—178. PMID 18765284 DOI:10.1016/j.pep.2008.08.002