NFYB

NFYB (англ. Nuclear transcription factor Y subunit beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 207 амінокислот, а молекулярна маса — 22 831.

NFYB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1N1J, 4AWL, 4CSR
Ідентифікатори
Символи	NFYB, CBF-A, CBF-B, HAP3, NF-YB, nuclear transcription factor Y subunit beta
Зовнішні ІД	OMIM: 189904 MGI: 97317 HomoloGene: 38149 GeneCards: NFYB
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • protein-DNA complex • Нуклеоплазма • CCAAT-binding factor complex • клітинне ядро • RNA polymerase II transcription regulator complex Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of cholesterol biosynthetic process • cellular response to leukemia inhibitory factor • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4801	18045
Ensembl	ENSG00000120837	ENSMUSG00000020248
UniProt	P25208	P63139
RefSeq (мРНК)	NM_006166	NM_010914
RefSeq (білок)	NP_006157 NP_006157.1	NP_035044
Локус (UCSC)	Хр. 12: 104.12 – 104.14 Mb	Хр. 10: 82.58 – 82.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTMDGDSSTT		DASQLGISAD		YIGGSHYVIQ		PHDDTEDSMN		DHEDTNGSKE
SFREQDIYLP		IANVARIMKN		AIPQTGKIAK		DAKECVQECV		SEFISFITSE
ASERCHQEKR		KTINGEDILF		AMSTLGFDSY		VEPLKLYLQK		FREAMKGEKG
IGGAVTATDG		LSEELTEEAF		TNQLPAGLIT		TDGQQQNVMV		YTTSYQQISG
VQQIQFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chattopadhyay C., Hawke D., Kobayashi R., Maity S.N. (2004). Human p32, interacts with B subunit of the CCAAT-binding factor, CBF/NF-Y, and inhibits CBF-mediated transcription activation in vitro. Nucleic Acids Res. 32: 3632—3641. PMID 15243141 DOI:10.1093/nar/gkh692
• Romier C., Cocchiarella F., Mantovani R., Moras D. (2003). The NF-YB/NF-YC structure gives insight into DNA binding and transcription regulation by CCAAT factor NF-Y. J. Biol. Chem. 278: 1336—1345. PMID 12401788 DOI:10.1074/jbc.M209635200
• Li X.-Y., Hooft van Huijsduijnen R., Mantovani R., Benoist C.O., Mathis D. (1992). Intron-exon organization of the NF-Y genes. Tissue-specific splicing modifies an activation domain. J. Biol. Chem. 267: 8984—8990. PMID 1577736

Див. також

• Хромосома 12