NFIX

NFIX
Ідентифікатори
Символи	NFIX, MRSHSS, NF1A, SOTOS2, nuclear factor I X, NF1-X, NF-I/X, CTF, MALNS
Зовнішні ІД	OMIM: 164005 MGI: 97311 HomoloGene: 1872 GeneCards: NFIX
Пов'язані генетичні захворювання
	Marshall–Smith syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• Реплікація ДНК; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4784
	18032
	ENSG00000008441
	ENSMUSG00000001911
	Q14938
	P70257
NM_001271043; NM_001271044; NM_002501; NM_001365902; NM_001365982;
	NM_001365983; NM_001365984; NM_001365985; NM_001378404; NM_001378405
	NM_001081981; NM_001081982; NM_001297601; NM_010906
NP_001257972; NP_001257973; NP_002492; NP_001352831; NP_001352911;
	NP_001352912; NP_001352913; NP_001352914; NP_001365333; NP_001365334
NP_001075450; NP_001075451; NP_001284530; NP_035036; NP_001357981;
	NP_001357982; NP_001357983; NP_001357984; NP_001357985; NP_001357986; NP_001357987; NP_001357988; NP_001357989; NP_001357990; NP_001357991; NP_001357992
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NFIX (англ. Nuclear factor I X) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 502 амінокислот, а молекулярна маса — 55 098^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYSPYCLTQD	EFHPFIEALL	PHVRAFSYTW	FNLQARKRKY	FKKHEKRMSK
DEERAVKDEL	LGEKPEIKQK	WASRLLAKLR	KDIRPEFRED	FVLTITGKKP
PCCVLSNPDQ	KGKIRRIDCL	RQADKVWRLD	LVMVILFKGI	PLESTDGERL
YKSPQCSNPG	LCVQPHHIGV	TIKELDLYLA	YFVHTPESGQ	SDSSNQQGDA
DIKPLPNGHL	SFQDCFVTSG	VWNVTELVRV	SQTPVATASG	PNFSLADLES
PSYYNINQVT	LGRRSITSPP	STSTTKRPKS	IDDSEMESPV	DDVFYPGTGR
SPAAGSSQSS	GWPNDVDAGP	ASLKKSGKLD	FCSALSSQGS	SPRMAFTHHP
LPVLAGVRPG	SPRATASALH	FPSTSIIQQS	SPYFTHPTIR	YHHHHGQDSL
KEFVQFVCSD	GSGQATGQPN	GSGQGKVPGS	FLLPPPPPVA	RPVPLPMPDS
KSTSTAPDGA	ALTPPSPSFA	TTGASSANRF	VSIGPRDGNF	LNIPQQSQSW
FL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література ред.

Apt D., Liu Y., Bernard H.U. (1994). Cloning and functional analysis of spliced isoforms of human nuclear factor I-X: interference with transcriptional activation by NFI/CTF in a cell-type specific manner. Nucleic Acids Res. 22: 3825—3833. PMID 7937100 DOI:10.1093/nar/22.19.3825
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Qian F., Kruse U., Lichter P., Sippel A.E. (1995). Chromosomal localization of the four genes (NFIA, B, C, and X) for the human transcription factor nuclear factor I by FISH. Genomics. 28: 66—73. PMID 7590749 DOI:10.1006/geno.1995.1107