LSS

LSS (англ. Lanosterol synthase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 732 амінокислот, а молекулярна маса — 83 309.

LSS
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1W6J, 1W6K
Ідентифікатори
Символи	LSS, OSC, CTRCT44, lanosterol synthase (2,3-oxidosqualene-lanosterol cyclase), lanosterol synthase, HYPT14, APMR4
Зовнішні ІД	OMIM: 600909 MGI: 1336155 HomoloGene: 37408 GeneCards: LSS
Онтологія гена Молекулярна функція • isomerase activity • intramolecular transferase activity • lanosterol synthase activity • beta-amyrin synthase activity Клітинна компонента • lipid droplet • endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • мембрана Біологічний процес • regulation of protein stability • lipid metabolism • steroid biosynthetic process • cholesterol biosynthetic process • regulation of cholesterol biosynthetic process • triterpenoid biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4047	16987
Ensembl	ENSG00000160285 ENSG00000281289	ENSMUSG00000033105
UniProt	P48449	Q8BLN5
RefSeq (мРНК)	NM_001001438 NM_001145436 NM_001145437 NM_002340	NM_146006
RefSeq (білок)	NP_001001438 NP_001138908 NP_001138909 NP_002331	NP_666118
Локус (UCSC)	Хр. 21: 46.19 – 46.23 Mb	Хр. 10: 76.37 – 76.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTEGTCLRRR		GGPYKTEPAT		DLGRWRLNCE		RGRQTWTYLQ		DERAGREQTG
LEAYALGLDT		KNYFKDLPKA		HTAFEGALNG		MTFYVGLQAE		DGHWTGDYGG
PLFLLPGLLI		TCHVARIPLP		AGYREEIVRY		LRSVQLPDGG		WGLHIEDKST
VFGTALNYVS		LRILGVGPDD		PDLVRARNIL		HKKGGAVAIP		SWGKFWLAVL
NVYSWEGLNT		LFPEMWLFPD		WAPAHPSTLW		CHCRQVYLPM		SYCYAVRLSA
AEDPLVQSLR		QELYVEDFAS		IDWLAQRNNV		APDELYTPHS		WLLRVVYALL
NLYEHHHSAH		LRQRAVQKLY		EHIVADDRFT		KSISIGPISK		TINMLVRWYV
DGPASTAFQE		HVSRIPDYLW		MGLDGMKMQG		TNGSQIWDTA		FAIQALLEAG
GHHRPEFSSC		LQKAHEFLRL		SQVPDNPPDY		QKYYRQMRKG		GFSFSTLDCG
WIVSDCTAEA		LKAVLLLQEK		CPHVTEHIPR		ERLCDAVAVL		LNMRNPDGGF
ATYETKRGGH		LLELLNPSEV		FGDIMIDYTY		VECTSAVMQA		LKYFHKRFPE
HRAAEIRETL		TQGLEFCRRQ		QRADGSWEGS		WGVCFTYGTW		FGLEAFACMG
QTYRDGTACA		EVSRACDFLL		SRQMADGGWG		EDFESCEERR		YLQSAQSQIH
NTCWAMMGLM		AVRHPDIEAQ		ERGVRCLLEK		QLPNGDWPQE		NIAGVFNKSC
AISYTSYRNI		FPIWALGRFS		QLYPERALAG		HP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до ізомераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм ліпідів, біосинтез ліпідів, біосинтез стероїдів, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Baker C.H., Matsuda S.P.T., Liu D.R., Corey E.J. (1995). Molecular cloning of the human gene encoding lanosterol synthase from a liver cDNA library. Biochem. Biophys. Res. Commun. 213: 154—160. PMID 7639730 DOI:10.1006/bbrc.1995.2110
• Sung C.K., Shibuya M., Sankawa U., Ebizuka Y. (1995). Molecular cloning of cDNA encoding human lanosterol synthase. Biol. Pharm. Bull. 18: 1459—1461. PMID 8593458 DOI:10.1248/bpb.18.1459
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Young M., Chen H., Lalioti M.D., Antonarakis S.E. (1996). The human lanosterol synthase gene maps to chromosome 21q22.3. Hum. Genet. 97: 620—624. PMID 8655142 DOI:10.1007/BF02281872

Див. також

• Хромосома 21