LSM10

LSM10 (англ. LSM10, U7 small nuclear RNA associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 123 амінокислот, а молекулярна маса — 14 080.

LSM10
Ідентифікатори
Символи	LSM10, MST074, MSTP074, U7 small nuclear RNA associated
Зовнішні ІД	OMIM: 617909 MGI: 2151045 HomoloGene: 13154 GeneCards: LSM10
Онтологія гена Молекулярна функція • U7 snRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone pre-mRNA DCP binding • RNA binding Клітинна компонента • Тільце Кахаля • U7 snRNP • клітинне ядро • Нуклеоплазма • Ядерні тільця Біологічний процес • positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • histone mRNA metabolic process • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84967	116748
Ensembl	ENSG00000181817	ENSMUSG00000050188
UniProt	Q969L4	Q8QZX5
RefSeq (мРНК)	NM_032881	NM_001163266 NM_138721
RefSeq (білок)	NP_116270	NP_001156738 NP_620046
Локус (UCSC)	Хр. 1: 36.39 – 36.4 Mb	Хр. 4: 125.99 – 125.99 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVSHSVKER		TISENSLIIL		LQGLQGRVTT		VDLRDESVAH		GRIDNVDAFM
NIRLAKVTYT		DRWGHQVKLD		DLFVTGRNVR		YVHIPDDVNI		TSTIEQQLQI
IHRVRNFGGK		GQGRWEFPPK		NCK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Pillai R.S., Will C.L., Luehrmann R., Schuemperli D., Mueller B. (2001). Purified U7 snRNPs lack the Sm proteins D1 and D2 but contain Lsm10, a new 14 kDa Sm D1-like protein. EMBO J. 20: 5470—5479. PMID 11574479 DOI:10.1093/emboj/20.19.5470
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wagner E.J., Marzluff W.F. (2006). ZFP100, a component of the active U7 snRNP limiting for histone pre-mRNA processing, is required for entry into S phase. Mol. Cell. Biol. 26: 6702—6712. PMID 16914750 DOI:10.1128/MCB.00391-06

Див. також

• Хромосома 1