KDM4E

KDM4E (англ. Lysine demethylase 4E) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 506 амінокислот, а молекулярна маса — 56 804.

KDM4E
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2W2I
Ідентифікатори
Символи	KDM4E, JMJD2E, KDM4DL, lysine demethylase 4E, KDM5E
Зовнішні ІД	OMIM: 616581 HomoloGene: 121371 GeneCards: KDM4E
Онтологія гена Молекулярна функція • oxidoreductase activity • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • histone H3-methyl-lysine-9 demethylase activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • histone demethylase activity • methylated histone binding Клітинна компонента • клітинне ядро • histone methyltransferase complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • histone H3-K9 demethylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Ремоделювання хроматину Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	390245	н/д
Ensembl	ENSG00000235268	н/д
UniProt	B2RXH2	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001161630	н/д
RefSeq (білок)	NP_001155102	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 11: 95.03 – 95.03 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKSVHSSPQN		TSHTIMTFYP		TMEEFADFNT		YVAYMESQGA		HQAGLAKVIP
PKEWKARQMY		DDIEDILIAT		PLQQVTSGQG		GVFTQYHKKK		KAMRVGQYRR
LANSKKYQTP		PHQNFADLEQ		RYWKSHPGNP		PIYGADISGS		LFEESTKQWN
LGHLGTILDL		LEQECGVVIE		GVNTPYLYFG		MWKTTFAWHT		EDMDLYSINY
LHFGEPKTWY		VVPPEHGQHL		ERLARELFPD		ISRGCEAFLR		HKVALISPTV
LKENGIPFNC		MTQEAGEFMV		TFPYGYHAGF		NHGFNCAEAI		NFATPRWIDY
GKMASQCSCG		ESTVTFSMDP		FVRIVQPESY		ELWKHRQDLA		IVEHTEPRVA
ESQELSNWRD		DIVLRRAALG		LRLLPNLTAQ		CPTQPVSSGH		CYNPKGCGTD
AVPGSAFQSS		AYHTQTQSLT		LGMSARVLLP		STGSWGSGRG		RGRGQGQGRG
CSRGRGHGCC		TRELGTEEPT		VQPASKRRLL		MGTRSRAQGH		RPQLPLANDL
MTNLSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11