KCTD16

KCTD16 (англ. Potassium channel tetramerization domain containing 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 428 амінокислот, а молекулярна маса — 49 138.

KCTD16
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5A15
Ідентифікатори
Символи	KCTD16, potassium channel tetramerization domain containing 16
Зовнішні ІД	OMIM: 613423 MGI: 1914659 HomoloGene: 44779 GeneCards: KCTD16
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • Міжклітинні контакти • postsynaptic membrane • клітинна мембрана • мембрана • presynaptic membrane • синапс • receptor complex Біологічний процес • regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway • protein homooligomerization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57528	383348
Ensembl	ENSG00000183775	ENSMUSG00000051401
UniProt	Q68DU8	Q5DTY9
RefSeq (мРНК)	NM_020768 NM_001370486 NM_001370487	NM_026135
RefSeq (білок)	NP_065819 NP_001357415 NP_001357416	NP_080411 NP_001357968 NP_001357969 NP_001357970
Локус (UCSC)	Хр. 5: 144.17 – 144.49 Mb	Хр. 18: 40.26 – 40.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALSGNCSRY		YPREQGSAVP		NSFPEVVELN		VGGQVYFTRH		STLISIPHSL
LWKMFSPKRD		TANDLAKDSK		GRFFIDRDGF		LFRYILDYLR		DRQVVLPDHF
PEKGRLKREA		EYFQLPDLVK		LLTPDEIKQS		PDEFCHSDFE		DASQGSDTRI
CPPSSLLPAD		RKWGFITVGY		RGSCTLGREG		QADAKFRRVP		RILVCGRISL
AKEVFGETLN		ESRDPDRAPE		RYTSRFYLKF		KHLERAFDML		SECGFHMVAC
NSSVTASFIN		QYTDDKIWSS		YTEYVFYREP		SRWSPSHCDC		CCKNGKGDKE
GESGTSCNDL		STSSCDSQSE		ASSPQETVIC		GPVTRQTNIQ		TLDRPIKKGP
VQLIQQSEMR		RKSDLLRTLT		SGSRESNMSS		KKKAVKEKLS		IEEELEKCIQ
DFLKIKIPDR		FPERKHPWQS		ELLRKYHL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5