IFIT5

IFIT5 (англ. Interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 482 амінокислот, а молекулярна маса — 55 847.

IFIT5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3ZGQ, 4HOQ, 4HOR, 4HOS, 4HOT, 4J0U
Ідентифікатори
Символи	IFIT5, P58, RI58, ISG58, interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 5
Зовнішні ІД	OMIM: 616135 HomoloGene: 49318 GeneCards: IFIT5
Онтологія гена Молекулярна функція • tRNA binding • single-stranded RNA binding • RNA binding • RNA cap binding • double-stranded DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • poly(U) RNA binding Клітинна компонента • ruffle membrane • клітинна мембрана • cell projection • apical part of cell • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • actin cytoskeleton • IkappaB kinase complex • гіалоплазма Біологічний процес • вроджений імунітет • defense response to virus • процес імунної системи • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • negative regulation of viral genome replication Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	24138	100001239
Ensembl	ENSG00000152778	ENSDARG00000090537
UniProt	Q13325	E7FCM5
RefSeq (мРНК)	NM_012420	NM_001190464
RefSeq (білок)	NP_036552	NP_001177393
Локус (UCSC)	Хр. 10: 89.41 – 89.42 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSEIRKDTLK		AILLELECHF		TWNLLKEDID		LFEVEDTIGQ		QLEFLTTKSR
LALYNLLAYV		KHLKGQNKDA		LECLEQAEEI		IQQEHSDKEE		VRSLVTWGNY
AWVYYHMDQL		EEAQKYTGKI		GNVCKKLSSP		SNYKLECPET		DCEKGWALLK
FGGKYYQKAK		AAFEKALEVE		PDNPEFNIGY		AITVYRLDDS		DREGSVKSFS
LGPLRKAVTL		NPDNSYIKVF		LALKLQDVHA		EAEGEKYIEE		ILDQISSQPY
VLRYAAKFYR		RKNSWNKALE		LLKKALEVTP		TSSFLHHQMG		LCYRAQMIQI
KKATHNRPKG		KDKLKVDELI		SSAIFHFKAA		MERDSMFAFA		YTDLANMYAE
GGQYSNAEDI		FRKALRLENI		TDDHKHQIHY		HYGRFQEFHR		KSENTAIHHY
LEALKVKDRS		PLRTKLTSAL		KKLSTKRLCH		NALDVQSLSA		LGFVYKLEGE
KRQAAEYYEK		AQKIDPENAE		FLTALCELRL		SI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, тРНК. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

• Niikura T., Hirata R., Weil S.C. (1997). A novel interferon-inducible gene expressed during myeloid differentiation. Blood Cells Mol. Dis. 23: 337—349. PMID 9398535 DOI:10.1006/bcmd.1997.0151
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Fensterl V., Sen G.C. (2011). The ISG56/IFIT1 gene family. J. Interferon Cytokine Res. 31: 71—78. PMID 20950130 DOI:10.1089/jir.2010.0101
• Abbas Y.M., Pichlmair A., Gorna M.W., Superti-Furga G., Nagar B. (2013). Structural basis for viral 5'-PPP-RNA recognition by human IFIT proteins. Nature. 494: 60—64. PMID 23334420 DOI:10.1038/nature11783

Див. також

• Хромосома 10