HSPG2

HSPG2 (англ. Heparan sulfate proteoglycan 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 391 амінокислот, а молекулярна маса — 468 830.

HSPG2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3SH4, 3SH5
Ідентифікатори
Символи	HSPG2, HSPG, PLC, PRCAN, SJA, SJS, SJS1, heparan sulfate proteoglycan 2
Зовнішні ІД	OMIM: 142461 MGI: 96257 HomoloGene: 68473 GeneCards: HSPG2
Пов'язані генетичні захворювання
Schwartz-Jampel syndrome 1, Silverman-Handmaker type dyssegmental dysplasia
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium ion binding • protein C-terminus binding • amyloid-beta binding • extracellular matrix structural constituent conferring compression resistance • low-density lipoprotein particle receptor binding Клітинна компонента • Базальна мембрана • Golgi lumen • екзосома • lysosomal lumen • extracellular region • клітинна мембрана • GO:0005578 Позаклітинна матриця • focal adhesion • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix • plasma membrane protein complex Біологічний процес • glycosaminoglycan metabolic process • extracellular matrix disassembly • retinoid metabolic process • glycosaminoglycan biosynthetic process • glycosaminoglycan catabolic process • Ангіогенез • extracellular matrix organization • lipid metabolism • рецептор-опосередкований ендоцитоз • inflammatory response • brain development • negative regulation of angiogenesis • диференціація клітин • animal organ morphogenesis • Гістогенез • cell migration • substrate adhesion-dependent cell spreading Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3339	15530
Ensembl	ENSG00000142798	ENSMUSG00000028763
UniProt	P98160	Q05793
RefSeq (мРНК)	NM_001291860 NM_005529	NM_008305
RefSeq (білок)	NP_001278789 NP_005520	NP_032331
Локус (UCSC)	Хр. 1: 21.82 – 21.94 Mb	Хр. 4: 137.2 – 137.3 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGWRAAGALL		LALLLHGRLL		AVTHGLRAYD		GLSLPEDIET		VTASQMRWTH
SYLSDDEDML		ADSISGDDLG		SGDLGSGDFQ		MVYFRALVNF		TRSIEYSPQL
EDAGSREFRE		VSEAVVDTLE		SEYLKIPGDQ		VVSVVFIKEL		DGWVFVELDV
GSEGNADGAQ		IQEMLLRVIS		SGSVASYVTS		PQGFQFRRLG		TVPQFPRACT
EAEFACHSYN		ECVALEYRCD		RRPDCRDMSD		ELNCEEPVLG		ISPTFSLLVE
TTSLPPRPET		TIMRQPPVTH		APQPLLPGSV		RPLPCGPQEA		ACRNGHCIPR
DYLCDGQEDC		EDGSDELDCG		PPPPCEPNEF		PCGNGHCALK		LWRCDGDFDC
EDRTDEANCP		TKRPEEVCGP		TQFRCVSTNM		CIPASFHCDE		ESDCPDRSDE
FGCMPPQVVT		PPRESIQASR		GQTVTFTCVA		IGVPTPIINW		RLNWGHIPSH
PRVTVTSEGG		RGTLIIRDVK		ESDQGAYTCE		AMNARGMVFG		IPDGVLELVP
QRGPCPDGHF		YLEHSAACLP		CFCFGITSVC		QSTRRFRDQI		RLRFDQPDDF
KGVNVTMPAQ		PGTPPLSSTQ		LQIDPSLHEF		QLVDLSRRFL		VHDSFWALPE
QFLGNKVDSY		GGSLRYNVRY		ELARGMLEPV		QRPDVVLMGA		GYRLLSRGHT
PTQPGALNQR		QVQFSEEHWV		HESGRPVQRA		ELLQVLQSLE		AVLIQTVYNT
KMASVGLSDI		AMDTTVTHAT		SHGRAHSVEE		CRCPIGYSGL		SCESCDAHFT
RVPGGPYLGT		CSGCNCNGHA		SSCDPVYGHC		LNCQHNTEGP		QCNKCKAGFF
GDAMKATATS		CRPCPCPYID		ASRRFSDTCF		LDTDGQATCD		ACAPGYTGRR
CESCAPGYEG		NPIQPGGKCR		PVNQEIVRCD		ERGSMGTSGE		ACRCKNNVVG
RLCNECADGS		FHLSTRNPDG		CLKCFCMGVS		RHCTSSSWSR		AQLHGASEEP
GHFSLTNAAS		THTTNEGIFS		PTPGELGFSS		FHRLLSGPYF		WSLPSRFLGD
KVTSYGGELR		FTVTQRSQPG		STPLHGQPLV		VLQGNNIILE		HHVAQEPSPG
QPSTFIVPFR		EQAWQRPDGQ		PATREHLLMA		LAGIDTLLIR		ASYAQQPAES
RVSGISMDVA		VPEETGQDPA		LEVEQCSCPP		GYRGPSCQDC		DTGYTRTPSG
LYLGTCERCS		CHGHSEACEP		ETGACQGCQH		HTEGPRCEQC		QPGYYGDAQR
GTPQDCQLCP		CYGDPAAGQA		AHTCFLDTDG		HPTCDACSPG		HSGRHCERCA
PGYYGNPSQG		QPCQRDSQVP		GPIGCNCDPQ		GSVSSQCDAA		GQCQCKAQVE
GLTCSHCRPH		HFHLSASNPD		GCLPCFCMGI		TQQCASSAYT		RHLISTHFAP
GDFQGFALVN		PQRNSRLTGE		FTVEPVPEGA		QLSFGNFAQL		GHESFYWQLP
ETYQGDKVAA		YGGKLRYTLS		YTAGPQGSPL		SDPDVQITGN		NIMLVASQPA
LQGPERRSYE		IMFREEFWRR		PDGQPATREH		LLMALADLDE		LLIRATFSSV
PLAASISAVS		LEVAQPGPSN		RPRALEVEEC		RCPPGYIGLS		CQDCAPGYTR
TGSGLYLGHC		ELCECNGHSD		LCHPETGACS		QCQHNAAGEF		CELCAPGYYG
DATAGTPEDC		QPCACPLTNP		ENMFSRTCES		LGAGGYRCTA		CEPGYTGQYC
EQCGPGYVGN		PSVQGGQCLP		ETNQAPLVVE		VHPARSIVPQ		GGSHSLRCQV
SGSPPHYFYW		SREDGRPVPS		GTQQRHQGSE		LHFPSVQPSD		AGVYICTCRN
LHQSNTSRAE		LLVTEAPSKP		ITVTVEEQRS		QSVRPGADVT		FICTAKSKSP
AYTLVWTRLH		NGKLPTRAMD		FNGILTIRNV		QLSDAGTYVC		TGSNMFAMDQ
GTATLHVQAS		GTLSAPVVSI		HPPQLTVQPG		QLAEFRCSAT		GSPTPTLEWT
GGPGGQLPAK		AQIHGGILRL		PAVEPTDQAQ		YLCRAHSSAG		QQVARAVLHV
HGGGGPRVQV		SPERTQVHAG		RTVRLYCRAA		GVPSATITWR		KEGGSLPPQA
RSERTDIATL		LIPAITTADA		GFYLCVATSP		AGTAQARIQV		VVLSASDASP
PPVKIESSSP		SVTEGQTLDL		NCVVAGSAHA		QVTWYRRGGS		LPPHTQVHGS
RLRLPQVSPA		DSGEYVCRVE		NGSGPKEASI		TVSVLHGTHS		GPSYTPVPGS
TRPIRIEPSS		SHVAEGQTLD		LNCVVPGQAH		AQVTWHKRGG		SLPARHQTHG
SLLRLHQVTP		ADSGEYVCHV		VGTSGPLEAS		VLVTIEASVI		PGPIPPVRIE
SSSSTVAEGQ		TLDLSCVVAG		QAHAQVTWYK		RGGSLPARHQ		VRGSRLYIFQ
ASPADAGQYV		CRASNGMEAS		ITVTVTGTQG		ANLAYPAGST		QPIRIEPSSS
QVAEGQTLDL		NCVVPGQSHA		QVTWHKRGGS		LPVRHQTHGS		LLRLYQASPA
DSGEYVCRVL		GSSVPLEASV		LVTIEPAGSV		PALGVTPTVR		IESSSSQVAE
GQTLDLNCLV		AGQAHAQVTW		HKRGGSLPAR		HQVHGSRLRL		LQVTPADSGE
YVCRVVGSSG		TQEASVLVTI		QQRLSGSHSQ		GVAYPVRIES		SSASLANGHT
LDLNCLVASQ		APHTITWYKR		GGSLPSRHQI		VGSRLRIPQV		TPADSGEYVC
HVSNGAGSRE		TSLIVTIQGS		GSSHVPSVSP		PIRIESSSPT		VVEGQTLDLN
CVVARQPQAI		ITWYKRGGSL		PSRHQTHGSH		LRLHQMSVAD		SGEYVCRANN
NIDALEASIV		ISVSPSAGSP		SAPGSSMPIR		IESSSSHVAE		GETLDLNCVV
PGQAHAQVTW		HKRGGSLPSH		HQTRGSRLRL		HHVSPADSGE		YVCRVMGSSG
PLEASVLVTI		EASGSSAVHV		PAPGGAPPIR		IEPSSSRVAE		GQTLDLKCVV
PGQAHAQVTW		HKRGGNLPAR		HQVHGPLLRL		NQVSPADSGE		YSCQVTGSSG
TLEASVLVTI		EPSSPGPIPA		PGLAQPIYIE		ASSSHVTEGQ		TLDLNCVVPG
QAHAQVTWYK		RGGSLPARHQ		THGSQLRLHL		VSPADSGEYV		CRAASGPGPE
QEASFTVTVP		PSEGSSYRLR		SPVISIDPPS		STVQQGQDAS		FKCLIHDGAA
PISLEWKTRN		QELEDNVHIS		PNGSIITIVG		TRPSNHGTYR		CVASNAYGVA
QSVVNLSVHG		PPTVSVLPEG		PVWVKVGKAV		TLECVSAGEP		RSSARWTRIS
STPAKLEQRT		YGLMDSHAVL		QISSAKPSDA		GTYVCLAQNA		LGTAQKQVEV
IVDTGAMAPG		APQVQAEEAE		LTVEAGHTAT		LRCSATGSPA		PTIHWSKLRS
PLPWQHRLEG		DTLIIPRVAQ		QDSGQYICNA		TSPAGHAEAT		IILHVESPPY
ATTVPEHASV		QAGETVQLQC		LAHGTPPLTF		QWSRVGSSLP		GRATARNELL
HFERAAPEDS		GRYRCRVTNK		VGSAEAFAQL		LVQGPPGSLP		ATSIPAGSTP
TVQVTPQLET		KSIGASVEFH		CAVPSDRGTQ		LRWFKEGGQL		PPGHSVQDGV
LRIQNLDQSC		QGTYICQAHG		PWGKAQASAQ		LVIQALPSVL		INIRTSVQTV
VVGHAVEFEC		LALGDPKPQV		TWSKVGGHLR		PGIVQSGGVV		RIAHVELADA
GQYRCTATNA		AGTTQSHVLL		LVQALPQISM		PQEVRVPAGS		AAVFPCIASG
YPTPDISWSK		LDGSLPPDSR		LENNMLMLPS		VRPQDAGTYV		CTATNRQGKV
KAFAHLQVPE		RVVPYFTQTP		YSFLPLPTIK		DAYRKFEIKI		TFRPDSADGM
LLYNGQKRVP		GSPTNLANRQ		PDFISFGLVG		GRPEFRFDAG		SGMATIRHPT
PLALGHFHTV		TLLRSLTQGS		LIVGDLAPVN		GTSQGKFQGL		DLNEELYLGG
YPDYGAIPKA		GLSSGFIGCV		RELRIQGEEI		VFHDLNLTAH		GISHCPTCRD
RPCQNGGQCH		DSESSSYVCV		CPAGFTGSRC		EHSQALHCHP		EACGPDATCV
NRPDGRGYTC		RCHLGRSGLR		CEEGVTVTTP		SLSGAGSYLA		LPALTNTHHE
LRLDVEFKPL		APDGVLLFSG		GKSGPVEDFV		SLAMVGGHLE		FRYELGSGLA
VLRSAEPLAL		GRWHRVSAER		LNKDGSLRVN		GGRPVLRSSP		GKSQGLNLHT
LLYLGGVEPS		VPLSPATNMS		AHFRGCVGEV		SVNGKRLDLT		YSFLGSQGIG
QCYDSSPCER		QPCQHGATCM		PAGEYEFQCL		CRDGFKGDLC		EHEENPCQLR
EPCLHGGTCQ		GTRCLCLPGF		SGPRCQQGSG		HGIAESDWHL		EGSGGNDAPG
QYGAYFHDDG		FLAFPGHVFS		RSLPEVPETI		ELEVRTSTAS		GLLLWQGVEV
GEAGQGKDFI		SLGLQDGHLV		FRYQLGSGEA		RLVSEDPIND		GEWHRVTALR
EGRRGSIQVD		GEELVSGRSP		GPNVAVNAKG		SVYIGGAPDV		ATLTGGRFSS
GITGCVKNLV		LHSARPGAPP		PQPLDLQHRA		QAGANTRPCP		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як ангіогенез. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Kallunki P., Tryggvason K. (1992). Human basement membrane heparan sulfate proteoglycan core protein: a 467-kD protein containing multiple domains resembling elements of the low density lipoprotein receptor, laminin, neural cell adhesion molecules, and epidermal growth factor. J. Cell Biol. 116: 559—571. PMID 1730768 DOI:10.1083/jcb.116.2.559
• Cohen I.R., Graessel S., Murdoch A.D., Iozzo R.V. (1993). Structural characterization of the complete human perlecan gene and its promoter. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 10404—10408. PMID 8234307 DOI:10.1073/pnas.90.21.10404
• Mongiat M., Sweeney S.M., San Antonio J.D., Fu J., Iozzo R.V. (2003). Endorepellin, a novel inhibitor of angiogenesis derived from the C terminus of perlecan. J. Biol. Chem. 278: 4238—4249. PMID 12435733 DOI:10.1074/jbc.M210445200
• Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
• Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 DOI:10.1074/mcp.M111.013649
• Murdoch A.D., Dodge G.R., Cohen I., Tuan R.S., Iozzo R.V. (1992). Primary structure of the human heparan sulfate proteoglycan from basement membrane (HSPG2/perlecan). A chimeric molecule with multiple domains homologous to the low density lipoprotein receptor, laminin, neural cell adhesion molecules, and epidermal growth factor. J. Biol. Chem. 267: 8544—8557. PMID 1569102

Див. також

• Хромосома 1