HBS1L

HBS1L (англ. HBS1 like translational GTPase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 684 амінокислот, а молекулярна маса — 75 473.

HBS1L
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UFZ
Ідентифікатори
Символи	HBS1L, EF-1a, ERFS, HBS1, HSPC276, eRF3c, HBS1 like translational GTPase
Зовнішні ІД	OMIM: 612450 MGI: 1891704 HomoloGene: 68525 GeneCards: HBS1L
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GO:0006184 GTPase activity • translation elongation factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • екзосома • внутрішньоклітинний • мембрана • гіалоплазма Біологічний процес • translational elongation • Біосинтез білків • GO:0072468 сигнальна трансдукція • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10767	56422
Ensembl	ENSG00000112339	ENSMUSG00000019977
UniProt	Q9Y450	Q69ZS7
RefSeq (мРНК)	NM_001145158 NM_001145207 NM_006620 NM_001363686	NM_001042593 NM_001145209 NM_019702
RefSeq (білок)	NP_001138630 NP_001138679 NP_006611 NP_001350615 NP_006611.1	NP_001036058 NP_001138681 NP_062676
Локус (UCSC)	Хр. 6: 134.96 – 135.1 Mb	Хр. 10: 21.17 – 21.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MARHRNVRGY		NYDEDFEDDD		LYGQSVEDDY		CISPSTAAQF		IYSRRDKPSV
EPVEEYDYED		LKESSNSVSN		HQLSGFDQAR		LYSCLDHMRE		VLGDAVPDEI
LIEAVLKNKF		DVQKALSGVL		EQDRVQSLKD		KNEATVSTGK		IAKGKPVDSQ
TSRSESEIVP		KVAKMTVSGK		KQTMGFEVPG		VSSEENGHSF		HTPQKGPPIE
DAIASSDVLE		TASKSANPPH		TIQASEEQSS		TPAPVKKSGK		LRQQIDVKAE
LEKRQGGKQL		LNLVVIGHVD		AGKSTLMGHM		LYLLGNINKR		TMHKYEQESK
KAGKASFAYA		WVLDETGEER		ERGVTMDVGM		TKFETTTKVI		TLMDAPGHKD
FIPNMITGAA		QADVAVLVVD		ASRGEFEAGF		ETGGQTREHG		LLVRSLGVTQ
LAVAVNKMDQ		VNWQQERFQE		ITGKLGHFLK		QAGFKESDVG		FIPTSGLSGE
NLITRSQSSE		LTKWYKGLCL		LEQIDSFKPP		QRSIDKPFRL		CVSDVFKDQG
SGFCITGKIE		AGYIQTGDRL		LAMPPNETCT		VKGITLHDEP		VDWAAAGDHV
SLTLVGMDII		KINVGCIFCG		PKVPIKACTR		FRARILIFNI		EIPITKGFPV
LLHYQTVSEP		AVIKRLISVL		NKSTGEVTKK		KPKFLTKGQN		ALVELQTQRP
IALELYKDFK		ELGRFMLRYG		GSTIAAGVVT		EIKE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до факторів елонгації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6