H2AFZ

H2AFZ (англ. H2A histone family member Z) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 128 амінокислот, а молекулярна маса — 13 553.

H2AFZ
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1F66, 3WA9, 4CAY, 4NFT, 5FUG, 5CHL
Ідентифікатори
Символи	H2AZ1, H2A.Z-1, H2A.z, H2A/z, H2AZ, H2A histone family member Z, H2A.Z variant histone 1, H2AFZ
Зовнішні ІД	OMIM: 142763 MGI: 1888388 HomoloGene: 80218 GeneCards: H2AZ1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleosomal DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • chromatin DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • protein heterodimerization activity Клітинна компонента • Нуклеосома • екзосома • Тільце Барра • клітинне ядро • хромосома Біологічний процес • cellular response to estradiol stimulus • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3015	51788
Ensembl	ENSG00000164032	ENSMUSG00000037894
UniProt	P0C0S5	P0C0S6
RefSeq (мРНК)	NM_002106	NM_016750 NM_001316995
RefSeq (білок)	NP_002097	NP_001303924 NP_058030
Локус (UCSC)	Хр. 4: 99.95 – 99.95 Mb	Хр. 3: 137.57 – 137.57 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGGKAGKDS		GKAKTKAVSR		SQRAGLQFPV		GRIHRHLKSR		TTSHGRVGAT
AAVYSAAILE		YLTAEVLELA		GNASKDLKVK		RITPRHLQLA		IRGDEELDSL
IKATIAGGGV		IPHIHKSLIG		KKGQQKTV

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Hatch C.L., Bonner W.M. (1988). Sequence of cDNAs for mammalian H2A.Z, an evolutionarily diverged but highly conserved basal histone H2A isoprotein species. Nucleic Acids Res. 16: 1113—1124. PMID 3344202 DOI:10.1093/nar/16.3.1113
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jason L.J.M., Moore S.C., Lewis J.D., Lindsey G., Ausio J. (2002). Histone ubiquitination: a tagging tail unfolds?. Bioessays. 24: 166—174. PMID 11835281 DOI:10.1002/bies.10038
• Boyne M.T. II, Pesavento J.J., Mizzen C.A., Kelleher N.L. (2006). Precise characterization of human histones in the H2A gene family by top down mass spectrometry. J. Proteome Res. 5: 248—253. PMID 16457589 DOI:10.1021/pr050269n
• Bonenfant D., Coulot M., Towbin H., Schindler P., van Oostrum J. (2006). Characterization of histones H2A and H2B variants and their post-translational modifications by mass spectrometry. Mol. Cell. Proteomics. 5: 541—552. PMID 16319397 DOI:10.1074/mcp.M500288-MCP200
• Suto R.K., Clarkson M.J., Tremethick D.J., Luger K. (2000). Crystal structure of a nucleosome core particle containing the variant histone H2A.Z. Nat. Struct. Biol. 7: 1121—1124. PMID 11101893 DOI:10.1038/81971

Див. також

• Хромосома 4