GFI1

GFI1 (англ. Growth factor independent 1 transcriptional repressor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 422 амінокислот, а молекулярна маса — 45 297.

GFI1
Ідентифікатори
Символи	GFI1, GFI-1, GFI1A, SCN2, ZNF163, growth factor independent 1 transcriptional repressor
Зовнішні ІД	OMIM: 600871 MGI: 103170 HomoloGene: 3854 GeneCards: GFI1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • Ядерні тільця • nuclear matrix • transcription repressor complex • клітинне ядро • Нуклеоплазма Біологічний процес • positive regulation of interleukin-6-mediated signaling pathway • negative regulation of neuron projection development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of toll-like receptor signaling pathway • regulation of histone H3-K4 methylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle • transcription, DNA-templated • negative regulation of vitamin D biosynthetic process • negative regulation of calcidiol 1-monooxygenase activity • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • cellular response to lipopolysaccharide • кровотворення • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2672	14581
Ensembl	ENSG00000162676	ENSMUSG00000029275
UniProt	Q99684	P70338
RefSeq (мРНК)	NM_001127215 NM_001127216 NM_005263	NM_001267621 NM_010278
RefSeq (білок)	NP_001120687 NP_001120688 NP_005254	NP_001254550 NP_034408
Локус (UCSC)	Хр. 1: 92.47 – 92.49 Mb	Хр. 5: 107.86 – 107.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPRSFLVKSK		KAHSYHQPRS		PGPDYSLRLE		NVPAPSRADS		TSNAGGAKAE
PRDRLSPESQ		LTEAPDRASA		SPDSCEGSVC		ERSSEFEDFW		RPPSPSASPA
SEKSMCPSLD		EAQPFPLPFK		PYSWSGLAGS		DLRHLVQSYR		PCGALERGAG
LGLFCEPAPE		PGHPAALYGP		KRAAGGAGAG		APGSCSAGAG		ATAGPGLGLY
GDFGSAAAGL		YERPTAAAGL		LYPERGHGLH		ADKGAGVKVE		SELLCTRLLL
GGGSYKCIKC		SKVFSTPHGL		EVHVRRSHSG		TRPFACEMCG		KTFGHAVSLE
QHKAVHSQER		SFDCKICGKS		FKRSSTLSTH		LLIHSDTRPY		PCQYCGKRFH
QKSDMKKHTF		IHTGEKPHKC		QVCGKAFSQS		SNLITHSRKH		TGFKPFGCDL
CGKGFQRKVD		LRRHRETQHG		LK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Roberts T., Cowell J.K. (1997). Cloning of the human Gfi-1 gene and its mapping to chromosome region 1p22. Oncogene. 14: 1003—1005. PMID 9051000 DOI:10.1038/sj.onc.1200910
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zweidler-Mckay P.A., Grimes H.L., Flubacher M.M., Tsichlis P.N. (1996). Gfi-1 encodes a nuclear zinc finger protein that binds DNA and functions as a transcriptional repressor. Mol. Cell. Biol. 16: 4024—4034. PMID 8754800 DOI:10.1128/MCB.16.8.4024
• Duan Z., Zarebski A., Montoya-Durango D., Grimes H.L., Horwitz M. (2005). Gfi1 coordinates epigenetic repression of p21Cip/WAF1 by recruitment of histone lysine methyltransferase G9a and histone deacetylase 1. Mol. Cell. Biol. 25: 10338—10351. PMID 16287849 DOI:10.1128/MCB.25.23.10338-10351.2005
• Dahl R., Iyer S.R., Owens K.S., Cuylear D.D., Simon M.C. (2007). The transcriptional repressor GFI-1 antagonizes PU.1 activity through protein-protein interaction. J. Biol. Chem. 282: 6473—6483. PMID 17197705 DOI:10.1074/jbc.M607613200
• Ossovskaya V.S., Dolganov G., Basbaum A.I. (2009). Loss of function genetic screens reveal MTGR1 as an intracellular repressor of beta1 integrin-dependent neurite outgrowth. J. Neurosci. Methods. 177: 322—333. PMID 19026687 DOI:10.1016/j.jneumeth.2008.10.031

Див. також

• Хромосома 1