ARL1

ARL1 (англ. ADP ribosylation factor like GTPase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 181 амінокислот, а молекулярна маса — 20 418.

ARL1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UPT, 4DCN, 5EE5
Ідентифікатори
Символи	ARL1, ARFL1, ADP ribosylation factor like GTPase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603425 MGI: 99436 HomoloGene: 20319 GeneCards: ARL1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0010577 enzyme activator activity • GO:0006184 GTPase activity • protein domain specific binding • зв'язування з іоном металу • GTP binding Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • Golgi membrane • внутрішньоклітинний • мембрана • цитоплазма • trans-Golgi network • trans-Golgi network membrane • гіалоплазма Біологічний процес • protein localization to Golgi apparatus • toxin metabolic process • activation of phospholipase D activity • retrograde transport, endosome to Golgi • Golgi organization • Golgi vesicle transport • intracellular protein transport • vesicle-mediated transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	400	104303
Ensembl	ENSG00000120805	ENSMUSG00000060904
UniProt	P40616	P61211
RefSeq (мРНК)	NM_001301068 NM_001177	NM_025859
RefSeq (білок)	NP_001168 NP_001287997	NP_080135
Локус (UCSC)	Хр. 12: 101.39 – 101.41 Mb	Хр. 10: 88.57 – 88.58 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGGFFSSIFS		SLFGTREMRI		LILGLDGAGK		TTILYRLQVG		EVVTTIPTIG
FNVETVTYKN		LKFQVWDLGG		QTSIRPYWRC		YYSNTDAVIY		VVDSCDRDRI
GISKSELVAM		LEEEELRKAI		LVVFANKQDM		EQAMTSSEMA		NSLGLPALKD
RKWQIFKTSA		TKGTGLDEAM		EWLVETLKSR		Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, ГТФ, іоном магнію. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Van Valkenburgh H., Shern J.F., Sharer J.D., Zhu X., Kahn R.A. (2001). ADP-ribosylation factors (ARFs) and ARF-like 1 (ARL1) have both specific and shared effectors: characterizing ARL1-binding proteins. J. Biol. Chem. 276: 22826—22837. PMID 11303027 DOI:10.1074/jbc.M102359200
• Panic B., Perisic O., Veprintsev D.B., Williams R.L., Munro S. (2003). Structural basis for Arl1-dependent targeting of homodimeric GRIP domains to the Golgi apparatus. Mol. Cell. 12: 863—874. PMID 14580338 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00356-3

Див. також

• Хромосома 12