AGO1

AGO1 (англ. Argonaute 1, RISC catalytic component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 857 амінокислот, а молекулярна маса — 97 214.

AGO1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1SI2, 1SI3, 4KRE, 4KRF, 4KXT
Ідентифікатори
Символи	AGO1, EIF2C, EIF2C1, GERP95, Q99, hAgo1, argonaute 1, RISC catalytic component, argonaute RISC catalytic component 1, argonaute RISC component 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606228 MGI: 2446630 HomoloGene: 81826 GeneCards: AGO1
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA polymerase II complex binding • miRNA binding • endoribonuclease activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • RNA binding • nucleic acid binding • double-stranded RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • Полісома • гіалоплазма • RISC • P-body • Нуклеоплазма • RISC-loading complex • клітинне ядро • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • mRNA destabilization-mediated gene silencing by siRNA • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • pre-miRNA processing • nuclear-transcribed mRNA catabolic process • GO:1901313 positive regulation of gene expression • GO:0035194 РНК-інтерференція • miRNA-mediated gene silencing by inhibition of translation • RNA secondary structure unwinding • mRNA destabilization-mediated gene silencing by miRNA • GO:0061715 miRNA metabolic process • regulation of translation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • Wnt signaling pathway, calcium modulating pathway • Сайленсинг генів • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of megakaryocyte differentiation • negative regulation of gene expression • negative regulation of angiogenesis • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26523	236511
Ensembl	ENSG00000092847	ENSMUSG00000041530
UniProt	Q9UL18	Q8CJG1
RefSeq (мРНК)	NM_012199 NM_001317122 NM_001317123	NM_153403 NM_001317173 NM_001317174 NM_001378879
RefSeq (білок)	NP_001304051 NP_001304052 NP_036331	NP_001304102 NP_001304103 NP_700452 NP_001365808
Локус (UCSC)	Хр. 1: 35.87 – 35.93 Mb	Хр. 4: 126.33 – 126.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAGPSGAAA		GAYLPPLQQV		FQAPRRPGIG		TVGKPIKLLA		NYFEVDIPKI
DVYHYEVDIK		PDKCPRRVNR		EVVEYMVQHF		KPQIFGDRKP		VYDGKKNIYT
VTALPIGNER		VDFEVTIPGE		GKDRIFKVSI		KWLAIVSWRM		LHEALVSGQI
PVPLESVQAL		DVAMRHLASM		RYTPVGRSFF		SPPEGYYHPL		GGGREVWFGF
HQSVRPAMWK		MMLNIDVSAT		AFYKAQPVIE		FMCEVLDIRN		IDEQPKPLTD
SQRVRFTKEI		KGLKVEVTHC		GQMKRKYRVC		NVTRRPASHQ		TFPLQLESGQ
TVECTVAQYF		KQKYNLQLKY		PHLPCLQVGQ		EQKHTYLPLE		VCNIVAGQRC
IKKLTDNQTS		TMIKATARSA		PDRQEEISRL		MKNASYNLDP		YIQEFGIKVK
DDMTEVTGRV		LPAPILQYGG		RNRAIATPNQ		GVWDMRGKQF		YNGIEIKVWA
IACFAPQKQC		REEVLKNFTD		QLRKISKDAG		MPIQGQPCFC		KYAQGADSVE
PMFRHLKNTY		SGLQLIIVIL		PGKTPVYAEV		KRVGDTLLGM		ATQCVQVKNV
VKTSPQTLSN		LCLKINVKLG		GINNILVPHQ		RSAVFQQPVI		FLGADVTHPP
AGDGKKPSIT		AVVGSMDAHP		SRYCATVRVQ		RPRQEIIEDL		SYMVRELLIQ
FYKSTRFKPT		RIIFYRDGVP		EGQLPQILHY		ELLAIRDACI		KLEKDYQPGI
TYIVVQKRHH		TRLFCADKNE		RIGKSGNIPA		GTTVDTNITH		PFEFDFYLCS
HAGIQGTSRP		SHYYVLWDDN		RFTADELQIL		TYQLCHTYVR		CTRSVSIPAP
AYYARLVAFR		ARYHLVDKEH		DSGEGSHISG		QSNGRDPQAL		AKAVQVHQDT
LRTMYFA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chu C.-Y., Rana T.M. (2006). Translation repression in human cells by microRNA-induced gene silencing requires RCK/p54. PLoS Biol. 4: E210—E210. PMID 16756390 DOI:10.1371/journal.pbio.0040210
• Wu L., Fan J., Belasco J.G. (2008). Importance of translation and nonnucleolytic ago proteins for on-target RNA interference. Curr. Biol. 18: 1327—1332. PMID 18771919 DOI:10.1016/j.cub.2008.07.072
• Phalora P.K., Sherer N.M., Wolinsky S.M., Swanson C.M., Malim M.H. (2012). HIV-1 replication and APOBEC3 antiviral activity are not regulated by P bodies. J. Virol. 86: 11712—11724. PMID 22915799 DOI:10.1128/JVI.00595-12
• Ma J.-B., Ye K., Patel D.J. (2004). Structural basis for overhang-specific small interfering RNA recognition by the PAZ domain. Nature. 429: 318—322. PMID 15152257 DOI:10.1038/nature02519
• Faehnle C.R., Elkayam E., Haase A.D., Hannon G.J., Joshua-Tor L. (2013). The making of a slicer: activation of human Argonaute-1. Cell Rep. 3: 1901—1909. PMID 23746446 DOI:10.1016/j.celrep.2013.05.033

Див. також

• Хромосома 1