ABCA9

ABCA9 (англ. ATP binding cassette subfamily A member 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 624 амінокислот, а молекулярна маса — 184 362.

ABCA9
Ідентифікатори
Символи	ABCA9, EST640918, ATP binding cassette subfamily A member 9
Зовнішні ІД	OMIM: 612507 MGI: 2386796 HomoloGene: 33332 GeneCards: ABCA9
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • ATPase activity • ATP binding • ATPase-coupled transmembrane transporter activity • lipid transporter activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • lipid transport • трансмембранний транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10350	217262
Ensembl	ENSG00000154258	ENSMUSG00000041797
UniProt	Q8IUA7	Q8K449
RefSeq (мРНК)	NM_080283 NM_172386	NM_147220
RefSeq (білок)	NP_525022	NP_671753
Локус (UCSC)	Хр. 17: 68.97 – 69.06 Mb	Хр. 11: 109.99 – 110.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKRRMSVGQ		QTWALLCKNC		LKKWRMKRQT		LLEWLFSFLL		VLFLYLFFSN
LHQVHDTPQM		SSMDLGRVDS		FNDTNYVIAF		APESKTTQEI		MNKVASAPFL
KGRTIMGWPD		EKSMDELDLN		YSIDAVRVIF		TDTFSYHLKF		SWGHRIPMMK
EHRDHSAHCQ		AVNEKMKCEG		SEFWEKGFVA		FQAAINAAII		EIATNHSVME
QLMSVTGVHM		KILPFVAQGG		VATDFFIFFC		IISFSTFIYY		VSVNVTQERQ
YITSLMTMMG		LRESAFWLSW		GLMYAGFILI		MATLMALIVK		SAQIVVLTGF
VMVFTLFLLY		GLSLITLAFL		MSVLIKKPFL		TGLVVFLLIV		FWGILGFPAL
YTRLPAFLEW		TLCLLSPFAF		TVGMAQLIHL		DYDVNSNAHL		DSSQNPYLII
ATLFMLVFDT		LLYLVLTLYF		DKILPAEYGH		RCSPLFFLKS		CFWFQHGRAN
HVVLENETDS		DPTPNDCFEP		VSPEFCGKEA		IRIKNLKKEY		AGKCERVEAL
KGVVFDIYEG		QITALLGHSG		AGKTTLLNIL		SGLSVPTSGS		VTVYNHTLSR
MADIENISKF		TGFCPQSNVQ		FGFLTVKENL		RLFAKIKGIL		PHEVEKEVQR
VVQELEMENI		QDILAQNLSG		GQNRKLTFGI		AILGDPQVLL		LDEPTAGLDP
LSRHRIWNLL		KEGKSDRVIL		FSTQFIDEAD		ILADRKVFIS		NGKLKCAGSS
LFLKKKWGIG		YHLSLHLNER		CDPESITSLV		KQHISDAKLT		AQSEEKLVYI
LPLERTNKFP		ELYRDLDRCS		NQGIEDYGVS		ITTLNEVFLK		LEGKSTIDES
DIGIWGQLQT		DGAKDIGSLV		ELEQVLSSFH		ETRKTISGVA		LWRQQVCAIA
KVRFLKLKKE		RKSLWTILLL		FGISFIPQLL		EHLFYESYQK		SYPWELSPNT
YFLSPGQQPQ		DPLTHLLVIN		KTGSTIDNFL		HSLRRQNIAI		EVDAFGTRNG
TDDPSYNGAI		IVSGDEKDHR		FSIACNTKRL		NCFPVLLDVI		SNGLLGIFNS
SEHIQTDRST		FFEEHMDYEY		GYRSNTFFWI		PMAASFTPYI		AMSSIGDYKK
KAHSQLRISG		LYPSAYWFGQ		ALVDVSLYFL		ILLLMQIMDY		IFSPEEIIFI
IQNLLIQILC		SIGYVSSLVF		LTYVISFIFR		NGRKNSGIWS		FFFLIVVIFS
IVATDLNEYG		FLGLFFGTML		IPPFTLIGSL		FIFSEISPDS		MDYLGASESE
IVYLALLIPY		LHFLIFLFIL		RCLEMNCRKK		LMRKDPVFRI		SPRSNAIFPN
PEEPEGEEED		IQMERMRTVN		AMAVRDFDET		PVIIASCLRK		EYAGKKKNCF
SKRKKKIATR		NVSFCVKKGE		VIGLLGHNGA		GKSTTIKMIT		GDTKPTAGQV
ILKGSGGGEP		LGFLGYCPQE		NALWPNLTVR		QHLEVYAAVK		GLRKGDAMIA
ITRLVDALKL		QDQLKAPVKT		LSEGIKRKLC		FVLSILGNPS		VVLLDEPSTG
MDPEGQQQMW		QVIRATFRNT		ERGALLTTHY		MAEAEAVCDR		VAIMVSGRLR
CIGSIQHLKS		KFGKDYLLEM		KLKNLAQMEP		LHAEILRLFP		QAAQQERFSS
LMVYKLPVED		VRPLSQAFFK		LEIVKQSFDL		EEYSLSQSTL		EQVFLELSKE
QELGDLEEDF		DPSVKWKLLL		QEEP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані.

Література

• Piehler A., Kaminski W.E., Wenzel J.J., Langmann T., Schmitz G. (2002). Molecular structure of a novel cholesterol-responsive A subclass ABC transporter, ABCA9. Biochem. Biophys. Res. Commun. 295: 408—416. PMID 12150964 DOI:10.1016/S0006-291X(02)00659-9
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 17