Тромбомодулін

THBD (англ. Thrombomodulin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 575 амінокислот, а молекулярна маса — 60 329.

THBD
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ADX, 1DQB, 1DX5, 1EGT, 1FGD, 1FGE, 1HLT, 1TMR, 1ZAQ, 2ADX, 3GIS
Ідентифікатори
Символи	THBD, AHUS6, BDCA3, CD141, THPH12, THRM, TM, thrombomodulin, BDCA-3
Зовнішні ІД	OMIM: 188040 MGI: 98736 HomoloGene: 308 GeneCards: THBD
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane signaling receptor activity • signaling receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • cell surface • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • apicolateral plasma membrane • vacuolar membrane • міжклітинний простір Біологічний процес • гемостаз • жіноча вагітність • negative regulation of platelet activation • response to lipopolysaccharide • response to cAMP • negative regulation of fibrinolysis • зсідання крові • response to X-ray • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of blood coagulation • leukocyte migration Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7056	21824
Ensembl	ENSG00000178726	ENSMUSG00000074743
UniProt	P07204	P15306
RefSeq (мРНК)	NM_000361	NM_009378
RefSeq (білок)	NP_000352	NP_033404
Локус (UCSC)	Хр. 20: 23.05 – 23.05 Mb	Хр. 2: 148.25 – 148.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLGVLVLGAL		ALAGLGFPAP		AEPQPGGSQC		VEHDCFALYP		GPATFLNASQ
ICDGLRGHLM		TVRSSVAADV		ISLLLNGDGG		VGRRRLWIGL		QLPPGCGDPK
RLGPLRGFQW		VTGDNNTSYS		RWARLDLNGA		PLCGPLCVAV		SAAEATVPSE
PIWEEQQCEV		KADGFLCEFH		FPATCRPLAV		EPGAAAAAVS		ITYGTPFAAR
GADFQALPVG		SSAAVAPLGL		QLMCTAPPGA		VQGHWAREAP		GAWDCSVENG
GCEHACNAIP		GAPRCQCPAG		AALQADGRSC		TASATQSCND		LCEHFCVPNP
DQPGSYSCMC		ETGYRLAADQ		HRCEDVDDCI		LEPSPCPQRC		VNTQGGFECH
CYPNYDLVDG		ECVEPVDPCF		RANCEYQCQP		LNQTSYLCVC		AEGFAPIPHE
PHRCQMFCNQ		TACPADCDPN		TQASCECPEG		YILDDGFICT		DIDECENGGF
CSGVCHNLPG		TFECICGPDS		ALARHIGTDC		DSGKVDGGDS		GSGEPPPSPT
PGSTLTPPAV		GLVHSGLLIG		ISIASLCLVV		ALLALLCHLR		KKQGAARAKM
EYKCAAPSKE		VVLQHVRTER		TPQRL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як зсідання крові, гемостаз. Локалізований у мембрані.

Література

• Jackman R.W., Beeler D.L., Fritze L., Soff G., Rosenberg R.D. (1987). Human thrombomodulin gene is intron depleted: nucleic acid sequences of the cDNA and gene predict protein structure and suggest sites of regulatory control. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 6425—6429. PMID 2819876 DOI:10.1073/pnas.84.18.6425
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Meininger D.P., Hunter M.J., Komives E.A. (1995). Synthesis, activity, and preliminary structure of the fourth EGF-like domain of thrombomodulin. Protein Sci. 4: 1683—1695. PMID 8528067 DOI:10.1002/pro.5560040904
• Hrabal R., Komives E.A., Ni F. (1996). Structural resiliency of an EGF-like subdomain bound to its target protein, thrombin. Protein Sci. 5: 195—203. PMID 8745396 DOI:10.1002/pro.5560050202
• Sampoli Benitez B.A., Hunter M.J., Meininger D.P., Komives E.A. (1997). Structure of the fifth EGF-like domain of thrombomodulin: an EGF-like domain with a novel disulfide-bonding pattern. J. Mol. Biol. 273: 913—926. PMID 9367781 DOI:10.1006/jmbi.1997.1356
• Faioni E.M., Franchi F., Castaman G., Biguzzi E., Rodeghiero F. (2002). Mutations in the thrombomodulin gene are rare in patients with severe thrombophilia. Br. J. Haematol. 118: 595—599. PMID 12139752 DOI:10.1046/j.1365-2141.2002.03644.x

Див. також

• Хромосома 20