TOP1
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
TOP1 (англ. Topoisomerase (DNA) I) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 765 амінокислот, а молекулярна маса — 90 726[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSGDHLHNDS | QIEADFRLND | SHKHKDKHKD | REHRHKEHKK | EKDREKSKHS | ||||
NSEHKDSEKK | HKEKEKTKHK | DGSSEKHKDK | HKDRDKEKRK | EEKVRASGDA | ||||
KIKKEKENGF | SSPPQIKDEP | EDDGYFVPPK | EDIKPLKRPR | DEDDADYKPK | ||||
KIKTEDTKKE | KKRKLEEEED | GKLKKPKNKD | KDKKVPEPDN | KKKKPKKEEE | ||||
QKWKWWEEER | YPEGIKWKFL | EHKGPVFAPP | YEPLPENVKF | YYDGKVMKLS | ||||
PKAEEVATFF | AKMLDHEYTT | KEIFRKNFFK | DWRKEMTNEE | KNIITNLSKC | ||||
DFTQMSQYFK | AQTEARKQMS | KEEKLKIKEE | NEKLLKEYGF | CIMDNHKERI | ||||
ANFKIEPPGL | FRGRGNHPKM | GMLKRRIMPE | DIIINCSKDA | KVPSPPPGHK | ||||
WKEVRHDNKV | TWLVSWTENI | QGSIKYIMLN | PSSRIKGEKD | WQKYETARRL | ||||
KKCVDKIRNQ | YREDWKSKEM | KVRQRAVALY | FIDKLALRAG | NEKEEGETAD | ||||
TVGCCSLRVE | HINLHPELDG | QEYVVEFDFL | GKDSIRYYNK | VPVEKRVFKN | ||||
LQLFMENKQP | EDDLFDRLNT | GILNKHLQDL | MEGLTAKVFR | TYNASITLQQ | ||||
QLKELTAPDE | NIPAKILSYN | RANRAVAILC | NHQRAPPKTF | EKSMMNLQTK | ||||
IDAKKEQLAD | ARRDLKSAKA | DAKVMKDAKT | KKVVESKKKA | VQRLEEQLMK | ||||
LEVQATDREE | NKQIALGTSK | LNYLDPRITV | AWCKKWGVPI | EKIYNKTQRE | ||||
KFAWAIDMAD | EDYEF |
Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, топоізомераз. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література ред.
- Kunze N., Klein M., Richter A., Knippers R. (1990). Structural characterisation of the human DNA topoisomerase I gene promoter. Eur. J. Biochem. 194: 323—330. PMID 2176592 DOI:10.1111/j.1432-1033.1990.tb15620.x
- Oddou P., Schmidt U., Knippers R., Richter A. (1988). Monoclonal antibodies neutralizing mammalian DNA topoisomerase I activity. Eur. J. Biochem. 177: 523—529. PMID 2461859 DOI:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14404.x
- Maul G.G., Jimenez S.A., Riggs E., Ziemnicka-Kotula D. (1989). Determination of an epitope of the diffuse systemic sclerosis marker antigen DNA topoisomerase I: sequence similarity with retroviral p30gag protein suggests a possible cause for autoimmunity in systemic sclerosis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 8492—8496. PMID 2479024 DOI:10.1073/pnas.86.21.8492
- Khopde S., Simmons D.T. (2008). Simian virus 40 DNA replication is dependent on an interaction between topoisomerase I and the C-terminal end of T antigen. J. Virol. 82: 1136—1145. PMID 18003733 DOI:10.1128/JVI.01314-07
- Onishi Y., Kawano Y. (2012). Rhythmic binding of Topoisomerase I impacts on the transcription of Bmal1 and circadian period. Nucleic Acids Res. 40: 9482—9492. PMID 22904072 DOI:10.1093/nar/gks779
- Bandyopadhyay K., Li P., Gjerset R.A. (2012). CK2-mediated hyperphosphorylation of topoisomerase I targets serine 506, enhances topoisomerase I-DNA Binding, and increases cellular camptothecin sensitivity. PLoS ONE. 7: E50427—E50427. PMID 23185622 DOI:10.1371/journal.pone.0050427
Примітки ред.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з DNA topoisomerase I переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11986 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P11387 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також ред.
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |