H1FOO

H1FOO (англ. H1 histone family member O oocyte specific) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот, а молекулярна маса — 35 813.

H1FOO
Ідентифікатори
Символи	H1-8, osH1, H1.8, H1oo, H1 histone family member O, oocyte specific, H1 histone family member O oocyte specific, H1.8 linker histone, H1FOO
Зовнішні ІД	MGI: 2176207 HomoloGene: 51377 GeneCards: H1-8
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleosomal DNA binding • double-stranded DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • Нуклеосома • екзосома • ядерце • клітинне ядро • хромосома • female germ cell nucleus Біологічний процес • nucleosome assembly • GO:0007126 мейоз • regulation of DNA methylation • negative regulation of stem cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chromosome condensation • negative regulation of DNA recombination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	132243	171506
Ensembl	ENSG00000178804	ENSMUSG00000042279
UniProt	Q8IZA3	Q8VIK3
RefSeq (мРНК)	NM_001308262 NM_153833	NM_138311 NM_001346702
RefSeq (білок)	NP_001295191 NP_722575	NP_001333631 NP_612184
Локус (UCSC)	Хр. 3: 129.54 – 129.55 Mb	Хр. 6: 115.92 – 115.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPGSVTSDI		SPSSTSTAGS		SRSPESEKPG		PSHGGVPPGG		PSHSSLPVGR
RHPPVLRMVL		EALQAGEQRR		GTSVAAIKLY		ILHKYPTVDV		LRFKYLLKQA
LATGMRRGLL		ARPLNSKARG		ATGSFKLVPK		HKKKIQPRKM		APATAPRRAG
EAKGKGPKKP		SEAKEDPPNV		GKVKKAAKRP		AKVQKPPPKP		GAATEKARKQ
GGAAKDTRAQ		SGEARKVPPK		PDKAMRAPSS		AGGLSRKAKA		KGSRSSQGDA
EAYRKTKAES		KSSKPTASKV		KNGAASPTKK		KVVAKAKAPK		AGQGPNTKAA
APAKGSGSKV		VPAHLSRKTE		APKGPRKAGL		PIKASSSKVS		SQRAEA

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як мейоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

• Tanaka Y., Kato S., Tanaka M., Kuji N., Yoshimura Y. (2003). Structure and expression of the human oocyte-specific histone H1 gene elucidated by direct RT-nested PCR of a single oocyte. Biochem. Biophys. Res. Commun. 304: 351—357. PMID 12711322 DOI:10.1016/S0006-291X(03)00610-7
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3