Онтологічна інженерія: відмінності між версіями
| [неперевірена версія] | [неперевірена версія] |
Вилучено вміст Додано вміст
м виправлення дат |
м повідомлення про помилки вікіфікації |
||
Рядок 22:
== Онтологічний інжиніринг в науках про життя ==
Науки про життя процвітає з онтологіями, які біологи використовують для визначення змісту своїх експериментів. Для виведення правильних висновків з експериментів, онтології повинні бути структуровані оптимально базам знань, які вони представляють. Структура онтології повинна постійно змінюватися так, щоб створити точне представлення {{нп|Domain model|моделі предметної області|en|Domain model}}<!-- Проблема вікіфікації: Сторінка [[:en:Domain model]] перекладена як [[Модель предметної області]], хоча хотіли [[Domain model]] (SashkoR0B0T)-->.
Останнім часом автоматизований метод онтологічного інжинірингу був введений в науках про життя, наприклад [[Gene Ontology|генні онтології]] (ГО),<ref>{{cite journal |pmid=20139945 |year=2010 |last1=Alterovitz |first1=G |last2=Xiang |first2=M |last3=Hill |first3=DP |last4=Lomax |first4=J |last5=Liu |first5=J |last6=Cherkassky |first6=M |last7=Dreyfuss |first7=J |last8=Mungall |first8=C |last9=Harris |first9=MA |title=Ontology engineering |volume=28 |issue=2 |pages=128–30 |doi=10.1038/nbt0210-128 |journal=Nature biotechnology}}</ref> одна з найбільш успішних і широко використовуваних біомедичних онтологій.<ref>{{cite journal |url=http://www.geneontology.org/GO_nature_genetics_2000.pdf |doi=10.1038/75556 |year=2000 |last1=Botstein |first1=David |last2=Cherry |first2=J. Michael |last3=Ashburner |first3=Michael |last4=Ball |first4=Catherine A. |last5=Blake |first5=Judith A. |last6=Butler |first6=Heather |last7=Davis |first7=Allan P. |last8=Dolinski |first8=Kara |last9=Dwight |first9=Selina S. |journal=Nature Genetics |volume=25 |pages=25–9 |pmid=10802651 |title=Gene ontology: Tool for the unification of biology. The Gene Ontology Consortium |issue=1 |pmc=3037419 |accessdate=18 грудня 2011 |archiveurl=https://web.archive.org/web/20110526092101/http://www.geneontology.org/GO_nature_genetics_2000.pdf |archivedate=26 травня 2011 |deadurl=yes }}</ref> Базуючись на теорії інформації, вона перебудовує онтології, так що рівні являють собою бажану специфіку концепцій. Аналогічні підходи теорії інформації також були використані для оптимального розбиття генної онтології.<ref>{{cite journal |doi=10.1093/nar/gkl799 |title=GO PaD: The Gene Ontology Partition Database |year=2007 |last1=Alterovitz |first1=G. |last2=Xiang |first2=M. |last3=Mohan |first3=M. |last4=Ramoni |first4=M. F. |journal=Nucleic Acids Research |volume=35 |pages=D322–7 |pmid=17098937 |issue=Database issue |pmc=1669720}}</ref> Враховуючи математичну природу таких інженерних [[Алгоритм|алгоритмів]], ці оптимізації можуть бути автоматизовані для розробки науково-теоретичної та масштабованої архітектури для перебудови онтологій, наприклад таких як ГО.
Рядок 37:
== Програмне забезпечення для онтологічного інжинірингу ==
* {{нп|DOGMA|DOGMA|en|DOGMA}}
* {{нп|DogmaModeler|DogmaModeler|en|DogmaModeler}}<!-- Проблема вікіфікації: Не знайдено сторінки [[:en:DogmaModeler]] (SashkoR0B0T)-->
* {{нп|KAON|KAON|en|KAON}}
* {{нп|OntoClean|OntoClean|en|OntoClean}}
| |||