1957 року його багатообіцяюча кар'єра була припинена, бо він був засуджений на п'ять років за шпигунство разом з трьома іншими товаришами по команді — {{нп|[[Віктор ТегельхоффТегельгофф|Віктором Тегельхоффом|cs|Viktor Tegelhoff}}]], {{нп|Павол Бенья|Паволом Бенья|cs|Pavol Beňa}} та {{нп|Ладислав Штайнер|Ладиславом Штайнером|cs|Ladislav Steiner}}. Це було пов'язано із зустрічами з групою словацьких емігрантів, з якими він робив невеликий бізнес, який на той час був незаконним. Державна безпека навіть стверджувала, що Бенедикович хотів організувати групу футболістів для шпигунської діяльності. Відбував покарання у в'язниці міста [[Яхимів]]. Через три роки його звільнили<ref>{{Cite web|url=http://www.jkbalazs.sk/index.php?option=com_content&task=view&id=131&Itemid=1|title=Michal Benedikovič – futbalista, ktorého zničila ŠtB|author=|website=jkbalazs.sk|lang=словац.|accessdate=3 лютого 2020|archive-date=29 вересня 2007|archive-url=https://web.archive.org/web/20070929184918/http://www.jkbalazs.sk/index.php?option=com_content&task=view&id=131&Itemid=1}}</ref>.
