Відмінності між версіями «Agrobacterium tumefaciens»

→‎Геном: Кирилиця.
(Виправлено джерел: 0; позначено як недійсні: 1. #IABot (v2.0beta16))
(→‎Геном: Кирилиця.)
Кільцева хромосома ''A. tumefaciens'' штаму С58 має розмір 2841580 [[пар основ]] і містить 2819 [[ген]]ів, з яких 2765 кодують [[білок|білки]]<ref>{{cite web| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=genome&cmd=Retrieve&dopt=Overview&list_uids=189 | title = ''Agrobacterium tumefaciens'' str. C58 chromosome circular, complete sequence | work = [[NCBI]]}}</ref>. Лінійна хромосома має розмір 2075577 пар основ і містить 1884 генів, з яких 1851 кодують білки<ref>{{cite web| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=genome&cmd=Retrieve&dopt=Overview&list_uids=190 | title = ''Agrobacterium tumefaciens'' str. C58 chromosome linear, complete sequence | work = [[NCBI]]}}</ref>. Наявність кільцевої і лінійної хромосоми характерна і для інших штамів ''A. tumefaciens'', наприклад штаму MAFF301001<ref name=Wood/>.
 
[[Файл:Ti_plasmidTi plasmid-ru.svg|thumb|left|Мапа Ti-плазміди ''A. tumefaciens'']]
 
''A. tumefaciens'' штаму С58 містить два плазміди: At-плазміду і [[Ti-плазміда|Ti-плазміду]]. At-плазмида (від ''Agrobacterium tumefaciens'') є кільцевою дволанцюжковою молекулою [[ДНК]] розміром 542868 пар основ і містить 557 генів, з яких 542 кодують білки<ref>{{cite web| url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=genome&cmd=Retrieve&dopt=Overview&list_uids=191 | title = ''Agrobacterium tumefaciens'' str. C58 plasmid At, complete sequence | work = [[NCBI]]}}</ref>. Ti-плазмида (від {{lang-en|tumor inducing}}) обумовлює [[патогенність]] ''A. tumefaciens'' і здатна вбудовуватися в геном рослини-господаря, переносячи Т-ДНК в процесі [[сайт-специфічна рекомбінація|сайт-специфічної рекомбінації]]<ref>{{cite journal | title = Site-Specific Integration of Agrobacterium tumefaciens T-DNA via Double-Stranded Intermediates | url = http://www.plantphysiol.org/cgi/content/abstract/133/3/1011| author = Tzfira T, Frankman LR, Vaidya M, Citovsky V | journal = Plant Physiol. | year = 2003 | volume = 133 | issue = 3 | pages = 1011-23}}</ref><ref>{{cite journal | title = Involvement of KU80 in T-DNA integration in plant cells | url = http://www.pnas.org/content/102/52/19231.full | author = Li J, Vaidya M, White C, Vainstein A, Citovsky V, Tzfira T | journal = Proc Natl Acad Sci U S A | year = 2005 | volume = 102 | issue = 52 | pages = 19231-6 | pmid = 16380432}}</ref>, плазміда також може частково вбудовуватися в геном ''[[Saccharomyces cerevisiae]]'' шляхом незаконної рекомбінації<ref>{{cite journal | title = Integration of Agrobacterium tumefaciens T-DNA | url = http://www.pnas.org/content/93/26/15272.abstract | author = Paul Bundock and Paul J. J. Hooykaas | journal = PNAS | volume = 93 | year = 1996 | issue = 26 | pages = 15272-15275}}</ref>. Проте зараження [[хатня миша|мишей]] патогенними ''A. tumefaciens'' не викликає [[експресія генів|експресії]] генів-репортерів в тканинах<ref>{{cite journal | title = ''Agrobacterium tumefaciens''-Induced Bacteraemia Does Not Lead to Reporter Gene Expression in Mouse Organs | url = http://www.plosone.org/article/info:doi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0002352 | author = Igor V. Petrunia et. al | journal = PLoS Biology | year = 2008 | volume = 3 | issue = 6 | pages = e2352 | doi = 10.1371/journal.pone.0002352}}</ref>. Ti-плазміда ''A. tumefaciens'' штаму С58 є кільцевою двуцепочечную молекулою ДНК розміром 214233 пар основ і містить 199 генів, з яких 197 кодують білки<ref>{{cite web | url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=genome&cmd=Retrieve&dopt=Overview&list_uids=192 | title = ''Agrobacterium tumefaciens'' str. C58 Ti plasmid, complete sequence | work = [[NCBI]]}}</ref>. Ця плазміда містить гени, що контролюють біосинтез і [[катаболізм]] специфічних [[амінокислоти|амінокислот]],&nbsp;— [[опіни|опінів]]<ref>{{cite journal | title = Diversity of Opines and Opine-Catabolizing Bacteria Isolated from Naturally Occurring Crown Gall Tumors | url = http://aem.asm.org/cgi/reprint/63/1/201?view=long&pmid=16535484 | author = Larry Moore, William Scott, and Marilyn Canfield | journal = Appl. Env. Mocrobiol. | year = 1997 | pages = 201–207 | volume = 63 | issue = 1}}</ref>, що використовуються як джерело живляння цієї бактерії (октопін, нопалін, агропін)<ref>{{cite web|title=Ti-плазмида|url=http://www.dictionary.cbio.ru/termin.php?id=1046|work=Cbio.ru|archiveurl=https://www.webcitation.org/6Hg8Lb9Am?url=http://www.dictionary.cbio.ru/termin.php?id=1046|archivedate=2013-06-27|accessdate=2008-09-23|deadurl=no}}</ref>, гени вірулентності, гени синтезу [[фітогормон]]ів&nbsp;— [[цитокінін]]ів і [[ауксин]]ів (власне вони викликають утворення пухлин і дедиференціювання тканин рослини), Т-ДНК власне і є інтегрованою ділянкою Ti-плазміди, що несе гени синтезу фітогормонов і опінів<ref>{{cite web
307

редагувань