Вікіпедія

ДНК-метилтрансфераза: відмінності між версіями

Інтерактивний перегляд історії
[перевірена версія][перевірена версія]
← Попереднє редагуванняНаступне редагування →
Вилучено вміст Додано вміст
ВізуальнийВікірозмітка
Немає опису редагування
Рядок 16:
== ДНК-метилтрансферази ссавців ==
 
У [[ссавці]]в виявлені чотири активних ДНК-метилтрансферази: [[DNMT1]], [[TRDMT1|DNMT2]] (TRDMT1), [[DNMT3A|DNMT3a]] і [[DNMT3B|DNMT3b]]. Також виявлений білок, структурно схожий з сімействомродиною DNMT3, але який не проявляє метилтрансферазної активності — [[DNMT3L]] (DNMT3-''like'').
 
=== СімействоРодина DNMT1 ===
 
ДНК-метилтрансферази сімействародини DNMT1 [[домашня миша|миші]] є білками з [[Молекулярна маса|молекулярною масою]] близько 190 [[атомна одиниця маси|кДа]], що містить 1620 [[Амінокислота|амінокислотних залишків]]. Основна активність цього ферменту полягає в метилюванні напівметильованих ділянок CpG. Молекула ДНК-метилтрансферази DNMT1 значно більше прокаріотичного ферменту за рахунок наявності N-кінцевої регуляторної ділянки, що становить <sup>2</sup>/<sub>3</sub>, від всієї довжини поліпептидного ланцюга. Саме ця ділянка відповідає за надання «переваги» ферментом напівметильованим ділянкам перед неметильованими. Регуляторна N-кінцева ділянка сполучена з каталітичним C-кінцевим при допомозі [[гліцин|Gly]]-[[лізин|Lys]]-півторівповторів. Вважається, що [[ген]] ''dnmt1'' утворився шляхом злиття гену прокаріотичної ДНК-метилтрансферази з одним або двома генами [[ДНК-зв'язуючі білки|ДНК-зв'язуючих білків]].
 
{| class="standard" style="margin-left: 1em;" align="right"
Рядок 34:
| та ж
|-
| [[HDAC1]]
| [[деацетилаза]] [[гістон]]ів
|-
| [[HDAC2]]
| та ж
|-
| [[SUV39H1]]
| метилтрансфераза <br /> гістона H3 (Lys9)
|-
Рядок 46:
| пухлинний супресор
|-
| [[Білок промієлоцитарного лейкозу|PML]]-[[RARA|RAR]]
| PML-RAR
| [[онкоген]]ний <br /> транскрипційний фактор
|-
| [[DMAP1]]
| транскрипційний <br /> [[корепресор]]
|-
| [[SMARCA5|hSNF2H]]
| білок, задіяний <br /> ву перестройкахперебудовах <br /> [[хроматин]]у
|-
| [[Ядерний антиген проліферуючих клітин|PCNA]]
| PCNA
| фактор <br /> реплікації ДНК
|-
| [[MBD2]]
| зв'язування з <br /> метилбованими CpG <br /> ділянками
|-
| [[MBD3]]
| та ж
|-
| [[MECP2|MeCP2]]
| та ж
|-
| [[CBX1|HP1β]]
| білок <br /> гетерохроматину
|-
Рядок 73:
| [[РНК-полімераза|РНК-полімераза II]]
|-
| rowspan=8 | [[DMNT3A|DNMT3a]]
| [[DNMT1]]
| підтримуюче <br /> метилювання ДНК
|-
| [[DNMT3L]]
| репресор транскрипції
|-
| [[HDAC1]]
| [[деацетилаза]] гістонів
|-
| [[SUV39H1]]
| метилтрансфераза <br /> гістону H3 (Lys9)
|-
Рядок 89:
| онкогенний <br /> транскрипційний фактор
|-
| [[ZBTB18|RP58]]
| транскрипційний <br /> корепресор
|-
Рядок 95:
| білок <br /> гетерохроматину
|-
| SUMO-1[[SUMO1]]
| [[убіквітин]]-подібний <br /> білок
|-
Рядок 121:
| деацетилаза гістонів
|-
| [[CMT3]]
| гомолог HP1
| білок <br /> гетерохроматину
Рядок 136:
Інактівация мишиного ферменту DNMT1 приводить до значного (до 70&nbsp;%) зменшення рівня метилювання [[геном]]у і до загибелі [[ембріон]]ів, шо розвиваються, на 10-11 день розвитку. Рівень, що залишився, в 30&nbsp;% і здібність [[стовбурові клітини|стовбурових клітин]] до метилювання [[ретровірус]]ної ДНК ''de novo'' забезпечуються іншими ДНК-метилтрансферазами.
 
=== СімействоРодина DNMT2 (TRDMT1) ===
 
ДНК-метилтрансфераза DNMT2 складається з 415-ти амінокислотних залишків і не містить N-кінцевого регуляторного домена. Інактівація гена dnmt2 у [[Стовбурові клітини|стовбурових клітинах]] мишей не впливає на їхні здібності до підтримки картини метилювання геному і до метилювання ''de novo''. Амінокислотна послідовність ферменту схожа з послідовностями коротких ДНК-метилтрансфераз рослин, грибів і прокаріотів. У 2006 році Goll et al. показали, що фермент проводить метилювання [[тРНК]]<sup>Asp</sup> по цитозину-38 як ''[[in vivo]]'', так і ''[[in vitro]]'', і не метилює ДНК. Щоб відобразити функцію ферменту в назві, було вирішено перейменувати його в TRDMT1 (''tRNA aspartic acid methyltransferase'' 1, метілтрансфераза тРНК, що транспортує [[Аспарагінова кислота|аспарагінову кислоту]]).
Рядок 144:
ДНК-метилтрансферази DNMT3a і DNMT3b проводять метилювання навівметильованих і неметильованих ділянок CpG з однаковою швидкістю. Людські DNMT3a і DNMT3b містять 908 і 859 амінокислотних залишків, відповідно; ген dnmt3b може кодувати і менші поліпептиди унаслідок [[альтернативний сплайсинг|альтернативного сплайсингу]]. Гени dnmt3a і dnmt3b активно [[експресія генів|експресуються]] в [[диференціація клітин|недиференційованих]] ембріональних стовбурових клітинах, тоді як в диференційованих клітинах рівень їх експресії дуже низький. Інактівация цих генів у мишей приводить до загибелі особин, в середньому, до чотиритижневого віку.
 
DNMT3a активніше метилює ділянки CpG, ніж CPA, CPT, і CPC. DNMT3a метилює ділянки CpG набагато повільніші, ніж DNMT1, але швидше, ніж DNMT3b. Не зважаючи на те, що функції ферментів DNMT3a і DNMT3b багато в чому перекриваються, є також і відмінності. Так, DNMT3b відповідає за метилювання повторів [[Тандемні повтори#Сателіти|сателітів]] в області лінкера, а мутація гена ''dnmt3b'' у людини приводить до [[ICF-синдром]]у (''immunodeficiency cenromeric instability'', імунодефіцитна нестабільність [[центромера|центромер]], аномалії обличчя). ICF-синдром&nbsp;— це рідкісне [[аутосома|аутосомне]] рецесивне [[генетичне захворювання]], яке характеризується дефектами [[імунна система|імунної системи]] і порушенням нормальної будови обличчя. Синдром пов'язаний з нестабільністю центромерного гетерохромаину. При цьому основні компоненти гетерохроматіну, ділянки сателітів DNA II і DNA III, виявляються недостатньо метильованими.
 
DNMT3L містить DNA-метилтрансферазний мотив і є необхідною для ефекту материнського [[геномний імпринтинг|геномного імпринтингу]], залишаючись при цьому каталітично неактивною (унаслідок відсутності деяких ключових ділянок, необхідних для здійснення каталізу). DNMT3L експресується при [[гаметогенез]]і, коли і відбувається імпринтінг геному. Відсутність DNMT3L приводить до біаллельнійбіалельної експресії генів, для яких в нормі не характерна експресія материнського [[аллельалель|аллеляалеля]]. DNMT3L взаємодіє з DNMT3a і DNMT3b ву клітинному ядрі. Хоча DNMT3L нездібнанездатна проводити метилювання, білок може брати участь в репресії [[Транскрипція (біологія)|транскрипції]] (у асоціації з гістоновою деацетілазою).
 
{{Без джерел|дата=липень 2013}}
{{mol_bioprotein-stub}}
 
[[Категорія:Епігенетика]]
Отримано з https://uk.wikipedia.org/wiki/ДНК-метилтрансфераза