Вікіпедія

Кільцеві РНК: відмінності між версіями

Інтерактивний перегляд історії
[перевірена версія][перевірена версія]
Наступне редагування →
Вилучено вміст Додано вміст
ВізуальнийВікірозмітка
 
мНемає опису редагування
Мітка: редагування коду 2017
Рядок 1:
[[File:CircRNA.svg|thumb|400px|Формування кільцевих РНК. Пре-мРНК проходить сплайсинг, інтрони (темні лінії) вирізаються і з'єднуються екзони (різнокольрові чотирикутники) '''A'''. Канонічний сплайсинг продукує зрілі мРНК та їх [[Альтернативний сплайсинг|сплайс-варіанти]]. Кожна мРНК має кеп та полі-A-хвіст. '''B''' формування кільцевих РНК. Кільцеві РНК можуть складатися з одного та більше екзонів, іноді інтрон включений (темна лінія поряд з другим екзоном)]]
'''Кільцеві РНК''' ({{Lang-en|circRNA, circular RNA}}) молекули [[РНК]] які формують кільце. Кільцеві РНК спостерігаються у різноманітних організмів: [[Археї|архей]], [[Рослини|рослин]], [[Тварини|тварин]], включаючи людину. Кільцеві РНК належать до [[Некодуючі РНК|некодуючих РНК]]&nbsp;— в їх послідовності не закодована послідовність [[Білки|білків]]. Кільцеві РНК формуються найчастіше під час [[сплайсинг]]у. Довжина кільцевих РНК від 100 [[Нуклеотиди|нуклеотидів]] до 4 тисяч нуклеотидів, з середньою довжиною в [[клітина]]х людини&nbsp;— декілька сотень нуклеотидів<ref name="Detecting circular RNAs">{{Cite news|url=http://www.nature.com/doifinder/10.1038/nrg.2016.114|title=Detecting circular RNAs: bioinformatic and experimental challenges|last=Szabo|first=Linda|last2=Salzman|first2=Julia|pages=679–692|work=[[Nature Reviews Genetics]]|volume=17|doi=10.1038/nrg.2016.114|issue=11}}</ref> Через відсутність вільних 5- та 3- кінців кільцеві РНК стабільні, адже не ріжуться екзонуклеазами. Кільцеві РНК [[Експресія генів|експресуються]] на стабільному рівні, тканино-спецефічно та можуть бути основною формою експресії певних [[ген]]ів.
 
== Біогенез ==
{{Main|Процесинг РНК}}
Кільцеві РНК найчастіше за все формуються під час так званого зворотного сплайсингу ({{Lang-en|backsplicing}}) при формуванні [[Ковалентний зв'язок|ковалентного зв'язку]] між 5'-сплайс сайтом одного [[екзон]]у та 3'-сплайс-сайтом іншого, наступного екзону лінійної РНК, причомуіноді частішеекзон може бути не безпосередньо наступним, а через декілька екзонів. Частіше за все ці сплайс сайти є канонічними. Тобто замість вирізання [[інтрон]]у, та зшивання кінців екзонів, під час зворотного сплайсингу кінці екзонів зшиваються таким чином, що молекула РНК формує кільце: перший 5' кінець першого екзону з'єднується з останнім 3'-сплайс сайтом останнього екзону.<ref name="Detecting circular RNAs"/>
 
До кільцевих РНК потрапляє зазвичай 2-3 екзони, іноді до послідовності кільцевих РНК потрапляють і інтрони.
Рядок 10:
 
== Функції ==
Роль так само як і еволюційна консервативність кільцевих РНК є предметом активних досліджень. Але на початок 2017 року є дослідження, що вказують на те, що кільцеві РНК можуть виконувати роль губок для [[мікроРНК]] у [[Головний мозок|мозку]] ссавців: кільцева РНК що утворюється з [[Антисенсові РНК|антизмістовногоантисенсного транскрипту]] CDR1AS до мозочкового пов'язаного з дегенерацією білка 1 (cerebellar degeneration-related protein 1, CDR1)<ref>Білок CDR1 людини в датабазі {{UniProt|P51861}}</ref> у людини містить 70 сайтів зв'язування до мікроРНК 7 miR-7<ref>{{Cite news|url=http://www.nature.com/doifinder/10.1038/nrg3606|title=Long non-coding RNAs: new players in cell differentiation and development|last=Fatica|first=Alessandro|last2=Bozzoni|first2=Irene|pages=7–21|work=[[Nature Reviews Genetics]]|volume=15|doi=10.1038/nrg3606|issue=1}}</ref> Також кільцеві РНК можуть бути задіяні в регуляції альтернативного сплайсингу та активності експресії певних генів.<ref>{{Cite news|url=http://www.nature.com/articles/srep40342|title=CircRNA_000203 enhances the expression of fibrosis-associated genes by derepressing targets of miR-26b-5p, Col1a2 and CTGF, in cardiac fibroblasts|last=Tang|first=Chun-Mei|last2=Zhang|first2=Ming|last3=Huang|first3=Lei|last4=Hu|first4=Zhi-qin|last5=Zhu|first5=Jie-Ning|last6=Xiao|first6=Zhen|last7=Zhang|first7=Zhuo|last8=Lin|first8=Qiu-xiong|last9=Zheng|first9=Xi-Long|date=2017-01-12|language=en|work=Scientific Reports|volume=7|doi=10.1038/srep40342|issn=2045-2322|pmc=PMC5228128|pmid=28079129|accessdate=2017-02-20}}</ref>
 
Кільцеві РНК є дуже стабільними за відсутність відкритих липких кінців і, відповідно, меншу доступність до [[Нуклеази|нуклеаз]]. Через це кільцеві РНК з активних генів накопичуються, при чому чим більше живе клітина, чим більше вона перебуває у [[G0-фаза|G0 стадії]] та не [[Мітоз|ділиться]], тим більше накопичуються в ній кільцеві РНК. Так у клітинах з високим проліферативним потенціалом, як пухлинні клітини чи клітини тканин що швидко відновлюються у здорових людей, кільцевих РНК менше ніж у клітин, які не діляться, як то [[нейрон]]и. Таким чином у мозку при старінні накопичуються кільцеві РНК проте питання щодо функцій, які вони виконують там, залишається нез'ясованим на 2017 рік.<ref>{{Cite news|url=http://www.nature.com/articles/srep38907|title=CircRNA accumulation in the aging mouse brain|last=Gruner|first=Hannah|last2=Cortés-López|first2=Mariela|last3=Cooper|first3=Daphne A.|last4=Bauer|first4=Matthew|last5=Miura|first5=Pedro|date=2016-12-13|language=en|work=Scientific Reports|volume=6|doi=10.1038/srep38907|issn=2045-2322|pmc=PMC5153657|pmid=27958329|accessdate=2017-02-20}}</ref>
 
== Вивчення ==
Отримано з https://uk.wikipedia.org/wiki/Кільцеві_РНК