У 2016 році добровільно відмовився від депутатського мандату у в зв'язку із скандалом навколо розслідування, яке проводить Національне Антикорупційне бюро України щодо його можливої причетності до корупції [http://espreso.tv/news/2015/12/23/martynenko_podal_prymer_predstavytelyam_pravyaschey_frakcyy_posmotrym_kto_na_eto_reshytsya_nebozhenko]
== Кримінальні справи ==
[[Файл:Map of sanctions — UA, CH, CZ.svg|міні|праворуч|400пкс|Країни, де проти Миколи Мартиненка порушені кримінальні справи]]
У федеральній прокуратурі Швейцарії з [[2013]] року розслідується кримінальна справа проти Миколи Мартиненка за підозрою у хабарництві і відмиванні грошей. За даними місцевих ЗМІ, йдеться про 30 мільйонів швейцарських франків. Як писала швейцарська Sonntagszeitung, на рахунках Мартиненка у Швейцарії заморожені хабарі від чеської компанії Skoda SA, отримані за сприяння в отриманні контрактів на Хмельницькій [[АЕС]].<ref name="злоч">[http://www.dw.com/uk/%D0%B4%D0%B5%D0%BF%D1%83%D1%82%D0%B0%D1%82-%D0%BC%D0%B0%D1%80%D1%82%D0%B8%D0%BD%D0%B5%D0%BD%D0%BA%D0%BE-%D0%BC%D0%BE%D0%B6%D0%B5-%D0%B2%D1%82%D1%80%D0%B0%D1%82%D0%B8%D1%82%D0%B8-%D0%B7%D0%B0%D0%BC%D0%BE%D1%80%D0%BE%D0%B6%D0%B5%D0%BD%D1%96-%D1%83-%D1%88%D0%B2%D0%B5%D0%B9%D1%86%D0%B0%D1%80%D1%96%D1%97-%D0%B3%D1%80%D0%BE%D1%88%D1%96/a-18813159 Депутат Мартиненко може втратити заморожені у Швейцарії гроші]</ref><ref name="пап">[http://www.pravda.com.ua/news/2015/10/23/7085941/ Швейцарія офіційно підтвердила справу Мартиненка. Йому загрожує 5 років]</ref>
У прокуратурі Чеської республіки також розслідується кримінальна справа проти Миколи Мартиненка.<ref name="не788">[http://www.dw.com/uk/%D0%B3%D0%BF%D1%83-%D0%BF%D1%96%D0%B4%D1%82%D0%B2%D0%B5%D1%80%D0%B4%D0%B8%D0%BB%D0%B0-%D1%84%D0%B0%D0%BA%D1%82-%D0%BA%D1%80%D0%B8%D0%BC%D1%96%D0%BD%D0%B0%D0%BB%D1%8C%D0%BD%D0%BE%D0%B3%D0%BE-%D0%BF%D1%80%D0%BE%D0%B2%D0%B0%D0%B4%D0%B6%D0%B5%D0%BD%D0%BD%D1%8F-%D0%BF%D1%80%D0%BE%D1%82%D0%B8-%D0%BC%D0%B0%D1%80%D1%82%D0%B8%D0%BD%D0%B5%D0%BD%D0%BA%D0%B0-%D0%B2-%D1%87%D0%B5%D1%85%D1%96%D1%97/a-18846163 ГПУ підтвердила факт кримінального провадження проти Мартиненка в Чехії]</ref><ref name="авпаеп">[http://www.pravda.com.ua/news/2015/11/12/7088476/ ГПУ підтвердила кримінальну справу в Чехії проти Мартиненка]</ref>
