Вікіпедія

Геном: відмінності між версіями

Інтерактивний перегляд історії
(Переглянути усі неперевірені зміни)
[перевірена версія][перевірена версія]
← Попереднє редагуванняНаступне редагування →
Вилучено вміст Додано вміст
ВізуальнийВікірозмітка
мНемає опису редагування
→‎Розмір геному: доповнення
Рядок 8:
 
=== Розмір геному ===
[[Розмір геному]] &nbsp;— загальна кількість пар основ ДНК в одній копії гаплоїдного гному. Розмір геному позитивно корелює з морфологічної складністю лише прокаротів та нищих еукаріотів. Проте еукаріоти, прчинаючи з молюсків, втрачають цю кореляцію -&nbsp;— у цих організмів розмір геному не відповідає еволюційній складності організму. <ref>{{cite journal |author=Gregory TR |author2=Nicol JA |author3=Tamm H |author4=Kullman B |author5=Kullman K |author6=Leitch IJ |author7=Murray BG|author8=Kapraun DF |author9=Greilhuber J|author10=Bennett MD |title=Eukaryotic genome size databases|journal=Nucleic Acids Research|date=3 January 2007|volume=35|issue=Database|pages=D332–D338|doi=10.1093/nar/gkl828}}</ref>
 
Для визначення найменшого можливого геному, з я ким може існувати організм, ведуться досліди ''[[in vitro]]''. Так, дослідники з {{нп|інститут Крейга Вентера|інституту К.Вентера||J. Craig Venter Institute}} розробили гіпотетичний мінімальний геном, з яким може існувати організм, і підсадили його до ''{{нп|Mycoplasma capricolum|||}}'', з якої попередньо прибрали власну ДНК<ref name="Service2016">{{cite journal|last1=Service|first1=Robert|title=Synthetic microbe lives with less than 500 genes|journal=Science|year=2016|issn=0036-8075|doi=10.1126/science.aaf4038}}</ref><ref name="HutchisonChuang2016">{{cite journal|last1=Hutchison|first1=C. A.|last2=Chuang|first2=R.-Y.|last3=Noskov|first3=V. N.|last4=Assad-Garcia|first4=N.|last5=Deerinck|first5=T. J.|last6=Ellisman|first6=M. H.|last7=Gill|first7=J.|last8=Kannan|first8=K.|last9=Karas|first9=B. J.|last10=Ma|first10=L.|last11=Pelletier|first11=J. F.|last12=Qi|first12=Z.-Q.|last13=Richter|first13=R. A.|last14=Strychalski|first14=E. A.|last15=Sun|first15=L.|last16=Suzuki|first16=Y.|last17=Tsvetanova|first17=B.|last18=Wise|first18=K. S.|last19=Smith|first19=H. O.|last20=Glass|first20=J. I.|last21=Merryman|first21=C.|last22=Gibson|first22=D. G.|last23=Venter|first23=J. C.|title=Design and synthesis of a minimal bacterial genome|journal=Science|volume=351|issue=6280|year=2016|pages=aad6253–aad6253|issn=0036-8075|doi=10.1126/science.aad6253}}</ref>
. Організм, названий SYN-1,0, не був життєздатним. SYN-1,0 містив 901 ген<ref name="Service2016"/>. Після декількох спроб вдалося розробити організм SYN-3,0, з розміром геному 531 тис. пар основ та 473 генами — найменший геном серед вільно живучих організмів на 2016 рік<ref name="Service2016"/>.
 
{| class="wikitable sortable"<!--Let's keep this table ordered by type and within that by size.-->
Рядок 14 ⟶ 17:
!Тип
!Організм
!colspan="2"|Розмір геному <br/>([[пара основ|пари основ]], bp)
!Приблизна кількість генів
!class="unsortable"|Примітки
Рядок 72 ⟶ 75:
|[[Вірус]]
|''{{нп|Pandoravirus salinus|||Pandoravirus salinus}}''
| style="text-align: right;"|2,470,000
|2.47Mb
|
Рядок 82 ⟶ 85:
|112kb
|
|Найменший геном не вірусів (не синтетичний).<ref>{{cite journal|last=Bennett|first=G. M.|author2=Moran, N. A.|title=Small, Smaller, Smallest: The Origins and Evolution of Ancient Dual Symbioses in a Phloem-Feeding Insect|journal=Genome Biology and Evolution|date=5 August 2013|volume=5|issue=9|pages=1675–1688|doi=10.1093/gbe/evt118|pmid=23918810}}</ref>
|-
|[[Бактерія]]
Рядок 98 ⟶ 101:
|<ref>{{cite journal| journal=Science| author=Frederick R. Blattner| author2=Guy Plunkett III| volume=277| doi=10.1126/science.277.5331.1453 | title=The Complete Genome Sequence of Escherichia coli K-12 | url=http://www.sciencemag.org/content/277/5331/1453.long|pmid= 9278503| pages=1453–1462 | date=1997| issue=5331 |display-authors=etal}}</ref>
|-
|[[Бактерія]] –&nbsp;— [[Ціанобактерії|ціанобактеріїя]]
|''{{нп|Prochlorococcus||||}}'' spp. (1.7 Mb)
|align="right"|1,700,000
Рядок 107 ⟶ 110:
{{Cite journal | doi = 10.1073/pnas.1733211100| title = Genome sequence of the cyanobacterium Prochlorococcus marinus SS120, a nearly minimal oxyphototrophic genome| journal = Proceedings of the National Academy of Sciences| volume = 100| issue = 17| pages = 10020–5| year = 2003| last1 = Dufresne | first1 = A.| last2 = Salanoubat | first2 = M.| last3 = Partensky | first3 = F.| last4 = Artiguenave | first4 = F.| last5 = Axmann | first5 = I. M.| last6 = Barbe | first6 = V.| last7 = Duprat | first7 = S.| last8 = Galperin | first8 = M. Y.| last9 = Koonin | first9 = E. V.| last10 = Le Gall | first10 = F.| last11 = Makarova | first11 = K. S.| last12 = Ostrowski | first12 = M.| last13 = Oztas | first13 = S.| last14 = Robert | first14 = C.| last15 = Rogozin | first15 = I. B.| last16 = Scanlan | first16 = D. J.| last17 = De Marsac | first17 = N. T.| last18 = Weissenbach | first18 = J.| last19 = Wincker | first19 = P.| last20 = Wolf | first20 = Y. I.| last21 = Hess | first21 = W. R. | pmid=12917486 | pmc=187748|bibcode = 2003PNAS..10010020D }}</ref>
|-
|[[Бактерія]] –&nbsp;— ціанобактеріїя
|''{{нп|Nostoc punctiforme|||}}''
|align="right"|9,000,000
Рядок 141 ⟶ 144:
|-
|[[Амеби|Амеба]]
|''[[Polychaos dubium]]'' (''"«Amoeba"» dubia'')
|align="right"|670,000,000,000
|670Gb
|
|Найбільший відомий геном.<ref name=Parfrey2008>{{cite journal | author = Parfrey LW | author2 = Lahr DJG | author3 = Katz LA | date = 2008 | title = The Dynamic Nature of Eukaryotic Genomes | journal = Molecular Biology and Evolution | volume = 25 | issue = 4 | pages = 787–94 | doi = 10.1093/molbev/msn032 | pmc = 2933061 | pmid = 18258610}}</ref> (Спірно)<ref name="ScienceShot: Biggest Genome Ever">[http://news.sciencemag.org/sciencenow/2010/10/scienceshot-biggest-genome-ever.html ScienceShot: Biggest Genome Ever], comments: "«The measurement for Amoeba dubia and other protozoa which have been reported to have very large genomes were made in the 1960s using a rough biochemical approach which is now considered to be an unreliable method for accurate genome size determinations."»</ref>
|-
|[[Рослини|Рослина]]
Рядок 175 ⟶ 178:
|Найбільший геном рослин<ref>{{cite journal|last1=PELLICER|first1=JAUME|last2=FAY|first2=MICHAEL F.|last3=LEITCH|first3=ILIA J.|title=The largest eukaryotic genome of them all?|journal=Botanical Journal of the Linnean Society|date=15 September 2010|volume=164|issue=1|pages=10–15|doi=10.1111/j.1095-8339.2010.01072.x}}</ref>
|-
|Рослина –&nbsp;— [[Мохи|мох]]
|''{{нп|Physcomitrella patens|||}}''
|align="right"|480,000,000
Рядок 182 ⟶ 185:
|Перший сиквенований геном [[Мохоподібні|мохоподібних]], Січень 2008.<ref name="pmid18762443">{{cite journal |author=Lang D |author2=Zimmer AD |author3=Rensing SA |author4=Reski R |title=Exploring plant biodiversity: the Physcomitrella genome and beyond |journal=Trends Plant Sci |date=October 2008 |volume=13 |issue=10 |pages=542–549 |pmid=18762443 |doi=10.1016/j.tplants.2008.07.002}}</ref>
|-
|[[Гриби|Гриб]] –&nbsp;— [[дріжджі]]
|''[[Saccharomyces cerevisiae]]'' (пивні дріжджі)
|align="right"|12,100,000
Рядок 194 ⟶ 197:
|20Mb
|
|<ref>Leroy, S., S. Bouamer, S. Morand, and M. Fargette (2007). Genome size of plant-parasitic nematodes. Nematology 9: 449-450449—450.</ref> Найменший відомий геном тварини<ref>{{cite web | author=Gregory TR |date=2005 |title=Animal Genome Size Database |publisher=http://www.genomesize.com | url=http://www.genomesize.com/statistics.php?stats=entire#stats_top}}</ref>
|-
|[[Нематоди|Нематода]]
Рядок 294 ⟶ 297:
|-
|[[Риби]]
|''[[Tetraodon nigroviridis]]''
|align="right"|385,000,000
|390Mb
Отримано з https://uk.wikipedia.org/wiki/Геном