Інактивація X-хромосоми: відмінності між версіями

МетодикиМетодика RAP–MS ({{lang-en|RNA antisense purification followed by quantitative mass spectrometry}}) дозволяє вивчати ''[[in vivo]]'' взаємодію білків та довгих некодуючих РНК. За допомогою RAP–MS у 2015 році встановили, що задля розміщення днРНК ''Xist'' на хромосомі, необхідна дія білку SAFA<ref>Білок SAF-A (інші назви: Hnrnpu, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U) миші в датабазі {{UniProt|Q8VEK3}}</ref> (scaffold attachment factor A). Крім цього, виключення ({{нп|Нокдаун гену|нокдаун||Gene knockdown}}) генів, що кодують білки, SHARP<ref>Білок Sharp (інші назви: Spen, Msx2-interacting protein) миші в датабазі {{UniProt|Q62504}}</ref>(SMRT and HDAC1-associated repressor protein) та LBR<ref>Білок Lbr миші в датабазі {{UniProt|Q3U9G9}}</ref>(lamin-B receptor) призводило до зупинки інактивації X-хромосоми у дослідах над [[Ембріональні стовбурові клітини|ембріональними стовбуровими клітинами]] мишей<ref name="Zlotorynski2015">{{cite journal|author=Zlotorynski Eytan|title=Non-coding RNA: X chromosome inactivation unravelled|journal=[[Nature Reviews Genetics]]|volume=16|issue=6|year=2015|pages=315–315|issn=1471-0056|doi=10.1038/nrg3955}}</ref><ref name="The Xist lncRNA">{{Cite journal |author = Colleen A. McHugh, Chun-Kan Chen, Amy Chow, et al|title = The Xist lncRNA interacts directly with SHARP to silence transcription through HDAC3 |journal = [[Nature]] |volume = 521 |issue = 7551 |pages = 232–236 |year = 2015 |month = May |doi = 10.1038/nature14443 |pmid = 25915022 }}</ref>.

При розміщенні ''Xist'' на X-хромосомі з цією хромосомою вже не з'єднується {{нп|РНК-полімераза II|||RNA polymerase II}} — [[РНК-полімераза|полімераза]], яка транскрибує більшість мРНК. Виключення гену, що кодує SAFA призводило до хаотичного розміщення ''Xist'', тоді як виключення гену, що кодує білок SHARP призводило до повернення РНК-полімерази II. Також білок SHARP взаємодіє з білками-ремодуляторами структури хроматину, такими як {{нп|гістондеацетилаза|гістондеацетилази||Histone deacetylase}}. Причому, виключення гістондеацетилази 3 (HDAC3), а не інших видів гістондеацетилаз, призводило до порушення механізму інактивації X-хромосоми<ref name="Zlotorynski2015"></ref><ref name="The Xist lncRNA"></ref>.

Важливим елементом інактивації є дія репресивного комплексу Polycomb, {{нп|PRC2|||Polycomb repressive complex 2}} ({{lang-en|Polycomb repressive complex 2}}), проте дія комплексу PRC2 не важлива при ініціації процесу інактивації, скоріше у підтриманні хромосоми у інактивованому стані – триметилюванні 27 лізину H3 гістону (H3K27-3me)<ref name="Zlotorynski2015"></ref><ref name="The Xist lncRNA"></ref>