Баварська академія наук була заснована в [[1759]] році [[курфюрст]]ом [[Максиміліан III (курфюрст Баварії)|Максиміліаном III Йосипом]], і таким чином, є одним з найстаріших наукових товариств [[Європа|Європи]]. Проект академії був складений надвірним радником ІоганномЙоганном Георгом фон Лорі ({{lang-de|Johann Georg von Lori}}, 1723–1787), засновником «Баварського наукового товариства» ({{lang-de|Bayerischen Gelehrten Gesellschaft}}), і графом Зигмундом фон Хаймхаузеном ({{lang-de|Johann Sigmund Ferdinand Joseph Graf von Haimhausen}}, 1708–1793), який став першим Президентом Академії. Баварська академія наук не мала власного будинку до 1783 року, коли їй бувбуло переданийпередано палац «Wilhelminum», реквізований у [[Єзуїти|Ордена єзуїтів]]. У 1944 році будівля академії стала жертвою бомбардування і була зруйнована. Установи та служби академії розміщувалися в безлічічисленних невеликих [[Аудиторія|аудиторій]] та бюро при [[Мюнхенський університет|Мюнхенському університеті]], і тільки в рік свого 200-річчя (1959) Баварська академія наук отримала постійне приміщення в північносхідному крилі Мюнхенського палацу.
