Рибосомний білок S11

Рибосомний білок S11 (англ. Ribosomal protein S11) – білок, який кодується геном RPS11, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 158 амінокислот, а молекулярна маса — 18 431.

Рибосомний білок S11
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4KZY, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4D5L, 4V5Z, 5FLX, 4UJD, 3J7P, 4KZZ, 4UJE, 4UJC
Ідентифікатори
Символи	RPS11, S11, ribosomal protein S11
Зовнішні ІД	OMIM: 180471 MGI: 1351329 HomoloGene: 88443 GeneCards: RPS11
Онтологія гена Молекулярна функція • rRNA binding • structural constituent of ribosome • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • рибосома • focal adhesion • внутрішньоклітинний • Ядерце • екзосома • Нуклеоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • мембрана • cytosolic small ribosomal subunit Біологічний процес • viral transcription • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • translational initiation • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • Біосинтез білків • rRNA processing • osteoblast differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6205	27207
Ensembl	ENSG00000142534	ENSMUSG00000003429
UniProt	P62280	P62281
RefSeq (мРНК)	NM_001015	NM_013725
RefSeq (білок)	NP_001006	NP_038753
Локус (UCSC)	Хр. 19: 49.5 – 49.5 Mb	Хр. 7: 44.77 – 44.77 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADIQTERAY		QKQPTIFQNK		KRVLLGETGK		EKLPRYYKNI		GLGFKTPKEA
IEGTYIDKKC		PFTGNVSIRG		RILSGVVTKM		KMQRTIVIRR		DYLHYIRKYN
RFEKRHKNMS		VHLSPCFRDV		QIGDIVTVGE		CRPLSKTVRF		NVLKVTKAAG
TKKQFQKF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Білок має сайт для зв'язування з РНК, рРНК.

Література

• Lott J.B., Mackie G.A. (1988). Sequence of a cloned cDNA encoding human ribosomal protein S11.. Nucleic Acids Res. 16: 1205 — 1205.  PubMed DOI:10.1093/nar/16.3.1205
• Higa S., Yoshihama M., Tanaka T., Kenmochi N. (1999). Gene organization and sequence of the region containing the ribosomal protein genes RPL13A and RPS11 in the human genome and conserved features in the mouse genome.. Gene 240: 371 — 377.  PubMed DOI:10.1016/S0378-1119(99)00429-1
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19