Експортин-5

XPO5 (англ. Exportin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 204 амінокислот, а молекулярна маса — 136 311.

XPO5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3A6P
Ідентифікатори
Символи	XPO5, exp5, exportin 5
Зовнішні ІД	OMIM: 607845 MGI: 1913789 HomoloGene: 69316 GeneCards: XPO5
Онтологія гена Молекулярна функція • tRNA binding • mRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nuclear export signal receptor activity • pre-miRNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • RNA nuclear export complex • клітинне ядро • Нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear RNA export factor complex Біологічний процес • protein export from nucleus • positive regulation of RNA interference • protein transport • intracellular protein transport • GO:0061715 miRNA metabolic process • Сайленсинг генів • regulation of protein export from nucleus • pre-miRNA export from nucleus • GO:0015915 транспорт • nuclear export Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57510	72322
Ensembl	ENSG00000124571	ENSMUSG00000067150
UniProt	Q9HAV4	Q924C1
RefSeq (мРНК)	NM_020750	NM_028198
RefSeq (білок)	NP_065801	NP_082474
Локус (UCSC)	Хр. 6: 43.52 – 43.58 Mb	Хр. 17: 46.51 – 46.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAMDQVNALC		EQLVKAVTVM		MDPNSTQRYR		LEALKFCEEF		KEKCPICVPC
GLRLAEKTQV		AIVRHFGLQI		LEHVVKFRWN		GMSRLEKVYL		KNSVMELIAN
GTLNILEEEN		HIKDALSRIV		VEMIKREWPQ		HWPDMLIELD		TLSKQGETQT
ELVMFILLRL		AEDVVTFQTL		PPQRRRDIQQ		TLTQNMERIF		SFLLNTLQEN
VNKYQQVKTD		TSQESKAQAN		CRVGVAALNT		LAGYIDWVSM		SHITAENCKL
LEILCLLLNE		QELQLGAAEC		LLIAVSRKGK		LEDRKPLMVL		FGDVAMHYIL
SAAQTADGGG		LVEKHYVFLK		RLCQVLCALG		NQLCALLGAD		SDVETPSNFG
KYLESFLAFT		THPSQFLRSS		TQMTWGALFR		HEILSRDPLL		LAIIPKYLRA
SMTNLVKMGF		PSKTDSPSCE		YSRFDFDSDE		DFNAFFNSSR		AQQGEVMRLA
CRLDPKTSFQ		MAGEWLKYQL		STFLDAGSVN		SCSAVGTGEG		SLCSVFSPSF
VQWEAMTLFL		ESVITQMFRT		LNREEIPVND		GIELLQMVLN		FDTKDPLILS
CVLTNVSALF		PFVTYRPEFL		PQVFSKLFSS		VTFETVEESK		APRTRAVRNV
RRHACSSIIK		MCRDYPQLVL		PNFDMLYNHV		KQLLSNELLL		TQMEKCALME
ALVLISNQFK		NYERQKVFLE		ELMAPVASIW		LSQDMHRVLS		DVDAFIAYVG
TDQKSCDPGL		EDPCGLNRAR		MSFCVYSILG		VVKRTCWPTD		LEEAKAGGFV
VGYTSSGNPI		FRNPCTEQIL		KLLDNLLALI		RTHNTLYAPE		MLAKMAEPFT
KALDMLDAEK		SAILGLPQPL		LELNDSPVFK		TVLERMQRFF		STLYENCFHI
LGKAGPSMQQ		DFYTVEDLAT		QLLSSAFVNL		NNIPDYRLRP		MLRVFVKPLV
LFCPPEHYEA		LVSPILGPLF		TYLHMRLSQK		WQVINQRSLL		CGEDEAADEN
PESQEMLEEQ		LVRMLTREVM		DLITVCCVSK		KGADHSSAPP		ADGDDEEMMA
TEVTPSAMAE		LTDLGKCLMK		HEDVCTALLI		TAFNSLAWKD		TLSCQRTTSQ
LCWPLLKQVL		SGTLLADAVT		WLFTSVLKGL		QMHGQHDGCM		ASLVHLAFQI
YEALRPRYLE		IRAVMEQIPE		IQKDSLDQFD		CKLLNPSLQK		VADKRRKDQF
KRLIAGCIGK		PLGEQFRKEV		HIKNLPSLFK		KTKPMLETEV		LDNDGGGLAT
IFEP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, РНК-залежне заглушення генів, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК, тРНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Brownawell A.M., Macara I.G. (2002). Exportin-5, a novel karyopherin, mediates nuclear export of double-stranded RNA binding proteins. J. Cell Biol. 156: 53—64. PMID 11777942 DOI:10.1083/jcb.200110082
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Calado A., Treichel N., Mueller E.-C., Otto A., Kutay U. (2002). Exportin-5-mediated nuclear export of eukaryotic elongation factor 1A and tRNA. EMBO J. 21: 6216—6224. PMID 12426393 DOI:10.1093/emboj/cdf620
• Yi R., Qin Y., Macara I.G., Cullen B.R. (2003). Exportin-5 mediates the nuclear export of pre-microRNAs and short hairpin RNAs. Genes Dev. 17: 3011—3016. PMID 14681208 DOI:10.1101/gad.1158803
• Chen T., Brownawell A.M., Macara I.G. (2004). Nucleocytoplasmic shuttling of JAZ, a new cargo protein for exportin-5. Mol. Cell. Biol. 24: 6608—6619. PMID 15254228 DOI:10.1128/MCB.24.15.6608-6619.2004
• Bohnsack M.T., Czaplinski K., Goerlich D. (2004). Exportin 5 is a RanGTP-dependent dsRNA-binding protein that mediates nuclear export of pre-miRNAs. RNA. 10: 185—191. PMID 14730017 DOI:10.1261/rna.5167604

Див. також

• Хромосома 6