ZRANB1

ZRANB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3ZRH, 5AF6
Ідентифікатори
Символи	ZRANB1, TRABID, zinc finger RANBP2-type containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611749 MGI: 106441 HomoloGene: 9728 GeneCards: ZRANB1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type peptidase activity; • зв'язування з іоном металу; • GO:0070122 peptidase activity; • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • thiol-dependent deubiquitinase; • hydrolase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • внутрішньоклітинна мембранна органела;
Біологічний процес	• protein K29-linked deubiquitination; • protein deubiquitination involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process; • Wnt signaling pathway; • протеоліз; • protein K33-linked deubiquitination; • positive regulation of Wnt signaling pathway; • protein K63-linked deubiquitination; • cytoskeleton organization; • regulation of cell morphogenesis; • cell migration; • protein deubiquitination;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	54764
	360216
	ENSG00000019995
	ENSMUSG00000030967
	Q9UGI0
	Q7M760
	NM_017580
	NM_207302; NM_001362198; NM_001362199
	NP_060050
	NP_997185; NP_001349127; NP_001349128
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ZRANB1 (англ. Zinc finger RANBP2-type containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 708 амінокислот, а молекулярна маса — 80 967^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSERGIKWAC	EYCTYENWPS	AIKCTMCRAQ	RPSGTIITED	PFKSGSSDVG
RDWDPSSTEG	GSSPLICPDS	SARPRVKSSY	SMENANKWSC	HMCTYLNWPR
AIRCTQCLSQ	RRTRSPTESP	QSSGSGSRPV	AFSVDPCEEY	NDRNKLNTRT
QHWTCSVCTY	ENWAKAKRCV	VCDHPRPNNI	EAIELAETEE	ASSIINEQDR
ARWRGSCSSG	NSQRRSPPAT	KRDSEVKMDF	QRIELAGAVG	SKEELEVDFK
KLKQIKNRMK	KTDWLFLNAC	VGVVEGDLAA	IEAYKSSGGD	IARQLTADEV
RLLNRPSAFD	VGYTLVHLAI	RFQRQDMLAI	LLTEVSQQAA	KCIPAMVCPE
LTEQIRREIA	ASLHQRKGDF	ACYFLTDLVT	FTLPADIEDL	PPTVQEKLFD
EVLDRDVQKE	LEEESPIINW	SLELATRLDS	RLYALWNRTA	GDCLLDSVLQ
ATWGIYDKDS	VLRKALHDSL	HDCSHWFYTR	WKDWESWYSQ	SFGLHFSLRE
EQWQEDWAFI	LSLASQPGAS	LEQTHIFVLA	HILRRPIIVY	GVKYYKSFRG
ETLGYTRFQG	VYLPLLWEQS	FCWKSPIALG	YTRGHFSALV	AMENDGYGNR
GAGANLNTDD	DVTITFLPLV	DSERKLLHVH	FLSAQELGNE	EQQEKLLREW
LDCCVTEGGV	LVAMQKSSRR	RNHPLVTQMV	EKWLDRYRQI	RPCTSLSDGE
EDEDDEDE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, сигнальний шлях Wnt. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Tran H., Hamada F., Schwarz-Romond T., Bienz M. (2008). Trabid, a new positive regulator of Wnt-induced transcription with preference for binding and cleaving K63-linked ubiquitin chains. Genes Dev. 22: 528—542. PMID 18281465 DOI:10.1101/gad.463208

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18224 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UGI0 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18224 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9UGI0 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]