ZKSCAN1

ZKSCAN1 (англ. Zinc finger with KRAB and SCAN domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 563 амінокислот, а молекулярна маса — 63 630.

ZKSCAN1
Ідентифікатори
Символи	ZKSCAN1, 9130423L19Rik, KOX18, PHZ-37, ZNF139, ZNF36, ZSCAN33, zinc finger with KRAB and SCAN domains 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601260 MGI: 1921820 HomoloGene: 34523 GeneCards: ZKSCAN1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • зв'язування з іоном металу • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7586	74570
Ensembl	ENSG00000106261	ENSMUSG00000029729
UniProt	P17029	Q8BGS3
RefSeq (мРНК)	NM_001287054 NM_001287055 NM_003439 NM_001346579 NM_001346580 NM_001346581	NM_029869 NM_133906
RefSeq (білок)	NP_001273983 NP_001273984 NP_001333508 NP_001333509 NP_001333510 NP_003430	NP_084145 NP_598667
Локус (UCSC)	Хр. 7: 100.02 – 100.04 Mb	Хр. 5: 138.08 – 138.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMTAESREAT		GLSPQAAQEK		DGIVIVKVEE		EDEEDHMWGQ		DSTLQDTPPP
DPEIFRQRFR		RFCYQNTFGP		REALSRLKEL		CHQWLRPEIN		TKEQILELLV
LEQFLSILPK		ELQVWLQEYR		PDSGEEAVTL		LEDLELDLSG		QQVPGQVHGP
EMLARGMVPL		DPVQESSSFD		LHHEATQSHF		KHSSRKPRLL		QSRALPAAHI
PAPPHEGSPR		DQAMASALFT		ADSQAMVKIE		DMAVSLILEE		WGCQNLARRN
LSRDNRQENY		GSAFPQGGEN		RNENEESTSK		AETSEDSASR		GETTGRSQKE
FGEKRDQEGK		TGERQQKNPE		EKTRKEKRDS		GPAIGKDKKT		ITGERGPREK
GKGLGRSFSL		SSNFTTPEEV		PTGTKSHRCD		ECGKCFTRSS		SLIRHKIIHT
GEKPYECSEC		GKAFSLNSNL		VLHQRIHTGE		KPHECNECGK		AFSHSSNLIL
HQRIHSGEKP		YECNECGKAF		SQSSDLTKHQ		RIHTGEKPYE		CSECGKAFNR
NSYLILHRRI		HTREKPYKCT		KCGKAFTRSS		TLTLHHRIHA		RERASEYSPA
SLDAFGAFLK		SCV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tommerup N., Vissing H. (1995). Isolation and fine mapping of 16 novel human zinc finger-encoding cDNAs identify putative candidate genes for developmental and malignant disorders. Genomics. 27: 259—264. PMID 7557990 DOI:10.1006/geno.1995.1040
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
• Thiesen H.-J. (1990). Multiple genes encoding zinc finger domains are expressed in human T cells. New Biol. 2: 363—374. PMID 2288909

Див. також

• Хромосома 7