ZFP36

ZFP36 (англ. ZFP36 ring finger protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 326 амінокислот, а молекулярна маса — 34 003.

ZFP36
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4J8S
Ідентифікатори
Символи	ZFP36, G0S24, GOS24, NUP475, RNF162A, TIS11, TTP, zfp-36, ZFP36 ring finger protein
Зовнішні ІД	OMIM: 190700 MGI: 99180 HomoloGene: 2558 GeneCards: ZFP36
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • C-C chemokine binding • 14-3-3 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • mRNA 3'-UTR AU-rich region binding • enzyme binding • mRNA binding • protein kinase binding • RNA binding • heat shock protein binding • RNA polymerase binding • mRNA 3'-UTR binding Клітинна компонента • цитоплазма • cytoplasmic stress granule • клітинне ядро • RISC-loading complex • Рибонуклеопротеїни • Dcp1-Dcp2 complex • Екзосома • P-body • гіалоплазма • CCR4-NOT complex Біологічний процес • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • mRNA catabolic process • regulation of tumor necrosis factor production • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • miRNA-mediated gene silencing by inhibition of translation • response to starvation • 3'-UTR-mediated mRNA stabilization • negative regulation of erythrocyte differentiation • cellular response to lipopolysaccharide • cellular response to tumor necrosis factor • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • positive regulation of deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA • regulation of keratinocyte apoptotic process • regulation of keratinocyte proliferation • positive regulation of fat cell differentiation • cellular response to fibroblast growth factor stimulus • cellular response to granulocyte macrophage colony-stimulating factor stimulus • negative regulation of viral transcription • regulation of keratinocyte differentiation • response to wounding • GO:1905618 positive regulation of gene silencing by miRNA • regulation of mRNA stability • MAPK cascade • cellular response to glucocorticoid stimulus • cellular response to epidermal growth factor stimulus • positive regulation of intracellular mRNA localization • p38MAPK cascade • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-independent decay • Сайленсинг генів • mRNA transport • 3'-UTR-mediated mRNA destabilization • negative regulation of polynucleotide adenylyltransferase activity • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7538	22695
Ensembl	ENSG00000128016	ENSMUSG00000044786
UniProt	P26651	P22893
RefSeq (мРНК)	NM_003407	NM_011756
RefSeq (білок)	NP_003398	NP_035886
Локус (UCSC)	Хр. 19: 39.41 – 39.41 Mb	Хр. 7: 28.08 – 28.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDLTAIYESL		LSLSPDVPVP		SDHGGTESSP		GWGSSGPWSL		SPSDSSPSGV
TSRLPGRSTS		LVEGRSCGWV		PPPPGFAPLA		PRLGPELSPS		PTSPTATSTT
PSRYKTELCR		TFSESGRCRY		GAKCQFAHGL		GELRQANRHP		KYKTELCHKF
YLQGRCPYGS		RCHFIHNPSE		DLAAPGHPPV		LRQSISFSGL		PSGRRTSPPP
PGLAGPSLSS		SSFSPSSSPP		PPGDLPLSPS		AFSAAPGTPL		ARRDPTPVCC
PSCRRATPIS		VWGPLGGLVR		TPSVQSLGSD		PDEYASSGSS		LGGSDSPVFE
AGVFAPPQPV		AAPRRLPIFN		RISVSE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт мРНК, РНК-залежне заглушення генів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Carballo E., Lai W.S., Blackshear P.J. (1998). Feedback inhibition of macrophage tumor necrosis factor-alpha production by tristetraprolin. Science. 281: 1001—1005. PMID 9703499 DOI:10.1126/science.281.5379.1001
• Lai W.S., Carballo E., Thorn J.M., Kennington E.A., Blackshear P.J. (2000). Interactions of CCCH zinc finger proteins with mRNA. Binding of tristetraprolin-related zinc finger proteins to Au-rich elements and destabilization of mRNA. J. Biol. Chem. 275: 17827—17837. PMID 10751406 DOI:10.1074/jbc.M001696200
• Lai W.S., Blackshear P.J. (2001). Interactions of CCCH zinc finger proteins with mRNA: tristetraprolin-mediated AU-rich element-dependent mRNA degradation can occur in the absence of a poly(A) tail. J. Biol. Chem. 276: 23144—23154. PMID 11279239 DOI:10.1074/jbc.M100680200
• Brooks S.A., Connolly J.E., Diegel R.J., Fava R.A., Rigby W.F. (2002). Analysis of the function, expression, and subcellular distribution of human tristetraprolin. Arthritis Rheum. 46: 1362—1370. PMID 12115244 DOI:10.1002/art.10235
• Lai W.S., Kennington E.A., Blackshear P.J. (2003). Tristetraprolin and its family members can promote the cell-free deadenylation of AU-rich element-containing mRNAs by poly(A) ribonuclease. Mol. Cell. Biol. 23: 3798—3812. PMID 12748283 DOI:10.1128/MCB.23.11.3798-3812.2003

Див. також

• Хромосома 19