ZFP28

ZFP28 (англ. ZFP28 zinc finger protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 868 амінокислот, а молекулярна маса — 98 705.

ZFP28
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EM2, 2EM3, 2EM4, 2EMJ, 2EMK, 2EML, 2EN9, 2ENH, 2EOH, 2EP0, 2EPX, 2EPZ, 2YTM
Ідентифікатори
Символи	ZFP28, mkr5, ZFP28 zinc finger protein
Зовнішні ІД	OMIM: 616798 MGI: 99175 HomoloGene: 69047 GeneCards: ZFP28
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	140612	22690
Ensembl	ENSG00000196867	ENSMUSG00000062861
UniProt	Q8NHY6	P10078
RefSeq (мРНК)	NM_001308440 NM_020828	NM_175247
RefSeq (білок)	NP_001295369 NP_065879	NP_780456
Локус (UCSC)	Хр. 19: 56.54 – 56.56 Mb	Хр. 7: 6.39 – 6.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRGAASASVR		EPTPLPGRGA		PRTKPRAGRG		PTVGTPATLA		LPARGRPRSR
NGLASKGQRG		AAPTGPGHRA		LPSRDTALPQ		ERNKKLEAVG		TGIEPKAMSQ
GLVTFGDVAV		DFSQEEWEWL		NPIQRNLYRK		VMLENYRNLA		SLGLCVSKPD
VISSLEQGKE		PWTVKRKMTR		AWCPDLKAVW		KIKELPLKKD		FCEGKLSQAV
ITERLTSYNL		EYSLLGEHWD		YDALFETQPG		LVTIKNLAVD		FRQQLHPAQK
NFCKNGIWEN		NSDLGSAGHC		VAKPDLVSLL		EQEKEPWMVK		RELTGSLFSG
QRSVHETQEL		FPKQDSYAEG		VTDRTSNTKL		DCSSFRENWD		SDYVFGRKLA
VGQETQFRQE		PITHNKTLSK		ERERTYNKSG		RWFYLDDSEE		KVHNRDSIKN
FQKSSVVIKQ		TGIYAGKKLF		KCNECKKTFT		QSSSLTVHQR		IHTGEKPYKC
NECGKAFSDG		SSFARHQRCH		TGKKPYECIE		CGKAFIQNTS		LIRHWRYYHT
GEKPFDCIDC		GKAFSDHIGL		NQHRRIHTGE		KPYKCDVCHK		SFRYGSSLTV
HQRIHTGEKP		YECDVCRKAF		SHHASLTQHQ		RVHSGEKPFK		CKECGKAFRQ
NIHLASHLRI		HTGEKPFECA		ECGKSFSISS		QLATHQRIHT		GEKPYECKVC
SKAFTQKAHL		AQHQKTHTGE		KPYECKECGK		AFSQTTHLIQ		HQRVHTGEKP
YKCMECGKAF		GDNSSCTQHQ		RLHTGQRPYE		CIECGKAFKT		KSSLICHRRS
HTGEKPYECS		VCGKAFSHRQ		SLSVHQRIHS		GKKPYECKEC		RKTFIQIGHL
NQHKRVHTGE		RSYNYKKSRK		VFRQTAHLAH		HQRIHTGESS		TCPSLPSTSN
PVDLFPKFLW		NPSSLPSP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19