ZCCHC11

ZCCHC11 (англ. Zinc finger CCHC-type containing 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 644 амінокислот, а молекулярна маса — 185 166.

ZCCHC11
Ідентифікатори
Символи	TUT4, PAPD3, zinc finger CCHC-type containing 11, TENT3A, ZCCHC11, terminal uridylyl transferase 4
Зовнішні ІД	OMIM: 613692 MGI: 2445126 HomoloGene: 35279 GeneCards: TUT4
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotidyltransferase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • RNA uridylyltransferase activity • miRNA binding Клітинна компонента • екзосома • клітинне ядро • ядерце • цитоплазма • міжклітинний простір • гіалоплазма • cytoplasmic ribonucleoprotein granule Біологічний процес • miRNA catabolic process • histone mRNA catabolic process • pre-miRNA processing • RNA 3'-end processing • stem cell population maintenance • Сайленсинг генів • GO:0061715 miRNA metabolic process • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • oocyte maturation • negative regulation of transposition, RNA-mediated • RNA 3' uridylation • polyuridylation-dependent mRNA catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23318	230594
Ensembl	ENSG00000134744	ENSMUSG00000034610
UniProt	Q5TAX3	B2RX14
RefSeq (мРНК)	NM_001009881 NM_001009882 NM_015269	NM_175472 NM_001379663 NM_001379664 NM_001379665
RefSeq (білок)	NP_001009881 NP_056084	NP_780681 NP_001366592 NP_001366593 NP_001366594
Локус (UCSC)	Хр. 1: 52.41 – 52.55 Mb	Хр. 4: 108.46 – 108.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEESKTLKSE		NHEPKKNVIC		EESKAVQVIG		NQTLKARNDK		SVKEIENSSP
NRNSSKKNKQ		NDICIEKTEV		KSCKVNAANL		PGPKDLGLVL		RDQSHCKAKK
FPNSPVKAEK		ATISQAKSEK		ATSLQAKAEK		SPKSPNSVKA		EKASSYQMKS
EKVPSSPAEA		EKGPSLLLKD		MRQKTELQQI		GKKIPSSFTS		VDKVNIEAVG
GEKCALQNSP		RSQKQQTCTD		NTGDSDDSAS		GIEDVSDDLS		KMKNDESNKE
NSSEMDYLEN		ATVIDESALT		PEQRLGLKQA		EERLERDHIF		RLEKRSPEYT
NCRYLCKLCL		IHIENIQGAH		KHIKEKRHKK		NILEKQEESE		LRSLPPPSPA
HLAALSVAVI		ELAKEHGITD		DDLRVRQEIV		EEMSKVITTF		LPECSLRLYG
SSLTRFALKS		SDVNIDIKFP		PKMNHPDLLI		KVLGILKKNV		LYVDVESDFH
AKVPVVVCRD		RKSGLLCRVS		AGNDMACLTT		DLLTALGKIE		PVFIPLVLAF
RYWAKLCYID		SQTDGGIPSY		CFALMVMFFL		QQRKPPLLPC		LLGSWIEGFD
PKRMDDFQLK		GIVEEKFVKW		ECNSSSATEK		NSIAEENKAK		ADQPKDDTKK
TETDNQSNAM		KEKHGKSPLA		LETPNRVSLG		QLWLELLKFY		TLDFALEEYV
ICVRIQDILT		RENKNWPKRR		IAIEDPFSVK		RNVARSLNSQ		LVYEYVVERF
RAAYRYFACP		QTKGGNKSTV		DFKKREKGKI		SNKKPVKSNN		MATNGCILLG
ETTEKINAER		EQPVQCDEMD		CTSQRCIIDN		NNLLVNELDF		ADHGQDSSSL
STSKSSEIEP		KLDKKQDDLA		PSETCLKKEL		SQCNCIDLSK		SPDPDKSTGT
DCRSNLETES		SHQSVCTDTS		ATSCNCKATE		DASDLNDDDN		LPTQELYYVF
DKFILTSGKP		PTIVCSICKK		DGHSKNDCPE		DFRKIDLKPL		PPMTNRFREI
LDLVCKRCFD		ELSPPCSEQH		NREQILIGLE		KFIQKEYDEK		ARLCLFGSSK
NGFGFRDSDL		DICMTLEGHE		NAEKLNCKEI		IENLAKILKR		HPGLRNILPI
TTAKVPIVKF		EHRRSGLEGD		ISLYNTLAQH		NTRMLATYAA		IDPRVQYLGY
TMKVFAKRCD		IGDASRGSLS		SYAYILMVLY		FLQQRKPPVI		PVLQEIFDGK
QIPQRMVDGW		NAFFFDKTEE		LKKRLPSLGK		NTESLGELWL		GLLRFYTEEF
DFKEYVISIR		QKKLLTTFEK		QWTSKCIAIE		DPFDLNHNLG		AGVSRKMTNF
IMKAFINGRK		LFGTPFYPLI		GREAEYFFDS		RVLTDGELAP		NDRCCRVCGK
IGHYMKDCPK		RKSLLFRLKK		KDSEEEKEGN		EEEKDSRDVL		DPRDLHDTRD
FRDPRDLRCF		ICGDAGHVRR		ECPEVKLARQ		RNSSVAAAQL		VRNLVNAQQV
AGSAQQQGDQ		SIRTRQSSEC		SESPSYSPQP		QPFPQNSSQS		AAITQPSSQP
GSQPKLGPPQ		QGAQPPHQVQ		MPLYNFPQSP		PAQYSPMHNM		GLLPMHPLQI
PAPSWPIHGP		VIHSAPGSAP		SNIGLNDPSI		IFAQPAARPV		AIPNTSHDGH
WPRTVAPNSL		VNSGAVGNSE		PGFRGLTPPI		PWEHAPRPHF		PLVPASWPYG
LHQNFMHQGN		ARFQPNKPFY		TQDRCATRRC		RERCPHPPRG		NVSE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном магнію, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
• Mullen T.E., Marzluff W.F. (2008). Degradation of histone mRNA requires oligouridylation followed by decapping and simultaneous degradation of the mRNA both 5' to 3' and 3' to 5'. Genes Dev. 22: 50—65. PMID 18172165 DOI:10.1101/gad.1622708

Див. також

• Хромосома 1