ZBTB21

ZBTB21 (англ. Zinc finger and BTB domain containing 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 066 амінокислот, а молекулярна маса — 118 870.

ZBTB21
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WJP
Ідентифікатори
Символи	ZBTB21, ZNF295, zinc finger and BTB domain containing 21
Зовнішні ІД	OMIM: 616485 MGI: 1927240 HomoloGene: 10799 GeneCards: ZBTB21
Онтологія гена Молекулярна функція • methyl-CpG binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	49854	114565
Ensembl	ENSG00000173276	ENSMUSG00000046962
UniProt	Q9ULJ3	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001098402 NM_001098403 NM_020727 NM_001320729 NM_001320731	NM_001081684 NM_001081685 NM_175428 NM_001320385
RefSeq (білок)	NP_001091872 NP_001091873 NP_001307658 NP_001307660 NP_065778	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 21: 41.99 – 42.01 Mb	Хр. 16: 97.74 – 97.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEGLLHYINP		AHAISLLSAL		NEERLKGQLC		DVLLIVGDQK		FRAHKNVLAA
SSEYFQSLFT		NKENESQTVF		QLDFCEPDAF		DNVLNYIYSS		SLFVEKSSLA
AVQELGYSLG		ISFLTNIVSK		TPQAPFPTCP		NRKKVFVEDD		ENSSQKRSVI
VCQSRNEAQG		KTVSQNQPDV		SHTSRPSPSI		AVKANTNKPH		VPKPIEPLHN
LSLTEKSWPK		DSSVVYAKSL		EHSGSLDDPN		RISLVKRNAV		LPSKPLQDRE
AMDDKPGVSG		QLPKGKALEL		ALKRPRPPVL		SVCSSSETPY		LLKETNKGNG
QGEDRNLLYY		SKLGLVIPSS		GSGSGNQSID		RSGPLVKSLL		RRSLSMDSQV
PVYSPSIDLK		SSQGSSSVSS		DAPGNVLCAL		SQKSSLKDCS		EKTALDDRPQ
VLQPHRLRSF		SASQSTDREG		ASPVTEVRIK		TEPSSPLSDP		SDIIRVTVGD
AATTAAASSS		SVTRDLSLKT		EDDQKDMSRL		PAKRRFQADR		RLPFKKLKVN
EHGSPVSEDN		FEEGSSPTLL		DADFPDSDLN		KDEFGELEGT		RPNKKFKCKH
CLKIFRSTAG		LHRHVNMYHN		PEKPYACDIC		HKRFHTNFKV		WTHCQTQHGI
VKNPSPASSS		HAVLDEKFQR		KLIDIVRERE		IKKALIIKLR		RGKPGFQGQS
SSQAQQVIKR		NLRSRAKGAY		ICTYCGKAYR		FLSQFKQHIK		MHPGEKPLGV
NKVAKPKEHA		PLASPVENKE		VYQCRLCNAK		LSSLLEQGSH		ERLCRNAAVC
PYCSLRFFSP		ELKQEHESKC		EYKKLTCLEC		MRTFKSSFSI		WRHQVEVHNQ
NNMAPTENFS		LPVLDHNGDV		TGSSRPQSQP		EPNKVNHIVT		TKDDNVFSDS
SEQVNFDSED		SSCLPEDLSL		SKQLKIQVKE		EPVEEAEEEA		PEASTAPKEA
GPSKEASLWP		CEKCGKMFTV		HKQLERHQEL		LCSVKPFICH		VCNKAFRTNF
RLWSHFQSHM		SQASEESAHK		ESEVCPVPTN		SPSPPPLPPP		PPLPKIQPLE
PDSPTGLSEN		PTPATEKLFV		PQESDTLFYH		APPLSAITFK		RQFMCKLCHR
TFKTAFSLWS		HEQTHN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Wang J., Kudoh J., Takayanagi A., Shimizu N. (2005). Novel human BTB/POZ domain-containing zinc finger protein ZNF295 is directly associated with ZFP161. Biochem. Biophys. Res. Commun. 327: 615—627. PMID 15629158 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.12.048
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 21