XIRP1

XIRP1 (англ. Xin actin binding repeat containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 843 амінокислот, а молекулярна маса — 198 561.

XIRP1
Ідентифікатори
Символи	XIRP1, CMYA1, Xin, xin actin binding repeat containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609777 MGI: 1333878 HomoloGene: 7998 GeneCards: XIRP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • actin binding • actin filament binding Клітинна компонента • міжклітинні контакти • stress fiber • focal adhesion • filamentous actin Біологічний процес • actin cytoskeleton organization • heart development • negative regulation of protein binding • actin filament organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	165904	22437
Ensembl	ENSG00000168334	ENSMUSG00000079243
UniProt	Q702N8	O70373
RefSeq (мРНК)	NM_001198621 NM_194293 NM_001351377	NM_001081339 NM_011724
RefSeq (білок)	NP_001185550 NP_919269 NP_001338306	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 3: 39.18 – 39.19 Mb	Хр. 9: 119.84 – 119.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADTQTQVAP		TPTMRMATAE		DLPLPPPPAL		EDLPLPPPKE		SFSKFHQQRQ
ASELRRLYRH		IHPELRKNLA		EAVAEDLAEV		LGSEEPTEGD		VQCMRWIFEN
WRLDAIGEHE		RPAAKEPVLC		GDVQATSRKF		EEGSFANSTD		QEPTRPQPGG
GDVRAARWLF		ETKPLDELTG		QAKELEATVR		EPAASGDVQG		TRMLFETRPL
DRLGSRPSLQ		EQSPLELRSE		IQELKGDVKK		TVKLFQTEPL		CAIQDAEGAI
HEVKAACREE		IQSNAVRSAR		WLFETRPLDA		INQDPSQVRV		IRGISLEEGA
RPDVSATRWI		FETQPLDAIR		EILVDEKDFQ		PSPDLIPPGP		DVQQQQHLFE
TRALDTLKGD		EEAGAEAPPK		EEVVPGDVRS		TLWLFETKPL		DAFRDKVQVG
HLQRVDPQDG		EGHLSSDSSS		ALPFSQSAPQ		RDELKGDVKT		FKNLFETLPL
DSIGQGEVLA		HGSPSREEGT		DSAGQAQGIG		SPVYAMQDSK		GRLHALTSVS
REQIVGGDVQ		GYRWMFETQP		LDQLGRSPST		IDVVRGITRQ		EVVAGDVGTA
RWLFETQPLE		MIHQREQQER		QKEEGKSQGD		PQPEAPPKGD		VQTIRWLFET
CPMSELAEKQ		GSEVTDPTAK		AEAQSCTWMF		KPQPVDRPVG		SREQHLQVSQ
VPAGERQTDR		HVFETEPLQA		SGRPCGRRPV		RYCSRVEIPS		GQVSRQKEVF
QALEAGKKEE		QEPRVIAGSI		PAGSVHKFTW		LFENCPMGSL		AAESIQGGNL
LEEQPMSPSG		NRMQESQETA		AEGTLRTLHA		TPGILHHGGI		LMEARGPGEL
CLAKYVLSGT		GQGHPYIRKE		ELVSGELPRI		ICQVLRRPDV		DQQGLLVQED
PTGQLQLKPL		RLPTPGSSGN		IEDMDPELQQ		LLACGLGTSV		ARTGLVMQET
EQGLVALTAY		SLQPRLTSKA		SERSSVQLLA		SCIDKGDLSG		LHSLRWEPPA
DPSPVPASEG		AQSLHPTESI		IHVPPLDPSM		GMGHLRASGA		TPCPPQAIGK
AVPLAGEAAA		PAQLQNTEKQ		EDSHSGQKGM		AVLGKSEGAT		TTPPGPGAPD
LLAAMQSLRM		ATAEAQSLHQ		QVLNKHKQGP		TPTATSNPIQ		DGLRKAGATQ
SNIRPGGGSD		PRIPAAPRKV		SREEQALPRG		LPGGWVTIQD		GIYTAHPVRT
FDPPGGVQLS		QREPQSRHRE		TALSVQAPRP		LQGGPGQSTG		PGREEPGGCT
QMAWGPPGKA		MAEVCPGGLQ		AAETTLKTAP		LGRHILASGP		QAAGASPHPH
NAFVPPPPTL		PAAVTGPDFP		AGAHRAEDSI		QQASEPLKDP		LLHSHSSPAG
QRTPGGSQTK		TPKLDPTMPP		KKKPQLPPKP		AHLTQSHPPQ		RLPKPLPLSP
SFSSEVGQRE		HQRGERDTAI		PQPAKVPTTV		DQGHIPLARC		PSGHSQPSLQ
HGLSTTAPRP		TKNQATGSNA		QSSEPPKLNA		LNHDPTSPQW		GPGPSGEQPM
EGSHQGAPES		PDSLQRNQKE		LQGLLNQVQA		LEKEAASSVD		VQALRRLFEA
VPQLGGAAPQ		APAAHQKPEA		SVEQAFGELT		RVSTEVAQLK		EQTLARLLDI
EEAVHKALSS		MSSLQPEASA		RGHFQGPPKD		HSAHKISVTV		SSSARPSGSG
QEVGGQTAVK		NQAKVECHTE		AQSQVKIRNH		TEARGHTAST		APSTRRQETS
REYLCPPRVL		PSSRDSPSSP		TFISIQSATR		KPLETPSFKG		NPDVSVKSTQ
LAQDIGQALL		HQKGVQDKTG		KKDITQCSVQ		PEPAPPSASP		LPRGWQKSVL
ELQTGPGSSQ		HYGAMRTVTE		QYEEVDQFGN		TVLMSSTTVT		EQAEPPRNPG
SHLGLHASPL		LRQFLHSPAG		FSSDLTEAET		VQVSCSYSQP		AAQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3