USP47

білок-кодуючий ген Homo Sapiens

USP47 (англ. Ubiquitin specific peptidase 47) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 375 амінокислот, а молекулярна маса — 157 311[4].

USP47
Ідентифікатори
Символи USP47, TRFP, ubiquitin specific peptidase 47
Зовнішні ІД OMIM: 614460 MGI: 1922246 HomoloGene: 9929 GeneCards: USP47
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001282659
NM_017944
NM_001330208
NM_133758
NM_177249
NM_001357952
RefSeq (білок)
NP_598519
NP_796223
NP_001344881
NP_001390423
Локус (UCSC) Хр. 11: 11.84 – 11.96 Mb Хр. 7: 111.62 – 111.71 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MVPGEENQLVPKEDVFWRCRQNIFDEMKKKFLQIENAAEEPRVLCIIQDT
TNSKTVNERITLNLPASTPVRKLFEDVANKVGYINGTFDLVWGNGINTAD
MAPLDHTSDKSLLDANFEPGKKNFLHLTDKDGEQPQILLEDSSAGEDSVH
DRFIGPLPREGSGGSTSDYVSQSYSYSSILNKSETGYVGLVNQAMTCYLN
SLLQTLFMTPEFRNALYKWEFEESEEDPVTSIPYQLQRLFVLLQTSKKRA
IETTDVTRSFGWDSSEAWQQHDVQELCRVMFDALEQKWKQTEQADLINEL
YQGKLKDYVRCLECGYEGWRIDTYLDIPLVIRPYGSSQAFASVEEALHAF
IQPEILDGPNQYFCERCKKKCDARKGLRFLHFPYLLTLQLKRFDFDYTTM
HRIKLNDRMTFPEELDMSTFIDVEDEKSPQTESCTDSGAENEGSCHSDQM
SNDFSNDDGVDEGICLETNSGTEKISKSGLEKNSLIYELFSVMVHSGSAA
GGHYYACIKSFSDEQWYSFNDQHVSRITQEDIKKTHGGSSGSRGYYSSAF
ASSTNAYMLIYRLKDPARNAKFLEVDEYPEHIKNLVQKERELEEQEKRQR
EIERNTCKIKLFCLHPTKQVMMENKLEVHKDKTLKEAVEMAYKMMDLEEV
IPLDCCRLVKYDEFHDYLERSYEGEEDTPMGLLLGGVKSTYMFDLLLETR
KPDQVFQSYKPGEVMVKVHVVDLKAESVAAPITVRAYLNQTVTEFKQLIS
KAIHLPAETMRIVLERCYNDLRLLSVSSKTLKAEGFFRSNKVFVESSETL
DYQMAFADSHLWKLLDRHANTIRLFVLLPEQSPVSYSKRTAYQKAGGDSG
NVDDDCERVKGPVGSLKSVEAILEESTEKLKSLSLQQQQDGDNGDSSKST
ETSDFENIESPLNERDSSASVDNRELEQHIQTSDPENFQSEERSDSDVNN
DRSTSSVDSDILSSSHSSDTLCNADNAQIPLANGLDSHSITSSRRTKANE
GKKETWDTAEEDSGTDSEYDESGKSRGEMQYMYFKAEPYAADEGSGEGHK
WLMVHVDKRITLAAFKQHLEPFVGVLSSHFKVFRVYASNQEFESVRLNET
LSSFSDDNKITIRLGRALKKGEYRVKVYQLLVNEQEPCKFLLDAVFAKGM
TVRQSKEELIPQLREQCGLELSIDRFRLRKKTWKNPGTVFLDYHIYEEDI
NISSNWEVFLEVLDGVEKMKSMSQLAVLSRRWKPSEMKLDPFQEVVLESS
SVDELREKLSEISGIPLDDIEFAKGRGTFPCDISVLDIHQDLDWNPKVST
LNVWPLYICDDGAVIFYRDKTEELMELTDEQRNELMKKESSRLQKTGHRV
TYSPRKEKALKIYLDGAPNKDLTQD

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

ред.
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
  • Peschiaroli A., Skaar J.R., Pagano M., Melino G. (2010). The ubiquitin-specific protease USP47 is a novel beta-TRCP interactor regulating cell survival. Oncogene. 29: 1384—1393. PMID 19966869 DOI:10.1038/onc.2009.430

Примітки

ред.
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20076 (англ.) . Архів оригіналу за 15 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
  4. UniProt, Q96K76 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

ред.