USP21

USP21 (англ. Ubiquitin specific peptidase 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 565 амінокислот, а молекулярна маса — 62 656.

USP21
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2Y5B, 3I3T, 3MTN
Ідентифікатори
Символи	USP21, USP16, USP23, ubiquitin specific peptidase 21
Зовнішні ІД	OMIM: 604729 MGI: 1353665 HomoloGene: 56572 GeneCards: USP21
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • thiol-dependent deubiquitinase • NEDD8-specific protease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cysteine-type peptidase activity Клітинна компонента • клітинне ядро • клітинна мембрана • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма • компонент клітини Біологічний процес • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • transcription, DNA-templated • neuron projection development • histone deubiquitination • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • protein deubiquitination • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27005	30941
Ensembl	ENSG00000143258	ENSMUSG00000053483
UniProt	Q9UK80	Q9QZL6
RefSeq (мРНК)	NM_001014443 NM_012475 NM_001319848 NM_001319847 NM_016572	NM_013919
RefSeq (білок)	NP_001014443 NP_001306776 NP_001306777 NP_036607	NP_038947
Локус (UCSC)	Хр. 1: 161.16 – 161.17 Mb	Хр. 1: 171.11 – 171.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPQASEHRLG		RTREPPVNIQ		PRVGSKLPFA		PRARSKERRN		PASGPNPMLR
PLPPRPGLPD		ERLKKLELGR		GRTSGPRPRG		PLRADHGVPL		PGSPPPTVAL
PLPSRTNLAR		SKSVSSGDLR		PMGIALGGHR		GTGELGAALS		RLALRPEPPT
LRRSTSLRRL		GGFPGPPTLF		SIRTEPPASH		GSFHMISARS		SEPFYSDDKM
AHHTLLLGSG		HVGLRNLGNT		CFLNAVLQCL		SSTRPLRDFC		LRRDFRQEVP
GGGRAQELTE		AFADVIGALW		HPDSCEAVNP		TRFRAVFQKY		VPSFSGYSQQ
DAQEFLKLLM		ERLHLEINRR		GRRAPPILAN		GPVPSPPRRG		GALLEEPELS
DDDRANLMWK		RYLEREDSKI		VDLFVGQLKS		CLKCQACGYR		STTFEVFCDL
SLPIPKKGFA		GGKVSLRDCF		NLFTKEEELE		SENAPVCDRC		RQKTRSTKKL
TVQRFPRILV		LHLNRFSASR		GSIKKSSVGV		DFPLQRLSLG		DFASDKAGSP
VYQLYALCNH		SGSVHYGHYT		ALCRCQTGWH		VYNDSRVSPV		SENQVASSEG
YVLFYQLMQE		PPRCL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, активаторів, регуляторів хроматину, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Smith T.S., Southan C. (2000). Sequencing, tissue distribution and chromosomal assignment of a novel ubiquitin-specific protease USP23. Biochim. Biophys. Acta. 1490: 184—188. PMID 10786635 DOI:10.1016/S0167-4781(99)00233-X
• Gong L., Kamitani T., Millas S., Yeh E.T.H. (2000). Identification of a novel isopeptidase with dual specificity for ubiquitin- and NEDD8-conjugated proteins. J. Biol. Chem. 275: 14212—14216. PMID 10799498 DOI:10.1074/jbc.275.19.14212
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Garcia-Santisteban I., Banuelos S., Rodriguez J.A. (2012). A global survey of CRM1-dependent nuclear export sequences in the human deubiquitinase family. Biochem. J. 441: 209—217. PMID 21888622 DOI:10.1042/BJ20111300

Див. також

• Хромосома 1